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3 years ago 看完这篇11.161分的SCI文章，我明白了这种转录因子研究中的PCR的用法…… by 实验万事屋
那天突然看了一篇11.160分的 J Exp Clin Cancer Res，嗯，这篇是讲转录因子的文献：
讲的是MEN1这个基因对于JunD和β-Catenin影响的：
在Figure里突然发现，这个PCR实验貌似没怎么讲过：
嗯，就是3C-PCR，也就是Chromosome Conformation Capture，染色体构象捕获技术，其实这种技术主要是用来分析转录因子的，因为有的转录因子结合了Promoter和Enhancer，会使得染色体产生一个loop环：
这种技术，首先会提取出核中的核酸，用甲醛保证蛋白的交联，然后通过酶切消化，再用连接酶进行连接。用ChIP来拉下蛋白，然后去除交联，获得重组了的核酸片段，然后进行PCR。
由于酶切消化，其中大片段的核酸会被切掉，而转录因子结合的核酸片段由于离得近，所以会连接起来，形成短片段：
这样只要通过设计引物，就能发现这个用ChIP拉下来的蛋白结合的具体是在那个Enhancer位置了，就像这样：
不用连接酶连接的话，DP1-DP2这对引物是无法扩增出片段的……
同样通过3C的ChIP-PCR，可以发现转录因子结合DNA的具体变化情况:
最后，就会形成这样的模式图：
由于转录因子的研究，我讲得不算很多，所以这种3C-PCR可能涉及的也不多，给你们补一下吧。要看这篇文献，可以自己去PubMed上下搜一下。或者在评论区进行评论，就发给你们PMID号。实在不行就回复“公克”（不要在评论区回复
），要么就直接星球上见（当然，进不去也无所谓
）。好吧，今天就先给你们策到这里吧，祝你们心明
眼亮
。
封面：绳结 https://pic.sogou.com/
是不是看到文献就一头雾水？是不是连文献里的图都看不太懂
？是不是即使全文翻译了，都还不知道文章讲的具体是什么意思
？
为了防止你们再看不清，我们用了全彩页，效果呢，
差不多就是这样的：
终于能有人教会你们如何来读文献了，是不是突然轻松下来了呢……
所以，你们想要么？
（夏老师带你读文献，包装里面还有个钥匙扣，是彩蛋的入口。）
回复“轻松点”
或者点击阅读原文看看吧。
https://mp.weixin.qq.com/s/WI-zVTg1eCVpDlN2ngXs5w