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gstn-caruso / codnasq

Conformational diversity of Native State database Quaternary
https://codnasq.herokuapp.com/
GNU General Public License v3.0
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Add maxRMSD quaternary #72

Closed Nahuele closed 4 years ago

Nahuele commented 4 years ago

agregar el valor del maxRMSD cuaternario a los clusters, así se puede ver en la vista de cluster y también en la vista de las tarjetas de la busqueda avanzada

gstn-caruso commented 4 years ago

Una pregunta, todos estos son los documentos que veo compartidos, ¿de dónde puedo obtener este dato?

image

Nahuele commented 4 years ago

Los datos de los maximos RMSD se podian obtener de dos formas:

1) Explorando todas las comparaciones de a pares de los conformeros dentro del cluster deseado y seleccionar la fila que tenga el RMSD mas alto, y de ahi sacar todos los datos (pdb1, pdb2, ligandos1,ligandos2, estadisticas de la comparacion -ver imagen de wsp-)

2) O directamente usar la tabla de los maximos que esta en la carpeta maximosRMSD , el archivo maxRMSD-Q|05-07-19-15:53.tar.gz que ya agrege incluso el maxRMSD terciario, pdb1 y pdb2 terciario al final de las columnas