search

jocicmarko / ultrasound-nerve-segmentation

Deep Learning Tutorial for Kaggle Ultrasound Nerve Segmentation competition, using Keras
MIT License
939 stars 328 forks source link

how to increase the contrast of the predicted masks -nothing is visible in masks #52

Closed rddvsr closed 7 years ago

rddvsr commented 7 years ago

hi i tried your code , everything goes well but the predicted masks generated are of low contrast.how to increase the contrast so that i can see the clear prediction here is the sample prediction 2_pred

qinxi117 commented 7 years ago

just multiple your prediction with 255

rddvsr commented 7 years ago

Yah thanks for your response , its working now ,thank you for the fix one more thing we want implement the Segnet for biomedical image segmentation,we wrote the code to implement full segnet with pooling indices based upsampling layer.the training shows 96-98 % accuracy but doesn't predict anything.plz help me in fixing this issue.here is the code plz find the attached files

On 4 October 2017 at 16:06, qinxi117 notifications@github.com wrote:

just multiple your prediction with 255

— You are receiving this because you authored the thread. Reply to this email directly, view it on GitHub https://github.com/jocicmarko/ultrasound-nerve-segmentation/issues/52#issuecomment-334116135, or mute the thread https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AV3zMfVjku-2aGcJOIy0Ksd6B0-cW0PLks5so1-wgaJpZM4PlkxM .

-- డి డి వి శివరాం రోలంగి బీ.టెక్,ఎం.టెక్,( పీహెచ్.డి) సహాయ ఆచార్యులు కంప్యూటర్ సైన్స్ మరియు ఇంజనీరింగ్ విభాగం విశ్వ విద్యాలయ సాంకేతిక కళాశాల జవహర్లాల్ నెహ్రు సాంకేతిక విశ్వ విద్యాలయం కాకినాడ విజయ నగరం ప్రాంగణం విజయ నగరం-535003 చరవాణి:9866868461

       8985944461

''అవహేళనకూ ప్రతిఘటనకూ భయపడేవాడు సంస్కర్త కాలేడు''

qinxi117 commented 7 years ago

@rddvsr I didn't see the attached files, and i don't quite understand what do you mean by saying 'it doesn't predict anything'.I guess you mean it doesn't output images? and i am also assuming you are using segnet in keras which is in: https://github.com/imlab-uiip/keras-segnet If so, you will find they flaten the image is the last setp, so you should reshspe the output back to a 2d array to get picture. Also, I suggest you use U-net instead of segnet, I found that U- net has a better result

rddvsr commented 7 years ago

here is the codes

On 4 October 2017 at 16:28, qinxi117 notifications@github.com wrote:

@rddvsr https://github.com/rddvsr I didn't see the attached files, and i don't quite understand what do you mean by saying 'it doesn't predict anything'.I guess you mean it doesn't output images? and i am also assuming you are using segnet in keras which is in: https://github.com/imlab-uiip/keras-segnet If so, you will find they flaten the image is the last setp, so you should reshspe the output back to a 2d array to get picture. Also, I suggest you use U-net instead of segnet, I found that U- net has a better result

— You are receiving this because you were mentioned. Reply to this email directly, view it on GitHub https://github.com/jocicmarko/ultrasound-nerve-segmentation/issues/52#issuecomment-334279413, or mute the thread https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AV3zMSjziRBesy9WyDIb6x_Cc-oXksWHks5so-pWgaJpZM4PlkxM .

-- డి డి వి శివరాం రోలంగి బీ.టెక్,ఎం.టెక్,( పీహెచ్.డి) సహాయ ఆచార్యులు కంప్యూటర్ సైన్స్ మరియు ఇంజనీరింగ్ విభాగం విశ్వ విద్యాలయ సాంకేతిక కళాశాల జవహర్లాల్ నెహ్రు సాంకేతిక విశ్వ విద్యాలయం కాకినాడ విజయ నగరం ప్రాంగణం విజయ నగరం-535003 చరవాణి:9866868461

       8985944461

''అవహేళనకూ ప్రతిఘటనకూ భయపడేవాడు సంస్కర్త కాలేడు''

rddvsr commented 7 years ago

2017-10-05 4:40 GMT-04:00 RDDV Sivaram CSE, JNTUK UCEV < rddvsr.cse@jntukucev.ac.in>:

here is the codes

On 4 October 2017 at 16:28, qinxi117 notifications@github.com wrote:

@rddvsr https://github.com/rddvsr I didn't see the attached files, and i don't quite understand what do you mean by saying 'it doesn't predict anything'.I guess you mean it doesn't output images? and i am also assuming you are using segnet in keras which is in: https://github.com/imlab-uiip/keras-segnet If so, you will find they flaten the image is the last setp, so you should reshspe the output back to a 2d array to get picture. Also, I suggest you use U-net instead of segnet, I found that U- net has a better result

— You are receiving this because you were mentioned. Reply to this email directly, view it on GitHub https://github.com/jocicmarko/ultrasound-nerve-segmentation/issues/52#issuecomment-334279413, or mute the thread https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AV3zMSjziRBesy9WyDIb6x_Cc-oXksWHks5so-pWgaJpZM4PlkxM .

-- డి డి వి శివరాం రోలంగి బీ.టెక్,ఎం.టెక్,( పీహెచ్.డి) సహాయ ఆచార్యులు కంప్యూటర్ సైన్స్ మరియు ఇంజనీరింగ్ విభాగం విశ్వ విద్యాలయ సాంకేతిక కళాశాల జవహర్లాల్ నెహ్రు సాంకేతిక విశ్వ విద్యాలయం కాకినాడ విజయ నగరం ప్రాంగణం విజయ నగరం-535003 చరవాణి:9866868461

       8985944461

''అవహేళనకూ ప్రతిఘటనకూ భయపడేవాడు సంస్కర్త కాలేడు''

-- డి డి వి శివరాం రోలంగి బీ.టెక్,ఎం.టెక్,( పీహెచ్.డి) సహాయ ఆచార్యులు కంప్యూటర్ సైన్స్ మరియు ఇంజనీరింగ్ విభాగం విశ్వ విద్యాలయ సాంకేతిక కళాశాల జవహర్లాల్ నెహ్రు సాంకేతిక విశ్వ విద్యాలయం కాకినాడ విజయ నగరం ప్రాంగణం విజయ నగరం-535003 చరవాణి:9866868461

       8985944461

''అవహేళనకూ ప్రతిఘటనకూ భయపడేవాడు సంస్కర్త కాలేడు''