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Compute pretest probabilities and interpret results of SARS-CoV-2 rapid tests
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Genauere Daten aus PEI-Evaluierung einbeziehen #52

Open lenaschimmel opened 3 years ago

lenaschimmel commented 3 years ago

Inzwischen sind zwei relevante Preprints veröffentlicht, in denen für viele Schnelltests vergleichbare Messungen der Sensitivität vorliegen:

Soweit ich das verstehe, sind das die Daten der PEI-Evaluation, von denen bisher nur öffentlich war, welche Tests die Mindestkriterien erfüllen.

Ich muss beide Paper mal detailiiert lesen, aber ich denke, die Daten daraus können und sollten in den Schnelltestrechner einfließen und dort als weitere Datenquelle verfügbar sein.

Vermutlich kann sogar das Bedienkonzept erweitert werden, so dass man auswählt, für welchen Fall man Ergebnisse haben möchte:

lenaschimmel commented 3 years ago

Work in Progress:

Inzwischen habe ich aus den Rohdaten (einzelne positiven und negative Testergebnisse) die logarithmische Regression nachvollzogen, mit der sich die Sensitivität für jeden beliebigen CT-Wert bzw. jede Viruslast ermitteln lässt. Das ganze ist bereits testweise in der Seite integriert. Ebenfalls ermittle ich daraus den Grenzwert der Viruslast für eine 50%ige Erkennungsrate und stelle diesen auf der Seite dar.

Bildschirmfoto 2021-06-14 um 00 40 18

Das ist eigentlich der zweite Schritt vor dem ersten, denn das 122er-Preprint enthält ja bereits Sensitvitäten für 4 CT-Bereiche, und das 31er zusätzlich die 50%-Viruslast, die meist ca. 2 CT-Stufen niedriger liegt als bei meinen eigenen Berechnungen. Diese Daten sollten natürlich auch auswählbar sein.