这65.504分的Nature在做的，明明是一种很新的RNA甲基化……

[ixxmu]

https://mp.weixin.qq.com/s/srf7RUwJxE9ko51SFcRMdg

[ixxmu]

这65.504分的Nature在做的，明明是一种很新的RNA甲基化…… by 实验万事屋

昨天讲了这篇Nature的前半截，这篇Nature在每个步骤上都做得很扎实。同时他们做的也是个比较新的课题方向，当然现在可能暂时还没多火：

也就是线粒体mt-tRNA的修饰，其实这个在2020年的时候就已经有人把线粒体中全部22个tRNA的修饰都已经测过了。

虽然这只是一篇NC，线粒体的mt-tRNA修饰被很多高分文章引用了：

一来是这个方向算是比较新颖，因为你们一味地都去做m6A甲基化，其实已经算是红海了，而线粒体mt-tRNA修饰，研究真的不多。另一方面线粒体的mt-tRNA修饰涉及的面很广，比如细胞的能量代谢、氧化磷酸化途径、糖酵解途径、三羧酸循环，甚至铜死亡，细胞凋亡，线粒体自噬（这些通路相信不用我多解释了，这个在《信号通路是什么鬼？》里都有），都和线粒体的有关。同时线粒体还与遗传疾病有关，特别是母系遗传的线粒体相关疾病。

昨天说到这篇Nature通过分析发现，NSUN3会通过促进mt-tRNA的m5C甲基化以及f5C的甲酰化，引起线粒体功能变化。敲减或者突变了NSUN3后（这里在敲减外，还用了NSUN3的突变，这就足以避免肯定后件的逻辑谬误了，读过《轻松的文献导读》或者《列文虎克读文献》的话就应该了解），线粒体的有氧呼吸被抑制，细胞会转而进行无氧呼吸：

NSUN3促进mt-tRNA的m5C甲基化以及f5C的甲酰化后，细胞的线粒体呼吸能力增强，促进了肿瘤的淋巴转移：

通过3D培养的肿瘤细胞微小球发现，NSUN3促进mt-tRNA的m5C甲基化以及f5C的甲酰化后，肿瘤细胞的侵袭转移能力变强。形成了侵袭的突触，而这些突触中线粒体活性明显增强了：

这些突触的位置，其实就是肿瘤的转移初始细胞，一般这些初始细胞表面会表达CD36和CD44标志物。

敲减NSUN3后，CD36/CD44高表达的细胞群数量明显下降。

但是敲减NSUN3仅会降低CD36/CD44高表达的细胞群的数量，不能抑制肿瘤增殖（上图蓝框）。这就进一步说明了NSUN3促进mt-tRNA的m5C甲基化以及f5C的甲酰化，对于肿瘤迁移侵袭的促进功能。

于是他们分析了CD36/CD44高表达的细胞群中的蛋白组学，结果发现这个细胞群中，线粒体相关的蛋白有的明显的高表达迹象。也就是说，很可能是在线粒体活性增强后，促进了转移初始细胞的产生。

从免疫组化的角度分析转移灶样本发现，NSUN3的表达可以与肿瘤转移相关联：

接着他们还从TCGA数据库的数据挖掘来进行分析，将高表达NSUN3及低表达NSUN3的样本进行分簇，并且做了GSEA（这个应该能看懂了吧，《实验万事屋》和《夏老师带你读文献》里都介绍过）。高表达NSUN3的样本中的GeneSet，富集了编码转移和缺氧调节因子的基因，淋巴结转移的存在都随着NSUN3水平而逐渐增加：

那既然NSUN3会通过促进mt-tRNA的m5C甲基化以及f5C的甲酰化，促进线粒体的翻译以及线粒体活性。激活氧化磷酸化途径后，促进了转移初始细胞的形成。那么有什么办法能抑制这个过程呢？他们想到的关键的就是抑制线粒体翻译，于是他们选用了几款线粒体内核糖体翻译抑制剂：

这几个抑制剂能有效抑制线粒体内核糖体的翻译功能，也就是阻断了NSUN3对线粒体的翻译激活。结果在小鼠上的实验表明，这几款线粒体内核糖体抑制剂，的确能抑制肿瘤的转移侵袭：

这篇文章从头到尾就这么讲完了，他们的每一步验证工作，都做得很扎实。一个新颖的课题方向，也能找到对应的临床解决方案，可以说是相当圆满了。你都学废了么……看懂这篇文章的话，可以在评论区回复“夏老师早”、“右叔早”、“谢谢夏老师”、“谢谢右叔”等没啥营养的话，来告诉我你们已经看懂了。好吧，有兴趣看这篇文章的话，可以自己去PubMed上下搜一下，实在不行就回复“公克”（不要在评论区回复），要么就直接星球上见（当然，进不去也无所谓），当作是科研过程中的一种调剂也是不错的选择哦。科研并不一定要这么无聊又尴尬……今天就给你们策到这里吧，祝你们心明眼亮。

封面：https://imgflip.com/memetemplate/162072509/

公众号回复“公克”，可加入夏老师的知识星球，没事可以翻翻精华帖，里面有不少宝藏工具。

目前夏老师已正式出版8本书：《信号通路是什么鬼？4》现价七八折，会员折上折。《实验万事屋》适合刚要入门的科研菜鸟，《夏老师带你读文献》是教你们如何读文献(扫描钥匙扣上的二维码有科研解迷彩蛋)，《信号通路是什么“鬼”？》(扫描藏书票中间的二维码有科研解迷彩蛋)和《信号通路是什么“鬼”？2》，《信号通路是什么“鬼”？3》是信号通路系列，介绍各种信号通路，每条信号通路配有对应SCI文章的解读，由表及里。《列文虎克读文献》，通过文献精读，讲解简单的分子生物学实验及原理。最新出版的《轻松的文献导读》就通过几篇不同风格、不同领域的文章解读，简单讲解了文章的思路和逻辑性。有需要的可搜索微信小程序：“夏季霸老师”。

ps：可以去B站上看看SBR（Seminar But Reaction）的文献导读，夏老师又骗你们去学习了

https://space.bilibili.com/3493112538204218

5.834分的文章，Rictor在大鼠脊髓损伤后的过度表达促进脊髓功能恢复

这5.834分的文章，是如何来分析巨噬细胞极化的？

用这4.803分的文章，来教你们外泌体应该如何研究……

12.067分CDD的奇妙研究，蛋白的乳酰化能促进外泌体释放HMGB1？

5.385分的文章是怎么研究IL34促进巨噬细胞M2极化的呢……

12.779分的PNAS是这样研究circRNA的，这可比MC上的文章强太多了……

如何利用xmind整理文献思路

来看看SCIENCE的铜死亡是怎么做的

砷或/和锑诱导小鼠肝脏线粒体自噬和凋亡与代谢异常和氧化应激有关

带你复盘一下这10.753分的文章，是怎么做线粒体自噬的……

进入微店进行购买（直接点击上图进入微店小程序或点击下方阅读原文）。