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jessieren / DeepVirFinder

Identifying viruses from metagenomic data by deep learning
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116 stars 32 forks source link

DeepVirFinder使用问题 #1

Closed quliping closed 5 years ago

quliping commented 5 years ago

你好，很幸运能使用DeepVirFinder。但是这个软件的输出好像只有名称、长度、得分和p值，请问如何得到病毒序列文件呢？就是说怎样把病毒序列从contig中提取出来。DeepVirFinder好像只能输出序列名字而已，没有输出具体的序列。那么请问后续应该怎么分析呢？

jessieren commented 5 years ago

您好，谢谢您对DeepVirFinder的关注！DeepVirFinder是用来判断输入的contig序列是否为viral contig。p-value低或score高的contig更有可能来自virus。