fanxiaoyu0 / Uni-Mol

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结果文件的解读 #3

Open Golden-proteogenomics opened 1 week ago

Golden-proteogenomics commented 1 week ago

您好: 很感谢您的代码,相对于unimol的(https://github.com/dptech-corp/Uni-Mol)安装,您的代码安装更具有逻辑性和可重复性,对我的帮助很大。但是有一个问题,就是在您代码的结果文件中(result文件中的输出),有点困惑为啥不输出test的预测打分的呢?而是以一行的形式展开,是有特殊的意义吗

fanxiaoyu0 commented 6 days ago

很高兴能得到你的认可。result 文件夹下的 invalid_smiles.txt 文件存放的是在预处理 smiles 的过程中,不能被 rdkit 处理的 smiles,如果你想得到测试集的 RMSE 等预测精度,可以运行代码中的 test() 函数: image

Golden-proteogenomics commented 5 days ago

感谢你的回复。我可以按照您说的将其预测看到rmse。 图片 。但是我还想看具体的,就是具体哪些smiles实现的回归预测,我还是没有太理清楚,我也尝试将更改text函数的代码将smile,预测值输出,但是一直没成功。所以方便的话,可以稍微帮忙改一下代码将其写出到文件的吗?

再次感谢!