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GO/KEGG模块选择不同最大基因集,富集结果不一样 #614

Closed Miachol closed 2 years ago

Miachol commented 2 years ago

due: 2022-06-24

Contact: 陈舒菡 / 903741239@qq.com Tool: /advance/clusterprofiler-go-kegg 你好,我在做差异基因(共1401个)富集分析时,最大基因集的数目分别选择了100和500,下载的结果显示Qvalue值小于0.05的GO种类差了600多个,富集到的功能也不一样。请问这个最大基因集具体是什么含义?为什么会导致这个误差?我应该选择多少数目的最大基因集?

ShixiangWang commented 2 years ago

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