Error handling - get top slice

jo-mueller / Slice2Volume

Script that registers Histology slices to volumetric image data

BSD 3-Clause "New" or "Revised" License

11 stars 1 forks source link

Error handling - get top slice #8

Closed Theresa-S closed 4 years ago

Theresa-S commented 4 years ago

Könntet ihr hier ein weiteres if einfügen (oder else? Ich bin mir bei der Syntax nicht sicher) bei dem abgefangen wird, dass in jedem Bild eine 0 steht? Z.B. Ich hab die Fehlermeldung zuerst nicht verstanden, sowas wie eine Nachricht "Überall ist 0 drin, deine Daten sind doof/ weiter oben ist ein Problem"

Tipp: waitForUser()

Error messages_1

Theresa-S commented 4 years ago

grafik

--> works in principle But: @schneidorlein: Perhaps we should change the text. The problem here was that the folder gH2AX did not exist, because I called it differently:

grafik

Theresa-S commented 4 years ago

Suggestion for text:

"Oops. An error occurred. Possible reasons are:

CT and/ or DAPI image data is empty/ completely black.
Given directory of image data does not exit (check for typos:-)
... [was auch immer noch so auftaucht]"

jo-mueller commented 4 years ago

Das Problem mit den Filenamen und der "/" und "\" Problematik sollte eigentlich durch Robert's GUI abgedeckt werden - die formatiert das automatisch. Ich schliess das Issue mal.