kexinhuang12345 / MolTrans

MolTrans: Molecular Interaction Transformer for Drug Target Interaction Prediction (Bioinformatics)
https://academic.oup.com/bioinformatics/advance-article/doi/10.1093/bioinformatics/btaa880/5929692
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您好对于您给出的代码复现结果和您的论文提出的结果差别较大,能够提供详细的训练过程日志和数据集的划分方式? #1

Closed czjczj closed 3 years ago

czjczj commented 3 years ago

您好,如题。感谢

kexinhuang12345 commented 3 years ago

您好 不好意思 没有收到通知。你是哪个dataset 哪个task的结果?我产生一个notebook发你

czjczj commented 3 years ago

亲爱的作者您好,MolTrans 论文以及在 Bioinformatics 上 Online了, 能够在github上提供一下完整的数据集(数据集好像不完整)和实验代码,非常感谢。

kexinhuang12345 commented 3 years ago

好的 可以 我下周之内 更新一下 不好意思 这几周有点过于忙

czjczj commented 3 years ago

感谢

kexinhuang12345 commented 3 years ago

刚刚push了全的dataset,主要的实验,missingness实验和cold drug/protein的实验;code 还有个notebook example; code应该是work的 我只改了那个data path 我过两周会test一下 不过你着急的话可以先用起来