julibinho / lymphoClone2

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EvaluateClusters #10

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julibinho commented 6 years ago

Voici le script d'evaluation et comment l'executer

python simulator/evaluateSimCluster.py -i outputCluster --v

le fichier outputCluster doit etre dans le format ClusterID1\tIDseq1-1\spaceIDseq1-2\spaceIDseq1-3\n ClusterID2\tIDseq2-1\spaceIDseq2-2

Si outputCluster n'a pas toutes les sequencesID du fichier fasta original, tu peux donner le nombre de sequence attendu.

python simulator/evaluateSimCluster.py -i outputCluster -totalSeq 27566 --v

Dis-moi si tu as compris, ok?

à+