Open gmgitx opened 5 years ago
Yes，我就是工程师口中的General computer。
Java Conda BigDataScript Pipeline Dependencies Genome data
:sweat_smile:解压之后是隐藏文件以为没解压
Add export PATH=$PATH:$HOME/.bds to your $HOME/.bashrc.
这里， :confused:这行代码的加入位置？ :confused:这个加法和通常也不太一样？
bash install_dependencies.sh #坐等。紧张，饥饿。泡一杯燕麦，嘴上悠悠的喝，内心绷紧的等。:neutral_face::neutral_face::neutral_face: #终于，恭喜我：
bash install_dependencies.sh
... == Installing dependencies has been successfully done. ==
... Creating species file... (/.../.../.../.../hg19db1/bds_atac_species.conf) === Genome data (hg19) has been successfully installed. ===
########################### ### 先试一个样本的 bds atac.bds -species hg19 -nth [NUM_THREADS] -fastq1_1 [READ1] -fastq1_2 [READ2]
bds atac.bds -species hg19 -nth [NUM_THREADS] -fastq1_1 [READ1] -fastq1_2 [READ2]
前沿pipeline的旧doc
gmgitx
commented
5 years ago gmgitx
commented
5 years ago
Yes，我就是工程师口中的General computer。
#########################下面一一进行，#############
- Java, Conda不必
- BigDataScript
:sweat_smile:解压之后是隐藏文件以为没解压
这里， :confused:这行代码的加入位置？ :confused:这个加法和通常也不太一样？
- Dependencies
bash install_dependencies.sh#坐等。紧张，饥饿。泡一杯燕麦，嘴上悠悠的喝，内心绷紧的等。:neutral_face::neutral_face::neutral_face: #终于，恭喜我：- Genome data
########################### ### 先试一个样本的
bds atac.bds -species hg19 -nth [NUM_THREADS] -fastq1_1 [READ1] -fastq1_2 [READ2]