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haozheng-sjtu / 3d-airway-segmentation

3D airway segmentation method
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树形结构 #8

Open lgq-garbage opened 1 year ago

lgq-garbage commented 1 year ago

您好，我看在您的tree_parse代码中，有做中心线树形结构重建的步骤。一般来说，骨架化提取中心线会带来很多成环的情况，我也用您的代码发现有一部分的拓扑结构误差，请问您后续有做更进一步的处理吗

haozheng-sjtu commented 1 year ago

你的数据上环很多嘛，很少的话影响不大，我遇到的基本都是表面凹陷带来的环，这种发生在粗气管上就比较好处理，你遇到的有哪些情况呀

发件人: "junweiYu" @.> 收件人: "haozheng-sjtu/3d-airway-segmentation" @.> 抄送: "Subscribed" @.***> 发送时间: 星期五, 2022年 11 月 18日 下午 2:02:01 主题: [haozheng-sjtu/3d-airway-segmentation] 树形结构 (Issue #8)

您好，我看在您的tree_parse代码中，有做中心线树形结构重建的步骤。一般来说，骨架化提取中心线会带来很多成环的情况，我也用您的代码发现有一部分的拓扑结构误差，请问您后续有做更进一步的处理吗

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lgq-garbage commented 9 months ago

细化的方法一般会在凹进去或者凸出来一小块的地方提取出毛刺，在深度学习提取出有粘连的情况会成环 我遇到的就是这两种情况 第一种情况在粗分支有发生，第二种情况在中细分支发生 分割出来的气管有粘连感觉会是一个好方向，向你文章中说的梯度腐蚀或者膨胀，作者大大有没有考虑过中分支的粘连是不是可以出个loss 发篇文章