Is the data available?

[ielis]

Dear institute members, I would like to run your code within my environment, in order to play around with the model (I am not an expert though). However, it seems that the folder zdroje is missing. Is there any way how to get access to the input data? Is the data public?

Thank you very much for your great work! Cheers, Daniel

[gergelytakacs]

+1 here. It would make sense to share the data here. I think crowdsourcing the analysis is extremely useful at these times!

[milosmolnar]

There is a lot of parameters inside the model. Can you publish them, too? From @institute-of-health-policies-sk document: N – populácia v danej obci. S – počet tých, ktorí sa môžu nakaziť (v simulácii všetci, ktorí nikdy nemali vírus) I – počet infikovaných R – počet vyliečených (v simulácii sa nemôžu nakaziť znovu) x = I/ N – pomer infikovaných v obci y = S / N – pomer tých, ktorí sa ešte môžu nakaziť (pomer „susceptible“) m(j,k) – mobilita z obce j do obce R0 – „basic reproduction number“, priemerný počet ľudí, ktorí sú nakazení infikovanou osobou.

[milosmolnar]

There is an important estimation in model (from ducument "Mobilitu predikujeme na základe odborných (a agregovaných) odhadov, bez informácií od mobilných operátorov nevieme presne určiť migračné toky") Can you published this estimation, please?

[milosmolnar]

https://izp.sk/wp-content/uploads/2020/03/predikcia_koronavirus_17.3.2020_2.pdf

[misolietavec]

Without datafiles (mock, if you like) it is unusable. Bez dátových súborov (hoci aj oklieštených) je to nanič. Hovorí dlhoročný používateľ Pythonu a IPython/Jupyter notebookov. Privítal by som dáta, aj kvôli demonštrácii modelu pre študentov.

[radovankavicky]

Same here... great work, but make your folders /zdroje/ / /zdroje int/ (+subfolders there & all the data) public (again)! :)

[drhsub]

1- I cant see these equations in the code 2- In code, looks like simple SIR model, I = beta_vecSIR_sim[:, 0]inflow_infected/(N_k + OD.sum(axis=0)) , but report shows different (see attached pic)