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fphans / BIDS-NGS

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DEG analysis #3

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jessvasseur commented 3 years ago

Aufgabe: führen Sie die eigentliche differentielle Expressionsanalyse mit DESeq2 durch; folgen Sie den Schritten in der DESeq2-Vignette; verwenden Sie den "Wald"-Test und fitType "mean"; verwenden Sie auch die Funktion lfcShrink mit Typ "apeglm" für genauere log fold-change (logFC, LFC) Werte