Closed ixxmu closed 2 years ago
提到医学图像影像数据,必须首推TCGA数据库啊,在 https://www.cancerimagingarchive.net/ 动辄都是几十个GB的数据,如下,GBM的120个样本的数据量:
TCIA is a service which de-identifies and hosts a large archive of medical images of cancer accessible for public download. The data are organized as “Collections”, typically patients related by a common disease (e.g. lung cancer), image modality (MRI, CT, etc) or research focus. DICOM is the primary file format used by TCIA for image storage. Supporting data related to the images such as patient outcomes, treatment details, genomics, pathology, and expert analyses are also provided when available.
这个就需要各个领域内部研究人员自己看文献收集了,还是拿GBM举例,就有:http://www.medical-epigenomics.org/papers/GBMatch/ 数据量也不小。
欢迎其它癌症研究领域的朋友一起交流,包括这些影像数据处理的流程,软件,文献交流,好的数据源共享,机器学习方法等等。
当然,交流的前提是得有组织者,有领头人,欢迎大家自荐,说清楚自己会如何组织大家一起学习,简短的自我介绍,为什么要做组长等等
发邮件给我 jmzeng1314@163.com 希望能认识优秀的你!
可以参考我们生信技能树的传送门系列:转录组、甲基化、ChIP-Seq、lncRNA、编程实战…
都非常成功,培养了非常多的技能树优秀小伙伴,形成了华语圈最大的生物信息学交流社群,以及B站的74小时生信工程师技术教学视频。
https://mp.weixin.qq.com/s/FlX3IY7b2rdk1_gSfo7eMg