search

kmooog / amplicon-pipeline

MIT License
0 stars 0 forks source link

多様性解析 #3

Closed kmooog closed 4 years ago

kmooog commented 5 years ago
kmooog commented 5 years ago

Shannon diversity_shannon Simpson diversity_simpson

深度方向で多少の傾向はあるが、そもそもがサチってるっぽくてあんま意味なさそう？

kmooog commented 5 years ago

リード長のヒストグラム。50000以下省いてもあんま結果は変わらなかった(多様性の文脈で外れ値にはならなかった)

read_num_histgram

kmooog commented 4 years ago

download-10 海域ごとの特性がかなりありそうな雰囲気