191224 현재 발견된 issue들

[inetidkm]

1. RCSB PDB code를 입력할 때, 알파벳의 경우 소문자로 입력하면 Submit 버튼이 작동하지 않습니다. 대문자로 자동 Convert 해주는 기능이 있으면 좋겠습니다.

2. DNA와 Protein이 같이 존재하는 복합체 (예:1WTQ)의 경우 Protein이 있음에도 불구하고 DNA sequence의 존재로 인하여 Protein만 Rendering된 채로 계산이 수행되지 않는 문제가 있습니다.

3. Domain (PDB 파일 내에서는 Chain으로 칭함)이 여러 개 있는 단백질 (예: 4개의 Domain이 있는 헤모글로빈 1A3N)의 Residual Decomposition을 수행하였을 때, Domain (Chain) A에 해당되는 부분만 Solvation Free Energy의 부호(±)에 따른 색깔 표시가 되는 문제가 있습니다.

[inetidkm]

추가:

4. ProWaVE 공식사이트와 임시사이트의 Solvation Free Energy 계산 결과가 다르게 나옵니다. 아마 다음과 같은 가능성이 있을 지도 모릅니다:
   • 단백질의 기울기가 달라 각 격자가 차지하는 원자의 개수와 종류가 다르다.
   • 전처리 할 때 단백질의 수소 원자가 다른 곳에 추가된다.
   • 백엔드에서 쓰이는 소프트웨어의 버전이 다르다.
   • 그 외?