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3 years ago UCSCXenaShiny 1.0 beta 版本发布 by 优雅R
UCSCXenaShiny 是我 19 年通过 Openbiox 发起的项目（地址：https://github.com/openbiox/UCSCXenaShiny，点击原文），用于下载和分析著名癌症数据库 UCSC Xena https://xenabrowser.net/datapages/。最近和小伙伴进行了大量的重构和更新。它既是一个 R 包，也是一个 Shiny 应用。我们以 Shiny 应用为主，这样可以将分析功能提供给无任何编程经验的用户。本次集中式开发特别感谢团队成员熊逸和赵龙飞，也感谢团队参与其他贡献和讨论的成员。
此次属于重大更新，相比于 CRAN 发布的版本，页面、功能均发生了巨大的改变。欢迎感兴趣的读者朋友们安装使用！
目前我们发布 1.0 的 beta 测试版本（功能基本不再增加，但可能存在一些开发中难以发现问题），欢迎👏使用并在 GitHub issue 中 https://github.com/openbiox/UCSCXenaShiny/issues 进行反馈。
安装
# 国内
remotes::install_git("https://gitee.com/XenaShiny/UCSCXenaShiny")
# 国外
remotes::install_github("openbiox/XenaShiny")
启动：
library(UCSCXenaShiny)
app_run()
启动过程也会下载安装很多依赖包，请耐心等待，如果网络不好请切换 CRAN 镜像。如果你想尝试在线使用，上 Hiplot 平台 https://hiplot.com.cn/，搜索 Xena。
重要功能预览
数据集筛选与下载
通用分析
该功能支持 UCSC Xena 任意符合分析要求的数据集！目前有 4 个模块，分别用于 2 变量相关、多变量相关、分组比较和生存分析。
诸多泛癌分析功能模块
下面是一些截图：
https://mp.weixin.qq.com/s/p1xazWBSHgcWiIgLcU9FlA