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jflucier / ILL_pipelines

Isabelle Laforest-Lapointe Laboratory code
0 stars 1 forks source link

run metawrap par modules #36

Closed jorondo1 closed 1 year ago

jorondo1 commented 2 years ago

s'assurer qu'on puisse re-rouler le bin_refinement sans avoir à refaire le process d'assemblage au complet

aussi, est-ce que les modules d'annotations seront dans un script indépendant? Roary, prokka, gtdb-tk

jflucier commented 2 years ago

aussi, est-ce que les modules d'annotations seront dans un script indépendant? Roary, prokka, gtdb-tk

je vais faire un module qui les roules tous ensemble. Je peux facilement ensuite faire de smodule separer si on juge pertinent. C pas assez long pour separer selon moi

jflucier commented 2 years ago

Note: code change done (https://github.com/jflucier/ILL_pipelines/commit/351939d151bc5c5adfa066efeeff1cfb20bfda30)

Still need to release, cannot because moss jobs still waiting to execute