evolutionaryscale / esm

Other
798 stars 81 forks source link

🙈 Add gitignore file and PDB fix feature #17

Closed Goosang-Yu closed 5 days ago

Goosang-Yu commented 5 days ago

I have added a list to ignore basic Python temporary files in Git for more convenient work.

Goosang-Yu commented 5 days ago

또한 PDB에서 구조 파일을 불러올 때, missing residue를 채우는 기능을 옵션으로 추가해주었습니다. 이 기능을 위해 dependency로 openmm과 PDBfixer를 사용하였습니다.

예시: "8G1I"

1. Fixer를 사용하지 않는 경우 (original code)