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jflucier / ILL_pipelines

Isabelle Laforest-Lapointe Laboratory code
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humann: error: argument --threads: expected one argument #29

Closed jorondo1 closed 2 years ago

jorondo1 commented 2 years ago

depuis la mise à jour des scripts pour la switch j'ai cette erreur qui apparait, voir

/nfs3_ib/ip29-ib/ip29/ilafores_group/projet_PROVID19/functionnal_profile/DUAL/functionnal_profile-28836_21.slurm.out si tu réussis à l'arranger peux-tu regénérer le script et rouler la commande suivante svp? sbatch --array=13,21,24-29 /nfs3_ib/ip29-ib/ip29/ilafores_group/projet_PROVID19/functionnal_profile/functionnal_profile.slurm.sh

jflucier commented 2 years ago

done

https://github.com/jflucier/ILL_pipelines/commit/61a89d2070fca68025b27769a91fe085da957d05