search

lanit-tercom-school / analyzeme

analyzeme
30 stars 5 forks source link

renjin + bioconductor repos #265

Closed adavydenko closed 8 years ago

adavydenko commented 8 years ago

Проверить возмножость подключаться сторонние пакеты (в первую очередь интересует bioconductor.org: snprelate, ...

kazuare commented 8 years ago

Если я нигде не облажался в работе с кодом, то Renjin - это полный провал. Сейчас обьясню, почему: При подключении нужных jar файлов все подключается отлично, но проблема в том, что ничего не работает, gdsfmt не может даже файл открыть. Это достаточно неудивительно, Renjin вроде использует свой движок для R, не успевающий за своим старшим братом по возможностям. Дополню еще: Вот тут (описание gdsfmt в renjin'е) http://packages.renjin.org/package/org.renjin.bioconductor/gdsfmt написано: This package can be loaded by Renjin but there was an error compiling C/FORTRAN sources and all tests failed Судя по надписи all tests failed, все очень плохо. С остальными даже и пытаться не стоит, я думаю. Закрываю, если никто не против.