fix(commands): make CommandManager.config indepedent from its scope.config

[Hieuzest]

CommandManager.config 和 CommandManager.ctx.scope.config 在初始化时为同一值，这将导致 CommandManager.update() 先重写配置项后触发 ctx.scope.update()， 此时 ctx.scope.config 已经被修改，导致 internal/before-update 中无法区分是否改动。 而 ctx.scope.update() 中调用了 schema()， 因此后续并不会出现问题。因而此pr在初始化时强制让二者独立来避免此问题。