Datos Erróneos en Pares Terciarios

[Nahuele]

Los datos terciarios salian de las ultimas 3 columnas en la tabla de maximos

Por ejemplo el cluster "3vdm"

Segun la tabla de maximos, los codigos_cadenas son:

... 4f9f_A ; 3t5t_A ;...

Sin embargo en el cluster figura (3vdm, 3t5t)

Corregir el campo Maximum Tertiary Pair Con el formato codigo_cadena

[gstn-caruso]

Ese dato lo estoy sacando de acá: https://github.com/gstn-caruso/codnasq/blob/master/app/controllers/cluster_controller.rb#L3 Es decir, estoy agarrando todos los pares, los ordeno por RMSD y elijo el primero https://github.com/gstn-caruso/codnasq/blob/21e8b49e561a6f51e433e88e39dd4b5247375d7e/app/models/cluster.rb#L5

[NPalopoli]

@Nahuele de donde estás leyendo estos valores?

Quiero leer los siguientes campos de la tabla cuaternaria:

Cluster ID;Oligomeric State;PDB ID query;Biological Assembly query;PDB ID target;Biological Assembly target;RMSD

Ejecuto este comando para levantar los valores. Los valores que usa Gastón están correctos (ver segunda y quinta líneas del output):

grep 3vdm "website/DB-Q|05-07-19-15:50.csv" | cut -d';' -f1-6,16

3vdm;2;3vdm;2;3vdn;1;0.47
3vdm;2;3vdm;2;4f9f;3;0.93
3vdm;2;3vdm;2;3t7d;1;1.26
3vdm;2;3vdm;2;4f96;1;0.32
3vdm;2;3vdm;2;3t5t;1;1.98
3vdm;2;3vdm;2;4f97;1;0.50
3vdm;2;3vdn;1;4f9f;3;0.91
3vdm;2;3vdn;1;3t7d;1;1.19
3vdm;2;3vdn;1;4f96;1;0.32
3vdm;2;3vdn;1;3t5t;1;1.52
3vdm;2;3vdn;1;4f97;1;0.44
3vdm;2;4f9f;3;3t7d;1;1.02
3vdm;2;4f9f;3;4f96;1;0.85
3vdm;2;4f9f;3;3t5t;1;1.34
3vdm;2;4f9f;3;4f97;1;0.96
3vdm;2;3t7d;1;4f96;1;1.21
3vdm;2;3t7d;1;3t5t;1;0.80
3vdm;2;3t7d;1;4f97;1;1.18
3vdm;2;4f96;1;3t5t;1;1.66
3vdm;2;4f96;1;4f97;1;0.26
3vdm;2;3t5t;1;4f97;1;1.43

Es posible que hayas visto mal los números Nahue, o se me escapa algo?

[Nahuele]

mmm no sé si entendí, quizás podemos hacer una llamada para esto.

Pero el cluster 3vdm tiene estos maximos terciarios: 4f9f_A y 3t5t_A

[Nahuele]

@Nahuele de donde estás leyendo estos valores?

Quiero leer los siguientes campos de la tabla cuaternaria:

Cluster ID;Oligomeric State;PDB ID query;Biological Assembly query;PDB ID target;Biological Assembly target;RMSD

Ejecuto este comando para levantar los valores. Los valores que usa Gastón están correctos (ver segunda y quinta líneas del output):

grep 3vdm "website/DB-Q|05-07-19-15:50.csv" | cut -d';' -f1-6,16

3vdm;2;3vdm;2;3vdn;1;0.47
3vdm;2;3vdm;2;4f9f;3;0.93
3vdm;2;3vdm;2;3t7d;1;1.26
3vdm;2;3vdm;2;4f96;1;0.32
3vdm;2;3vdm;2;3t5t;1;1.98
3vdm;2;3vdm;2;4f97;1;0.50
3vdm;2;3vdn;1;4f9f;3;0.91
3vdm;2;3vdn;1;3t7d;1;1.19
3vdm;2;3vdn;1;4f96;1;0.32
3vdm;2;3vdn;1;3t5t;1;1.52
3vdm;2;3vdn;1;4f97;1;0.44
3vdm;2;4f9f;3;3t7d;1;1.02
3vdm;2;4f9f;3;4f96;1;0.85
3vdm;2;4f9f;3;3t5t;1;1.34
3vdm;2;4f9f;3;4f97;1;0.96
3vdm;2;3t7d;1;4f96;1;1.21
3vdm;2;3t7d;1;3t5t;1;0.80
3vdm;2;3t7d;1;4f97;1;1.18
3vdm;2;4f96;1;3t5t;1;1.66
3vdm;2;4f96;1;4f97;1;0.26
3vdm;2;3t5t;1;4f97;1;1.43

Es posible que hayas visto mal los números Nahue, o se me escapa algo?

Es que esa es la tabla de Quaternarios, no podes leer los datos terciarios de esa

[Nahuele]

fixed