humlab-sead / sead_change_control

Sane SEAD change control using Sqitch.
1 stars 0 forks source link

Dendro-datat har överflödiga citattecken runt många strängar #252

Closed johanvonboer closed 6 months ago

johanvonboer commented 9 months ago

Här är ett exempel där jag väljer ut data från site 1 (en MAL site som ser normal ut) och site 3998 som är en dendro-site:

SELECT 
tbl_sites.site_id,
tbl_sites.site_name, 
tbl_sample_groups.sample_group_name
FROM tbl_sites 
JOIN tbl_sample_groups ON tbl_sample_groups.site_id=tbl_sites.site_id
WHERE tbl_sites.site_id IN (1, 3998);

Resultatet är att dendro-datat har citat-tecken runt sina strängar (borde inte finnas): image

Problemet är inte begränsat till endast tbl_sites och tbl_sample_groups, utan det verkar gälla många textsträngar i dendro-datat, här är hur site datat för site 3998 ser ut i JSON-form:

image

MattiasSealander commented 6 months ago

I just ran Johans query against the staging database (202312) and the results still showed quotation marks around dendro data.

johanvonboer commented 6 months ago

@MattiasSealander I think you are probably working with the wrong database cluster. The 'real' staging database (that superseads uses) is in the staging cluster, which is on port 5433. And the database is just called 'sead_staging'.

I think you might be connecting to port 5432, which is the production cluster. There are 'staging' databases in there as well, but there shouldn't be anymore, and they are no longer updated (as far as I know).

MattiasSealander commented 6 months ago

Great, so we can close this issue then?

johanvonboer commented 6 months ago

Yes, I think so