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策略篇:lncRNA和circRNA在国自然中,该何去何从? #2836

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策略篇:lncRNA和circRNA在国自然中,该何去何从? by 青椒医学

假设你是如下的一个申请人:



(一)2023-25年目标:国自然面上

(二)研究方向:非编码RNAlncRNA;心脏疾病

(三作为一作或者通讯作者的文章列表(纯属拼凑,举例而已):

1.A tRNA-derived fragment of ginseng protects heart against ischemia/reperfusion injury via targeting the lncRNA MIAT/VEGFA pathway.影响因子:10. Mol Ther Nucleic Acids. 2022.  医学二区 .

2.ZBED6A Comprehensive Analysis of the Myocardial Transcriptome in -Knockout Bama Xiang Pigs.影响因子:4Genes (Basel). 2022 08 01;13(8) 生物三区 遗传学

3.Identification of key genes for hypertrophic cardiomyopathy using integrated network analysis of differential lncRNA and gene expression.影响因子:5.846. Front Cardiovasc Med.2022.

(四)文章质量评价:水刊较多。



而如果你2022年写的lncRNA本子,评审意见分别是A、B、C(未上会)的话,你该何去何从?

一,首先,非编码RNA的文章基础是否扎实?

作者的文章期刊有:Mol Ther Nucleic Acids,Genes (Basel),Front Cardiovasc Med。

综合来看,基础还是很扎实的,有较好的实验能力,能解决lncRNA相关的科学问题。

虽然这些期刊没有上中科院预警名单的,但是口碑也没好到哪里去,只能说是30%的水分还是有的。

那么问题就是,“水刊”影响专家的评审意见和判断吗?

这个就是仁者见仁智者见智了,例如在肿瘤口就有两派:

  • 看到代表作有Molecular Cancer这个期刊的,就统一给“差评”;
  • 然后大部分还是挺羡慕能发在Molecular Cancer上的,影响因子毕竟有41分呢,只要不在中科院预警名单,或者被踢出SCI范畴,就有希望慢慢洗白。


二,LncRNA的标书是否写得够好?

但接下来我们面临一个问题,lncRNA的研究方向,到底有多大的价值?

这个是专家对lncRNA标书的重要判断标准。

1.首先,lncRNA、circRNA是否有研究价值呢?

我们来看看2022年中标的lncRNA相关项目。

项目名称

依托单位

金额

C/EBP-beta调控的lncRNA TPM3P9编码的多肽在增生性瘢痕形成中的作用及机制研究

南方医科大学

52

半夏泻心汤通过LncRNA NEAT1/miR-186-5p/PTEN、STAT3信号轴调控胃癌前病变细胞自噬的机制研究

天津中医药大学

52

m6A识别蛋白YTHDF3通过lncRNA TUG1/hsa-miR-190a-5p/CEBPA通路导致不明原因复发性流产的发病机制研究

广西医科大学

32

LncRNA H19/STING/GPX4信号通路促进乳腺癌他莫昔芬耐药的机制研究

浙江大学

52

淋巴结内高棕榈酸诱导的circSTX6通过YAP ac4C修饰调控脂肪酸氧化促进宫颈癌淋巴结定植转移

姚书忠

52

可翻译的环状RNA circDdb1在肌肉萎缩中的作用和分子机制研究

李进

52

HSP22上调线粒体circRNA SCAR改善蛛网膜下腔出血后血脑屏障破坏的作用及机制研究

段传志

52

Has_circ_0001658介导PCSK9 mRNA 甲基化修饰促进肝癌恶性进展的机制研究

何明燕

52

环状RNA-circMETTL3在胶质母细胞瘤中的作用及机制研究

彭勇

52

总共也还是有450多项lncRNAcircRNA项目,依然很多。

项目这么多,一定还有比较大的研究价值啦,不过非编码RNA如果做不出来结果,申请人不知道会不会狼狈结题,或者铤而走险去学术不端呢?毕竟非编码RNA的ceRNA机制,在pubpeer上一抓一大把。

2.lncRNA、circRNA中标项目的机制规律?

能中标国自然的lnc和circRNA的项目机制,一般为lncRNA结合某一种蛋白的机制,而非造假重灾区的lnc-miRNA机制。

3.然后,lncRNA、circRNA的标书是否写得足够好?

因为要告诉专家why你要选择做lncRNA而不是circRNA?Why这个lncRNA调控的是PI3K而不是AMPK?Why 这个lncRNA你没有验证它的细胞内定位,就能贸然判断它不是ceRNA机制?等等,很多逻辑问题,需要解释清楚,专家才能对你点赞。

在我看过的本子里,能符合国自然中标标准的,其实不到2%(当然要考虑到,对自己没信心的同学才拿给青椒老师来看,而有实力的申请人一般不会泄露自己的标书,这个因素)。

三,LncRNA的方向,可以适当踩个刹车

现在众多的lncRNA的问题文章很多都缀有国自然基金,大量的lncRNA标书做不出结果的话,最后的解决方案一定是:

①做个生信分析,发个水刊,缴纳巨额的版面费;

②实验外包给第三方,弄篇fake的文章发掉(最后反而被坑);

③彻底放弃lncRNA,做做其他功能基因,只要能结题就行;

与其这样,还不如从现在开始就做点实实在在的功能基因,通路分子,表型特点,免疫调控啥的,不必lncRNA、circRNA强。

早点转型,科研的本质是真实,可信,而不是一味蹭热点。蹭着蹭着,就发现不太好蹭。

功能基因,表型热点,才是解决临床问题的关键。

2022年青椒医学国自然训练营取得了巨大的成功,学员中标数至少30项(有图有真相,报喜如下)。方法得当,踏实学习进步,就能获得回报!


报名请先联系菜菜老师评估:


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