search

inbo / sk-analyse

MIT License
0 stars 0 forks source link

Dwc mapping #13

Closed DimEvil closed 1 year ago

DimEvil commented 1 year ago

add dwc mapping in repo

SanderDevisscher commented 1 year ago

PS code ziet er goed uit ;-) maar ik zou graag eens naar de data kijken kwestie van eens na te gaan of het klopt!

DimEvil commented 1 year ago

It should be in /darwincore/processed But it seems to be ignored.. I ll check tomorrow

DimEvil commented 1 year ago

https://github.com/inbo/sk-analyse/blob/Dwc_mapping/darwincore/processed/occurrence.csv @SanderDevisscher

SanderDevisscher commented 1 year ago

Ik hoop volgende week de tijd te vinden om ernaar te kunnen kijken ;-)

SanderDevisscher commented 1 year ago

@DimEvil er zijn bljkbaar een aantal bijvangsten verdwenen uit de occurrence ("darwincore/processed/occurrence.csv") dataframe. 

> sum(is.na(occurrence$individualCount))
[1] 14504
> sum(is.na(gbif_stierkikker_bijvangsten$individualCount))
[1] 14668

enig idee hoe dit komt ? Het komt allesinds al niet doordat er stierkikker NA's in zitten want dan zou je er meer verwachten in de occurrences. Ik heb ook al getest of er soorten ontbreken in de occurrence df die wel voorkomen in de bijvangsten en ook dit is niet het geval.

PS de stierkikkers zitten er op het eerste zicht wel goed in:

> sum(gbif_stierkikker_vangsten$individualCount, na.rm = TRUE) == sum(occurrence$individualCount, na.rm = TRUE)
[1] TRUE
SanderDevisscher commented 1 year ago

found it, er zitten "NA" soorten in de bijvangsten => alles is ok dus