Zkouška mtDNA pipeline - Githubissues

fulopjoz / aDNA_amtDB_AADR

1 stars 0 forks source link

Zkouška mtDNA pipeline #1

Open EdaEhler opened 3 months ago

EdaEhler commented 3 months ago

Zkusit vzorek AED_106 (https://amtdb.org/sample/AED_106) prohnat pipelinou a porovnat výslednou mtDNA sekvenci s tím, co máme v databázi. Raw data vzorku: https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/SAMEA104354379?show=reads

EdaEhler commented 3 months ago

Referenční mtDNA (rcrs.fa) na kterou mapovat: https://www.mitomap.org/MITOMAP/HumanMitoSeq