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junqiangchen / PytorchDeepLearing

Meidcal Image Segmentation Pytorch Version
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ROI区域代码请教 #3

Closed DiahannWu closed 2 years ago

DiahannWu commented 2 years ago

由于结节在图像中心位置，且目标比较小，所以根据LIDC-IDRI_1176.npy文件中结节的直径大小，在128x128x64大小上获取肺结节ROI区域图像，这样就可以进一步减少背景干扰，因此得到肺结节的ROI区域。然后统计全部肺结节ROI区域的大小，平均大小是33x33x18。 请问这里获取ROI区域的代码能分享一下吗

junqiangchen commented 2 years ago

ROI是根据直径来计算得到的，很简单

DiahannWu commented 2 years ago

这里图像的(128x128x64)已经是对应物理坐标了吗，所以先根据LIDC-IDRI_1176.npy文件中结节的直径大小/spacing得到物理直径，然后roi_image为[64-直径/2:64+直径，64-直径/2:64+直径，32-直径/2:32+直径]吗？

junqiangchen commented 2 years ago

@DiahannWu 为了考虑到结节和附近的背景区域，我建议roi_image为[64-直径:64+直径，64-直径:64+直径，32-直径:32+直径]

DiahannWu commented 2 years ago

@DiahannWu 为了考虑到结节和附近的背景区域，我建议roi_image为[64-直径:64+直径，64-直径:64+直径，32-直径:32+直径]

好的，非常感谢大佬