github-actions[bot]
commented
3 years ago 官方新冠病毒肺炎数据（COVID-19）获取神器 by 算法学习日程本
说在最前面
文章首发于微信公众号：
因为内容都是原创的，所以禁止各种商用，禁止转载，转载请公众号留言联系小编，且注明来源！如有发现必追究。
自2019年新冠疫情发生以来，我国政府和人民全力以赴抗击疫情，全国动员、全面部署、快速反应，采取了最全面、最严格的防控举措，打响了一场疫情防控的人民战争，同时新冠疫情在学术届也引起了强烈关注，对于新冠的研究也成为今年的生物、医学、地理学等学科的热点。比如这样:
也可以是这样的:
（以上图片来源于网络，侵删）
一直以来，课题研究最难的就是数据的获取与处理，想要进行新冠数据研究的小伙伴可以看过来啦。
小编找到一个神器，当!当!当!
covidregionaldata包
2021年7月5号公布的这个包—covidregionaldata，用来获取地方和国家层面的COVID-19数据，这个数据来自官方来源,如公共卫生在英国,英格兰和其他COVID-19数据收集,包括世界卫生组织(世卫组织),欧洲疾病预防和控制中心(ECDC)，约翰·霍普金斯大学(JHU),谷歌公开数据等等。旨在以公开和透明的方式简化来自各种数据源的COVID-19数据提取、清理和处理。可以说大大缩短了数据清洗的时间，神器有没有。
小编接下来会详细演示这个包来获取COVID-19数据的过程。为了方面查阅备用，可收藏呦！创作不易，喜欢的小伙伴点个赞哈或者关注一下~
以WHO为例的COVID-19数据下载过程
在这个包中提供的数据源除了WHO之外，其实还包括Belgium, Brazil, Canada, Colombia, Covid19DataHub, Cuba, France, Germany, Google, India, Italy, JHU, Lithuania, Mexico, Netherlands, SouthAfrica, Switzerland, UK。下载方式都很类似，这里以WHO为例来探索下载数据的过程。
在new这个方法中，各参数的作用如下：
level='1'用来设置城市数据，level='2'用来设置regions数据，level默认为'1'，level='3'用来设置子regions数据
verbose默认为TRUE。是否应该返回详细的处理消息和警告；step=TRUE用来保存每个处理步骤的数据；get用来获取数据
library(covidregionaldata)start_using_memoise()national <- WHO$new(verbose = TRUE, steps = TRUE, get = TRUE)
下图是数据下载的过程，可以看到数据的下载源：
Downloading data from covid19.who.int/WHO-COV
和一些数据的基本变量的情况，比如数据的类型，数据的行数和列数
national$return()(1)用return来返回所有数据的结果，且用了DT方式来展现了表格结果，真的是蛮漂亮的。针对WHOreturn的结果，共返回5个表格，基本数据都是一致的，就是各表格会在一些字段上有区别。
显示数据包括的城市或者地区信息，这里打印的是城市列表。
national$available_regions()并不是所有的数据来源都有地区数据的，WHO就没有level='2'的设置，Covid19DataHub$new(level = "2") 这个就可以
(2) 有设置下载的功能，直接这个即可
national$download()(3) 有设置筛选功能，只需要filter即可；也可以在最开始的new部分，设置参数region='Albania'
national$filter("Albania")national$process()national$return()
一个小提示
往期R数据分析文章：
R内置生物方向数据集又来了新伙伴—Biostatistics
点击蓝字 关注我们 SUBSCRIBE to US
END
有关于其他R语言的问题可以直接私信小编哈。
请大家多多支持,后面会推出更多的知识分享或者课程，感兴趣的点击关注哈。
Children's Day
算法学习日程本
小编微信号｜fengxiao292
知乎｜R语言数据派
https://mp.weixin.qq.com/s/cCcxerV3WwIwehGEErE0Ag