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liibre / Rocc

Get species occurrence data from speciesLink and GBIF, and species lists from the Brazilian Flora 2020. Perform basic taxonomic checks based on Brazilian Flora 2020. Download GADM, WDPA and DIVA-GIS gazetteer shapefiles.
https://liibre.github.io/Rocc/
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Change to how `save` argument works on `rspeciesLink()` #12

Open brunomioto opened 2 years ago

brunomioto commented 2 years ago

Oi pessoal,

Eu estava fazendo algumas buscas e acabei pensando que o funcionamento do argumento save (que é TRUE por padrão) pode trazer alguns problemas indesejados. Eu entendo que é importante salvar os resultados da busca em um arquivo na pasta de trabalho, mas se eu fizer outra busca logo em seguida, a função salva o arquivo output por cima do outro, já que, por padrão, ele se chama "output".

Se a busca anterior tiver sido bem grande, vai sobrepor o arquivo anterior sem nenhum aviso. Talvez a função file.exists() possa ajudar nisso.

Obrigado!!

AndreaSanchezTapia commented 2 years ago

Oi Bruno, você tem razão, é muito bom ter pessoas que usem o pacote para termos esse tipo de exemplos de uso. Você pode fazer um PR com essa modificação, ligado a esta issue? A ideia de usar file.exists() e retornar um erro para evitar sobreescrever é boa.

brunomioto commented 2 years ago

Oi @AndreaSanchezTapia, vou tentar fazer algo aqui e submeto sim! Obrigado!

AndreaSanchezTapia commented 2 years ago

Beleza, a gente pode ver junto depois, se tiver alguma dúvida só entra em contato. Obrigada!

brunomioto commented 2 years ago

Feito 😊

eliane-anunciacao commented 5 months ago

Olá! A função rspeciesLink deixou de funcionar por causa da mudança da API. http://blog.cria.org.br/2024/01/comunicado-sobre-api-do-iservico-web-da.html Alguém que está utilizando o pacote poderia me dizer se já foi feita alguma atualização na função para baixar os dados do speciesLink?

brunomioto commented 5 months ago

Olá! A função rspeciesLink deixou de funcionar por causa da mudança da API. http://blog.cria.org.br/2024/01/comunicado-sobre-api-do-iservico-web-da.html Alguém que está utilizando o pacote poderia me dizer se já foi feita alguma atualização na função para baixar os dados do speciesLink?

Oi Eliane! Eu fiz uma função pra realizar a busca, mas não está completa ou testei. Não sei se o pacote Rocc está sendo mantido ainda. Enviei um PR e não tive resposta

eliane-anunciacao commented 5 months ago

Olá Bruno! Quando você testar poderia compartilhar? Tenho várias espécies para extrair dados do SpeciesLink. Obrigada por responder!