Closed kangmg closed 1 month ago
아래 함수로 대체하면 문제없이 작동하지만 조금 더 확인 필요
def dihedral_angle(atom1, atom2, atom3, atom4):
b2 = np.array(atom3) - np.array(atom2)
b1 = np.array(atom2) - np.array(atom1)
b3 = np.array(atom4) - np.array(atom3)
v1 = np.cross(b1, b2)
v2 = np.cross(b2, b3)
angle = np.arccos(np.dot(v1, v2) / (np.linalg.norm(v1) * np.linalg.norm(v2)))
angle_degrees = np.degrees(angle)
if np.dot(np.cross(v1, v2), b2) < 0:
angle_degrees = 360 - angle_degrees
return angle_degrees
source/plot.py
파일 내에 아래 함수의 range가 [0,360]가 아닌 [0,180]인 문제 발견