gbif-norway / helpdesk

Please submit your helpdesk request here (or send an email to helpdesk@gbif.no). We will also use this repo for documentation of node helpdesk cases.
GNU General Public License v3.0
3 stars 0 forks source link

Dataset from Miljølære.no to the node IPT #177

Open dagendresen opened 2 months ago

dagendresen commented 2 months ago

Miljølære.no

Skolelaboratoriet i realfag at the University of Bergen maintains Miljølære.no (including Miljolare.no, Lepidoptera.no, and Fuglevennen.no). Miljølære has been published inside a bulk dataset from Artsdatabanen in «Norwegian Biodiversity Information Centre - Other datasets». See also: https://github.com/gbif-norway/helpdesk/issues/6

They want to move their datasets to be published on the node IPT to improve their visibility profile and to attach references and improved image metadata.

They ask to be registered as an individual new data publishing institution. We might prefer to recommend that they use UiB as the publishing institution. Because UiB has a ROR ID and a project is not an institution. And look for other options to help improving their visibility in Artskart and GBIF using a project ID. Maybe consider using a "Hosted Portal"?

dagendresen commented 2 months ago

Hei! Jeg jobber på Skolelaboratoriet i realfag ved Universitetet i Bergen. Vi står bak Miljølære.no (som inkluderer Miljolare.no, Lepidoptera.no og Fuglevennen.no) hvor skoler og privatpersoner kan registrere observasjoner av arter. Vi har siden 2009 eksportert observasjoner til Artskart via Artsdatabankens egenutviklede programvare. Vi ønsker nå å gå over til å bruke GBIF IPT, som også Artsdatabanken har anbefalt oss å gjøre. Med GBIF IPT vil vi også kunne få med referanser til bilder samt mer utfyllende data om hvert funn.

For å aktivere vår IPT instans trenger vi å registreres som en organisasjon. I Artskart er Miljølære.no en egen institusjon, selv om vi rent organisatorisk tilhører Universitetet i Bergen. Dette er gjort for å kunne skille funn fra Museet ved UiB og Miljølære i Artskart. Vi mener det er hensiktsmessig å opprettholde dette skillet også i GBIF og jeg ser at andre lignende nettverk som Observation.org iNaturalist.org også er registrert som organisasjoner i GBIF.

Vi ber derfor om å bli registrert som organisasjon og i IPT ser vi at følgende informasjon skal sendes noden som godkjenner organisasjonen:

Full name of our organization: Miljølære.no

technical contact first name: Odd Johan technical contact last name: Berland technical contact email: drift@skolelab.uib.no

administrative contact first name: Olaug administrative contact last name: Vetti Kvam administrative contact email: post@skolelab.uib.no

Det er i øyeblikket 1,7 M funn fra Miljølære.no i Artskart og over 1 M av disse stammer fra den årlige Hagefugltellingen som vi har sammen med BirdLife Norge. Artsdatabanken har tidligere eksportert funn fra Miljølære videre til GBIF i datasettet «Norwegian Biodiversity Information Centre - Other datasets» men av ukjent grunn er ikke Miljølære lengre med der. Det bør derfor ikke være en umiddelbar fare for dobbeltregisteringer i GBIF. https://www.gbif.org/dataset/492d63a8-4978-4bc7-acd8-7d0e3ac0e744

Vennlig hilsen Odd Johan Berland Skolelaboratoriet i realfag Universitetet i Bergen

dagendresen commented 2 months ago

Hei Odd Johan,

Takk for forespørsel om å bli registrert som organisasjon i GBIF og publisere data via vår IPT. Du kan sjekke siden på linken under, der du også kan registrere organisasjonen. Deretter blir dere godkjent av vår GBIF-node. Da kan vi registrere dere som "publisher" i vår IPT.

https://www.gbif.org/become-a-publisher

Vi er også behjelpelige med å formatere dataene i en Darwin core standard.

Hilsen Vidar Bakken

dagendresen commented 2 months ago

Hei Odd Johan,

Vi har lenge notert oss gode artsdata fra Miljølære og Skolelaboratoriet ved UiB, og et veldig fint program for formidling av og å øke artskunnskap i grunnskolen og videregående skoler! GBIF-noden ønsker selvsagt å støtte og bidra til dette programmet.

Det er normalt at datasett som publiseres i GBIF knyttes til en institusjon som anerkjennes som "data publisher". Dersom dere er tilknyttet UiB vil jeg egentlig anbefale å benytte UiB som publiserende institusjon. UiB er registrert i ROR (Research Organisation Registry) som også benyttes for å koble andre forskningsprodukter slik som artikler i vitenskapelige tidsskrift. Jeg anbefaler derfor egentlig at vi forsøker å finne andre måter å profilere datasettene fra Miljølære. Men vurderer å beholde koblingen til UiB?

https://www.gbif.org/publisher/3f3967bf-ecc7-4455-ba89-4e0ab6d6fd3c https://www.gbif.org/dataset/search?publishing_org=3f3967bf-ecc7-4455-ba89-4e0ab6d6fd3c

Dersom dere for eksempel publiserer artsdata for (1) Miljolare.no, (2) Lepidoptera.no og (3) Fuglevennen.no som tre ulike datasett, så kan vi jo benytte den samme logo for Miljølære for alle - og finne andre måter å profilere at disse hører inn under det samme prosjektet?

Det er også mulig å knytte sammen datasett fra samme prosjekt: https://ipt.gbif.org/manual/en/ipt/latest/manage-resources#project-data

Slike prosjekt har per idag fortsatt noe mindre synlighet i GBIF enn det vi og mange andre i GBIF nettverket ønsker. Bedre synlighet for prosjekt og data knyttet til prosjekt har lenge vært et prioritert ønske fra både Norge og flere andre medlemsland. Vi håper og forventer at løsninger for bedre visning av prosjekt og datasett under slike prosjekt vil komme. GBIF sekretariatet har foreløpig laget prosjektsider for et utvalg prosjekter (de som er direkte finansiert fra GBIF). Vi håper og forventer at vi etterhvert kan lage tilsvarende løsninger også for flere prosjekt - inkludert for Miljølære.

Eksempel på prosjektsider - foreløpig kun for GBIF-finansierte prosjekt: https://www.gbif.org/project/CESP2023-007/gbif-in-central-asia-new-aspects-of-development https://www.gbif.org/project/CESP2023-007/gbif-in-central-asia-new-aspects-of-development#datasets

Dersom det er viktig for Miljølære å registreres som en egen institusjon så er det ikke umulig. Som eksempel valgte prosjektet Arven etter Nansen (Nansen Legacy) tilsvarende å registrere seg som en egen datapubliserende institusjon i 2022.

https://www.gbif.org/publisher/028abbad-5db9-48a3-98dd-9ee456b60f0d https://arvenetternansen.com/our-consortium/

GBIF-noden ønsker som nevnt Miljølære meget velkommen til å publisere egne datasett direkte til GBIF fra vår IPT (integrated data publishing toolkit)! Dere kan få brukerkonto og full tilgang til å administrere egne datasett - eller selvsagt få hjelp og support med datapublisering fra GBIF-noden.

https://ipt.gbif.no/ https://ipt.gbif.org/manual/en/ipt/latest/

Dersom dere velger å registreres som ny datapubliserende institusjon vil første steg, som Vidar skrev, være å fylle i skjemaet lenket under.

https://www.gbif.org/become-a-publisher

Med vennlig hilsen Dag Endresen for GBIF Norge

dagendresen commented 2 months ago

See also the current functionality for presenting projects in GBIF: https://www.gbif.org/resource/search?contentType=project

It could be possible for GBIF to create a project catalog/portal similar to the GRSciColl for collections. And ask Nodes and others to collaboratively maintain the project description here.

https://registry.gbif.org/collection/search --> https://registry.gbif.org/project/search

Projects can currently also be added to the EML metadata for datasets. As eg. done for the Nansen Legacy datasets. And the GBIF API has current functionality to search for and find datasets under such projects. However, there is currently no functionality in the GBIF portal to present such projects.

https://api.gbif.org/v1/dataset/search?projectid=AeN https://www.gbif.org/dataset/search?project_id=AeN

Maybe useful to use a "Hosted Portal" to build such project visibility? https://www.gbif.org/hosted-portals

There is also a thread for tagging records with projectIDs across datasets https://github.com/gbif/pipelines/issues/836