如果你做肿瘤干性，这篇PNAS论文别错过！附肿瘤干性数据集

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如果你做肿瘤干性，这篇PNAS论文别错过！附肿瘤干性数据集 by 芒果师兄聊生信

我们反复强调说，在进行生信分析或基础研究中，务必从表型的角度来定义肿瘤或表型。肿瘤细胞被定义为一群起源于自身正常组织、疯长、不死、不衰老的细胞。在实操教程中，借助肿瘤标志物综述和CancerSEA数据库，我们对肿瘤表型做了进一步归纳。但是，随着研究的不断深入，越来越多的表型被引入肿瘤研究领域。

控制干细胞功能的调节程序在肿瘤中很活跃，并赋予肿瘤进展和治疗抵抗的特性。然而，干细胞样肿瘤表型（“肿瘤干性”）对肿瘤免疫学特性的影响尚未得到系统探索。2019年，PNAS期刊发表了题为Cancer stemness, intratumoral heterogeneity, and immune response across cancers的论文。

基于基因表达的指标，研究人员评估了 21 种实体癌的细胞干性与免疫细胞浸润和基因组、转录组和临床参数的关联。该研究发现，尽管高干性肿瘤的突变负荷和瘤内异质性增加，但是总体而言，肿瘤干性和抗肿瘤免疫之间存在负相关关系。肿瘤干性还与细胞的干扰素信号传导内在抑制和多种治疗上免疫抑制通路分子的表达增加密切相关。因此，肿瘤干性不仅是肿瘤的基本特征，而且可能揭示跨肿瘤抗原、瘤内异质性和免疫抑制之间的联系。

不同肿瘤的干性存在差异，生存参数也不同，但总体上细胞干性得分越高，生存越差。

肿瘤干性和免疫细胞signature之间负相关。

免疫组化显示，不同的肿瘤队列中，肿瘤干性和免疫细胞浸润之间不同。

肿瘤干性与肿瘤的克隆性和瘤内异质性正相关。

突变负荷，肿瘤抗原表达和内源性逆转录病毒与肿瘤干性密切相关。

细胞固有的干性与I 型干扰素信号通路下调、免疫抑制性分子CD276和PVR增加相关。

此外，该论文还整理了肿瘤干性的基因集，在进行肿瘤干性的数据挖掘时，我们可以用该数据集进行分析，探究肿瘤干性在表型中的作用。数据集和论文链接：

https://pan.baidu.com/s/1qAq2hNQJif-DpiQ14vrnPg?pwd=1236

提取码：1236