search

jo-mueller / Slice2Volume

Script that registers Histology slices to volumetric image data
BSD 3-Clause "New" or "Revised" License
11 stars 1 forks source link

2. Alphatest --> crash bei results.mhd #13

Closed Theresa-S closed 4 years ago

Theresa-S commented 4 years ago

Hallo, ich habe jetzt nochmal getestet und zwei Anmerkungen plus ein neues Issue. Hier das Issue

Das Programm gibt eine Fehlermeldung bei 8.2 % Progress auf: grafik

Die Datei wird im Skript nicht angelegt, sondern nur aufgerufen --> .mhd erscheint auch nur einmal im Code. Das Problem ist vermutlich itk related, fehlt mir noch eine Input Datei?

jo-mueller commented 4 years ago

Ich würde hier noch einen ähnlichen Bug anmerken: Ich hab das Gefühl dass irgendwelche Produkte der Registrierung (zB. results.mhd, oder TransformParameters.0.txt) bei mehrmaligen Ausführen des Skripts nicht korrekt überschrieben werden und dann beim transformieren Ärger machen.

@schneidorlein: Vielleicht wäre es hier hilfreich einfach bei jeder Ausführung des Skripts einen frischen (leeren) Ordner zu erstellen? Der Ordner der jetzt "trafo" heißt würde dann halt output0, output1,... heißen und wäre dann garantiert leer, so dass Relikte aus vorherigen Registrierungen keine Rolle mehr spielen sollten.

jo-mueller commented 4 years ago

Solved: New folder created for every script execution.