Open kcertuche opened 5 months ago
podrías compartir la linea de comando que estas utilizando?
module purge module load apps/stacks/2.66
populations -P /homes/orionsan/jcertuchec/GenEvoKcc/stacks/02_stacks -O /homes/orionsan/jcertuchec/GenEvoKcc/stacks/02_stacks/populations1 -M /homes/orionsan/jcertuchec/GenEvoKcc/stacks/PoblacionesmapaKcc -r 0.8 -R 0.8 -P 2 -t 2 --min-mac 2 --max-obs-het 0.5 --write-random-snp --fstats --vcf --structure --plink
los únicos resultados que generar en el archivo out
Parsing population map... The population map contained 10 samples, 2 population(s), 1 group(s). Failed to open gzipped file '2/catalog.fa.gz': No such file or directory.
¿tienes alguna info en el archivo populations1.err
?
tu hice gstacks antes? pq de acuerdo con el error, los archivos de gstacks no estan presentes.
tu hice gstacks antes? pq de acuerdo con el error, los archivos de gstacks no estan presentes.
Lo volví a correr y sale todo de gstacks ok y de nuevo someto populations y sigue saliendo el mismo error que falta esos archivos, verifico de nuevo y están todos los insumos que requiere ese paso.
¿tienes alguna info en el archivo
populations1.err
?
si, solo sale lo siguiente: Failed to open gzipped file '2/catalog.fa.gz': No such file or directory.
Estan todos los archivos en la misma carpeta?
hola, hice cambios en el nano y ya logré conseguir los resultados para las dos carpetas de populations. muchas gracias por la ayuda feliz tarde
Estan todos los archivos en la misma carpeta?
si, parece que el error estaba en la parte final del nano para cada ejercicio
gracias por la ayuda
saludos, en el ultimo paso para populations 1 me sale el siguiente error. ¿alguna idea de como se pueda solucionar? a alguien mas le pasó?
Failed to open gzipped file '2/catalog.fa.gz': No such file or directory.