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gbif / portal-feedback

User feedback for the GBIF API, website and published data. You can ask questions here. 🗨❓
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Coordinate precision invalid for all records #1440

Open gbif-portal opened 6 years ago

gbif-portal commented 6 years ago

Coordinate precision invalid for all records

The maps shows clearly that the data in this dataset is gridded, but the precision level is being lost because of incorrect values under 'coordinate precision', e.g. '>20km', as seen in the verbatim records. A similar issue seems to affect several other datasets from this publisher.

User provided contact info: @timhirsch System: Chrome 67.0.3396 / Mac OS X 10.13.5 User: See in registry Referer: https://www.gbif.org/dataset/836149af-e7b0-4fc7-b6d9-4d56c28bad43 Window size: width 1878 - height 868 API log&_a=(columns:!(_source),index:'prod-varnish-',interval:auto,query:(query_string:(analyze_wildcard:!t,query:'response:%3E499')),sort:!('@timestamp',desc))) Site log&_a=(columns:!(_source),index:'prod-portal-',interval:auto,query:(query_string:(analyze_wildcard:!t,query:'response:%3E499')),sort:!('@timestamp',desc))) System health at time of feedback: CRITICAL

ManonGros commented 6 years ago

The publisher has been notified about the 38 datasets concerned: Inventaire National du Patrimoine Naturel : Flore Franco-Belge Inventaire National du Patrimoine Naturel : Oiseaux hivernants de France Inventaire National du Patrimoine Naturel : Flore d'Ille-et-Vilaine Inventaire National du Patrimoine Naturel : Flore du Massif Armoricain Inventaire National du Patrimoine Naturel : Oiseaux nicheurs de France Inventaire National du Patrimoine Naturel : Données ONEMA sur les poissons et écrevisses d'eau douce. Inventaire National du Patrimoine Naturel : Flore du Limousin Inventaire National du Patrimoine Naturel : Mammifères de France Inventaire National du Patrimoine Naturel : Enquête carnivores Inventaire National du Patrimoine Naturel : Poissons d'eau douce de France Inventaire National du Patrimoine Naturel : Fichier communal des ongulés Inventaire National du Patrimoine Naturel : Atlas des poissons d'eau douce de France métropolitaine (2011) Inventaire National du Patrimoine Naturel : Insectes Orthoptères de France Inventaire National du Patrimoine Naturel : Amphibiens et Reptiles de France (Enquête 1) Inventaire National du Patrimoine Naturel : Insectes Coléoptères Scarabéidés Laparostici de France Inventaire National du Patrimoine Naturel : Loup en France Inventaire National du Patrimoine Naturel : Données des campagnes de Suivi Aérien de la Mégafaune Marine (SAMM) de France métropolitaine Inventaire National du Patrimoine Naturel : Crustacés Décapodes de France Inventaire National du Patrimoine Naturel : Données Benthos du Réseau des Stations et Observatoires Marins Inventaire National du Patrimoine Naturel : Insectes Hétéroptères Mirides de France Inventaire National du Patrimoine Naturel : Insectes Coléoptères Saproxylophages de France Inventaire National du Patrimoine Naturel : Programme CARTHAM: Inventaire biologique dans le cadre de Natura 2000 en Mer Inventaire National du Patrimoine Naturel : Flore de l'Ain Inventaire National du Patrimoine Naturel : Flore de Sologne Inventaire National du Patrimoine Naturel : Atlas de la flore de Lorraine Inventaire National du Patrimoine Naturel : Espèces Végétales Menacées de France métropolitaine Inventaire National du Patrimoine Naturel : Flore protégée du Dauphiné Inventaire National du Patrimoine Naturel : Inventaire du Parc national du Mercantour Inventaire National du Patrimoine Naturel : CBN du Massif Central Inventaire National du Patrimoine Naturel : CBN Méditerranéen de Porquerolles Inventaire National du Patrimoine Naturel : CBN de Midi-Pyrénées Inventaire National du Patrimoine Naturel : CBN Alpin de Gap Inventaire National du Patrimoine Naturel : Programme national espèces végétales de la Directive Habitat Inventaire National du Patrimoine Naturel : CBN Brest Inventaire National du Patrimoine Naturel : CBN Bailleul Inventaire National du Patrimoine Naturel : CBN Aquitaine-Poitou-Charentes Inventaire National du Patrimoine Naturel : Observations d'hippocampes et syngnathes de France métropolitaine: Programme Hippo-ATLAS Inventaire National du Patrimoine Naturel : Données sur Tamias sibiricus (Ecureuil de Corée)

ManonGros commented 4 years ago

the dataset were republished with a correct coordinate uncertainty. See this example: https://www.gbif.org/occurrence/2487117958

tucotuco commented 4 years ago

I'm sorry to say that the coordinateUncertaintyInMeters for this and any other 10 km grid is definitely NOT correct. The best it could be is about 7km, and that is if the datum were known and the coordinates were given for the center of the grid cell (which is usually not the case). The uncertainty is likely to be closer to 15 km.

On Tue, Oct 6, 2020 at 8:58 AM Marie Grosjean notifications@github.com wrote:

Closed #1440 https://github.com/gbif/portal-feedback/issues/1440.

— You are receiving this because you are subscribed to this thread. Reply to this email directly, view it on GitHub https://github.com/gbif/portal-feedback/issues/1440#event-3845015715, or unsubscribe https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AADQ72245WM2LOHEDAQXGMTSJMA6RANCNFSM4FIYDVXA .

ManonGros commented 4 years ago

Thanks @tucotuco for checking! I will contact GBIF France to let them know.

ManonGros commented 3 years ago

notified GBIF France

jhnwllr commented 3 years ago

https://registry.gbif.org/dataset/85a97a5f-751a-49ca-ad7d-238a80c0d30c/machineTag

This dataset does have a gridded dataset machine tag FYI. We were planning to email all the gridded datasets that do not fill in a coordinate uncertainty, footprintWKT, or coordinate precision. There were like 50 of them in this category.

https://github.com/gbif/portal-feedback/issues/2872

ahahn-gbif commented 3 years ago

also see the discussion at https://github.com/gbif/pipelines/issues/451