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运行示例代码“[H] = fdnLoadHic(Data_Loc,dataInfo,'single'); %%% Load Hi-C data”时报错了, java是没有问题的 #1

Closed kuangzhuoran closed 1 year ago

kuangzhuoran commented 1 year ago

错误使用 juicerToolsDump 'java' 不是内部或外部命令，也不是可运行的程序 或批处理文件。

出错 hic2mat (第 30 行) [juicerOut,hicHeader] = juicerToolsDump(norm3d,norm1d,fn,chr1,chr2,bpFrag,binSize,[],headerFlag);

出错 fdnLoadHic (第 84 行) tempKr = hic2mat('observed',hicParam.norm1d,sampleFn{iSample},...

出错 untitled (第 8 行) [H] = fdnLoadHic(Data_Loc,dataInfo,'single'); %%% Load Hi-C data

kuangzhuoran commented 1 year ago

问题已解决，安装相应版本的jdk并添加到环境变量即可 https://blog.csdn.net/xutong_123/article/details/126527401