search

inbo / n2khab-mhq-data

Export data collected for the monitoring habitat quality programme from Fieldmap and INBOVeg database
0 stars 0 forks source link

Data cleaning ht3260 2 #20

Closed anleyssen closed 2 years ago

anleyssen commented 2 years ago

query_inboveg.Rmd: add Q3Code; initial code for HT3260_data_preparation.Rmd

ToonHub commented 2 years ago

Ziet er goed uit! Nog enkele kleine opmerkingen. Nu heb je voor submerse vegetatie bv.: var = submerse vegetatie: submerse vegetatie schaars; value_num = 95

Volgende manier lijkt me beter (en is analoog aan var artificiële structuren): var = submerse vegetatie:, value_class = submerse vegetatie schaars; value_num = 95

anleyssen commented 2 years ago

Wat betreft var en var_class voor submerse vegetatie: als ik doe wat je voorstelt, dan zit de variabelennaam verspreid over twee kolommen. Dit is niet handig en wil ik graag vermijden. Ik ben overigens nog niet tevreden van de structuur van site_characteristics & denk eraan om deze over te zetten naar een lang formaat met een structuur analoog aan LIMS en AquaChem; bvb

ID | var | value_formatted (=text) | value_numeric | is_below_LOQ | is_above_LOQ | is_numeric | unit —---------------------------------------------------------------------------------------------------------- x | slib | >1.5 | 1.5 | FALSE | TRUE | TRUE | m y | slib | 1 | 1 | FALSE | FALSE | TRUE | m z | art str | brug | NA | FALSE | FALSE | FALSE | class a | art str: brug | 15 | 15 | FALSE | FALSE | TRUE | m

(LOQ = limit of quantification)

Daarna kan er eventueel een breed formaat van gemaakt worden, met dummies voor de klassevariabelen en interpretatie van < en >-waarden. Maar voordat ik dit doe, moet ik het nog even laten bezinken ;-)

ToonHub commented 2 years ago

OK. Ik zal dan alvast mergen naar de master. Maar je mag dus blijven verder werken in deze branch.