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jeya-maria-jose / Medical-Transformer

Official Pytorch Code for "Medical Transformer: Gated Axial-Attention for Medical Image Segmentation" - MICCAI 2021
MIT License
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MoNuSeg dataset #59

Open TangdoudouAN opened 2 years ago

TangdoudouAN commented 2 years ago

Hello! I resized the monuseg dataset to 512 × After 512, it still can't reach the effect of the original text. What method do you use to resized it? Thanks!

xk16111108 commented 2 years ago

我也是 也达不到作者的效果 只能75%

TangdoudouAN commented 2 years ago

我也是 也达不到作者的效果 只能75%

我的才68%

xk16111108 commented 2 years ago

[请问在跑指标的时候，有没有出现维度对不上的情况，就是在图片那里，我修改了一下增加了维度 $CMZOJCW9BHUH Z}V(VU08L

TangdoudouAN commented 2 years ago

[请问在跑指标的时候，有没有出现维度对不上的情况，就是在图片那里，我修改了一下增加了维度 $CMZOJCW9BHUH Z}V(VU08L

我没有，你这个应该是在resize的时候把标签图转成三通道了，你可以转成单通道就不会有这个情况了

xk16111108 commented 2 years ago

好的 谢谢您~

Aaaattack commented 2 years ago

我也是 也达不到作者的效果 只能75%

我的才68% 您好，请问一下您在复现的时候，是把30张训练集图像全部用于训练，然后每跑几步就用14张测试集图像进行测试吗？还是需要把30张训练集图像划分出训练集和验证集，用最好的验证结果进行测试？

Throne-myworld commented 10 months ago

请问如何按照作者的意思将MoNuSeg中的.xml注释文件转成.png文件放到对应的labelcol里呢？