Vegetatieopname - Githubissues

laurenssparrius commented 7 months ago

Mogelijkheid om een vegetatieopname te maken met verschillende schalen.

VA: nieuw intern protocollen voor vegetatieopname

Vera: nieuw formulier. Hiertoe kopie maken van de Nectarindex (kenmerk van vegetatieopname is dat elke soort maar één keer wordt ingevoerd en dat de abundantie achteraf gemakkelijk kan worden aangepast)

Soortgroepen: vaatplanten, mossen, korstmossen en algen door elkaar heen in te voeren

Abundantieschalen (vooraf in het formulier eenmalig vast te leggen en niet meer te veranderen):

Tansley
Tansley decimaal
Braun-Blanquet (B,D,S)

Aanvullende kopgegevens: suggesties voor veldnamen staan hier: https://woordenboekbeheer.ndff.nl/codes.php?identity=http://ndff-ecogrid.nl/codes/keys/group/vegetation

(1) Locatietype (2) Coordinaat Startpunt (x, y) RD in meters (3) Coordinaat Eindpunt (x, y) RD in meters (4) Lengte in m standaard 2 (5) Breedte in m standaard 2 (6) Opnamenummer (7) Gebiedsnaam (8) Habitat (IPI, zoals bij waarnemingen) (9) Bedekking totaal (%) (10) strooisellaag % (11) Bedekking boomlaag (%) (12) Bedekking struiklaag (%) (13) Bedekking kruidlaag (%) (14) Bedekking moslaag (%) (15) Hoogte boomlaag (m) (16) Hoogte struiklaag (m) (17) Hoogte kruidlaag (cm) (18) Bedekking onderwaterplanten (%) (19) Bedekking in de bodem wortelende drijfbladplanten (%) (20) Bedekking kroos (%) (21) Bedekking draadalg (%) (22) Bedekking emergenten (%) (23) Dichtheid oevervegetatie (%) (24) Percentage houtig (%) (25) Percentage beschaduwd (%) (26) Breedte oeverzone (m) (27) Breedte waterzone (m) (28) Mos/korstmos meegenomen : 0 = geen mossen en korstmossen opgenomen 1 = mossen én korstmossen opgenomen 2 = mossen opgenomen 3 = korstmossen opgenomen 4 = mossen en/of korstmossen onvolledig opgenomen (29) Beheer: 01 = niets doen 02 = begrazing 03 = begrazing door runderen en paarden 04 = begrazing door schapen 05 = hakhout- en griendbeheer 06 = maaibeheer 07 = bemesting 08 = slootschoning (jaarlijks) 09 = onbekend

Desharin commented 7 months ago

Heb je liever locatietype, startpunt, beginpunt apart, of zou je liever een WKT aangeleverd krijgen? Dus bijvoorbeeld POINT(123456 456789) of LINESTRING(123456 456789, 123489, 456710)

laurenssparrius commented 6 months ago

Je mag het combineren in een POINT of LINESTRING. Uiteindelijk krijgen de waarnemingen ook die geometrie mee. Het is wel belangrijk dat de eindpunt-coordinaten optioneel zijn. Als er alleen een startpunt is, dan wordt de geometrie POINT, anders LINESTRING (met twee punten).

Desharin commented 6 months ago

Welke namen moeten deze velden hebben voor de Verspreidingsatlas API?

laurenssparrius commented 6 months ago

(1) WKT location: wkt *

(4) Lengte in m standaard 2 plot_length (5) Breedte in m standaard 2 plot_width (6) Opnamenummer plotnr (7) Gebiedsnaam locationname (8) Habitat (IPI, zoals habitat bij waarnemingen voor vaatplanten) habitat (9) Bedekking totaal (%) cover_total (10) strooisellaag % cover_litter (11) Bedekking boomlaag (%) cover_treelayer (12) Bedekking struiklaag (%) cover_shrublayer (13) Bedekking kruidlaag (%) cover_herblayer (14) Bedekking moslaag (%) cover_mosslayer (15) Hoogte boomlaag (m) height_treelayer_high (16) Hoogte struiklaag (m) height_shrublayer_low (17) Hoogte kruidlaag (cm) height_herblayer_low (18) Bedekking onderwaterplanten (%) cover_submerged_vegetation (19) Bedekking in de bodem wortelende drijfbladplanten (%) cover_floating_vegetation (20) Bedekking kroos (%) cover_duckweed (21) Bedekking draadalg (%) cover_algae (22) Bedekking emergenten (%) cover_emergent (23) Dichtheid oevervegetatie (%) plot_percentage_bank_vegetation (24) Percentage houtig (%) waterbody_percentage_wooded (25) Percentage beschaduwd (%) waterbody_shading (26) Breedte oeverzone (m) waterbody_bank_width (27) Breedte waterzone (m) waterbody_width (28) Mos/korstmos meegenomen mosslayer_info : 0 = geen mossen en korstmossen opgenomen 1 = mossen én korstmossen opgenomen 2 = mossen opgenomen 3 = korstmossen opgenomen 4 = mossen en/of korstmossen onvolledig opgenomen (29) Beheer management : 01 = niets doen 02 = begrazing 03 = begrazing door runderen en paarden 04 = begrazing door schapen 05 = hakhout- en griendbeheer 06 = maaibeheer 07 = bemesting 08 = slootschoning (jaarlijks) 09 = onbekend *

(nog) niet in NDFF Woordenboek

Desharin commented 6 months ago

Ik heb hier een test van klaarstaan, is de API klaar om die te ontvangen?

Desharin commented 6 months ago

Oh wat bedoelde je trouwens met algen? Ik heb nu wieren gedaan.

laurenssparrius commented 6 months ago

Inderdaad: wieren / soortgroep W

laurenssparrius commented 6 months ago

De API is nog niet helemaal klaar om alle kopgegevens op te slaan, maar je kunt wel al testen. De soortenlijst zou gewoon ingelezen moeten worden. Het helpt mij ook om een upload klaar te hebben staan die ik kan gebruiken om te testen.

Desharin commented 6 months ago

Ok, ik heb er een geupload

laurenssparrius commented 6 months ago

Er komt een foutmelding op deze uri: http://ndff-ecogrid.nl/codes/abundance/cover/tansley/- die in de test in de tweede waarneming zat.

Het liggende streepje is bij jou een ander teken (dat er erg op lijkt UTF ASC 226 128 147). Als je het eindstreepje uit de uri hierboven kopieert, dan heb je de juiste te pakken (ASC 45). Als je de abundantiecodes automatisch ophaalt en niet in de code hebt staan, dan moet ik het mogelijk op een andere manier oplossen.

Desharin commented 6 months ago

Hey das een grappige, ik stuur zo een nieuwe poging. Blijkbaar staat ie verkeerd hier: https://woordenboek.ndff.nl/codes.php?showparents=1&identity=http://ndff-ecogrid.nl/codes/abundance/cover/tansley/%E2%80%93

laurenssparrius commented 6 months ago

OK, dan moeten we dat misschien maar zo laten, en de code aanpassen in de VA

laurenssparrius commented 6 months ago

Nog een wens: zou je de nieuwe velden in een aparte categorie 'formattributes' willen zetten. Dus message -> forms -> formattributes -> plot-length. Dat maakt het eenvoudiger om het later uit te breiden en op te slaan.

laurenssparrius commented 6 months ago

De rest van de test is geslaagd en het laadscript aangepast. Dus staat nog open voor jou:

nieuwe velden in JSON output in aparte subcategorie 'formattributes'
code voor Tansley '-' zo laten, dus http://ndff-ecogrid.nl/codes/abundance/cover/tansley/%E2%80%93
mocht je in de Braun-Blanquet schaal een abundantiecode '0' hebben, dan die graag weglaten (wordt niet gebruikt)

Desharin commented 5 months ago

Top, ik heb weer een nieuwe test gestuurd.

Desharin commented 5 months ago

Als deze goed wil ik de app wel naar onze toestellen uitrollen voor een interne test

laurenssparrius commented 5 months ago

Ja, prima! De laatste upload van een vegetatieopname werkte goed de opname komt ook goed door in de andere onderdelen van de NDFF

laurenssparrius commented 5 months ago

Ik heb deze nu uitgerold naar de Open test. Kijken of het vandaag nog lukt om deze beoordeeld te krijgen

laurenssparrius commented 5 months ago

Paar details:

Wanneer in de lijstweergave van een Braun-Blanquet opname abundantie '+' is gekozen, dan werkt de plus-knop niet. Zou naar 1 moeten gaan.
Idem, Wanneer deze op 1 staat, werkt de min-knop niet. Zou naar + moeten gaan.
Scherm nieuw formulier: lijst met formuliertypen -> Stoepplantjes verwijderen
Scherm nieuw formulier: lijst met formuliertypen -> Braun/Blanquet (B,D,S) -> Braun-Blanquet
Standaardwaarde voor Lengte (m) en Breedte (m) toch maar weghalen (was 2)

Desharin commented 5 months ago

Wanneer in de lijstweergave van een Braun-Blanquet opname abundantie '+' is gekozen, dan werkt de plus-knop niet. Zou naar 1 moeten gaan.

Oh ja, dat komt natuurlijk omdat ie die 0 ertussenuit heb gesloopt, ik ga het fixen

Desharin commented 5 months ago

@laurenssparrius Als je tevreden bent met deze versie kunnen we 'm wat mij betreft uitrollen naar productie.

laurenssparrius commented 5 months ago

Zou je dit nog willen aanpassen: Braun/Blanquet -> Braun-Blanquet
Dan is het goed en kan het in productie.

floronnl / VERA-issues

Vegetatieopname #90