Closed julipeale2001 closed 2 years ago
linnabrown
commented
2 years ago Hi Julipeale2001, thank you for using our tool.
Did you install the signalP by yourself? We do not integrate signalP on our package since its license does not permit us to do so.
julipeale2001
commented
2 years ago Hi Le, Yes, I did install singalP 4.0. I got the licence:
Dear Mr/Mrs Julius Nweze,
Hereby we respond to your request for an academic license to use the signalp 4.1 software. The license terms are attached to this message.
The software package for Linux and the license can be downloaded for the next 4 hours at: https://services.healthtech.dtu.dk/download/ (I removed it)
The installation instructions are included in the package. From our experience the software installs smoothly on most Linux systems.
If you encounter serious problems you can write to the author of the package, i.e. the scientist behind the service. You are not guaranteed a solution to the problem.
From: Le Huang @.> Sent: 08 June 2022 16:23 To: linnabrown/run_dbcan @.> Cc: Nweze Julius @.>; Author @.> Subject: Re: [linnabrown/run_dbcan] Signal peptide predictions in run_dbcan3 (Issue #97)
Hi Julipeale2001, thank you for using our tool.
Did you install the signalP by yourself? We do not integrate signalP on our package since its license does not permit us to do so.
— Reply to this email directly, view it on GitHubhttps://github.com/linnabrown/run_dbcan/issues/97#issuecomment-1149987348, or unsubscribehttps://github.com/notifications/unsubscribe-auth/ANVRS3BOXJ7OZTIWCZJHJDDVOCUFDANCNFSM5YGNDP7Q. You are receiving this because you authored the thread.Message ID: @.***>
linnabrown
commented
2 years ago Let us double-check for that. If you don't mind, could you provide the example input data that you are using?
julipeale2001
commented
2 years ago Hi Le, I am using currently using the test fasta file (EscheriaColiK12MG1655.fna). Every other thing is OK except signalP (see the attached file).
From: Le Huang @.> Sent: 08 June 2022 17:16 To: linnabrown/run_dbcan @.> Cc: Nweze Julius @.>; Author @.> Subject: Re: [linnabrown/run_dbcan] Signal peptide predictions in run_dbcan3 (Issue #97)
Let us double-check for that. If you don't mind, could you provide the example input data that you are using?
— Reply to this email directly, view it on GitHubhttps://github.com/linnabrown/run_dbcan/issues/97#issuecomment-1150056462, or unsubscribehttps://github.com/notifications/unsubscribe-auth/ANVRS3F25T5BCWSB5LEF4X3VOC2OFANCNFSM5YGNDP7Q. You are receiving this because you authored the thread.Message ID: @.***>
Gene ID EC# HMMER eCAMI DIAMOND Signalp #ofTools NC_000913.3_1000 - CE4(103-271)+GH153(313-664) - CE4+GH153 N 2 NC_000913.3_1023 - GT2(236-418) - GT2 N 2 NC_000913.3_1054 - GH73(160-295) - GH73 N 2 NC_000913.3_1079 3.2.1.52 GH3(56-278) 3.2.1.- GH3 N 3 NC_000913.3_1163 4.2.2.N2 GH23(52-197) 4.2.2.- GH23 N 3 NC_000913.3_1167 3.2.1.28 GH37(56-531) 3.2.1.- GH37 N 3 NC_000913.3_118 - AA1(66-510) - - N 1 NC_000913.3_125 - CE4(227-371) - - N 1 NC_000913.3_1285 - GH13_18(81-423) - GH13_18 N 2 NC_000913.3_1291 - GH109(9-157) - - N 1 NC_000913.3_1292 2.4.1.230|2.4.1.279 GH65(299-674) 2.4.1.- GH65 N 3 NC_000913.3_144 2.4.1.129|3.4.16.4 GT51(208-379) 2.4.1.-+3.4.16.- GT51 N 3 NC_000913.3_1530 3.2.1.17 GH24(27-167) 3.2.1.- GH24 N 3 NC_000913.3_1594 3.2.1.31 GH2(7-588) 3.2.1.- GH2 N 3 NC_000913.3_1601 - GH109(3-152) - - N 1 NC_000913.3_1712 3.2.1.86 GH4(6-185) 3.2.1.- GH4 N 3 NC_000913.3_177 2.4.1.182|2.4.1.198 GT19(9-366) 2.4.1.- GT19 N 3 NC_000913.3_1874 2.4.1.15|2.4.1.347|3.1.3.12 GT20(2-453) 2.4.1.- GT20 N 3 NC_000913.3_1901 3.2.1.1|3.2.1.98 GH13_5(31-373) 3.2.1.- GH13_5 N 3 NC_000913.3_1998 - GT4(193-336) - GT4 N 2 NC_000913.3_2000 - GT113(11-324) - GT113 N 2 NC_000913.3_2010 - GT4(225-369) - GT4 N 2 NC_000913.3_202 - GH23(55-198) - CBM50+GH23 N 2 NC_000913.3_2025 - GT2(8-154) - GT2 N 2 NC_000913.3_2068 - GH25(70-245) - GH25 N 2 NC_000913.3_2100 3.2.1.21 GH3(88-309) 3.2.1.- GH3 N 3 NC_000913.3_2121 3.1.2.12|3.1.1.56 CE1(21-273) 3.1.2.- - N 2 NC_000913.3_2222 2.4.2.53 GT2(11-171) 2.4.2.- GT2 N 3 NC_000913.3_2225 2.4.2.43 GT83(3-521) 2.4.2.- GT83 N 3 NC_000913.3_2319 - GT2(4-166) - GT2 N 2 NC_000913.3_2486 - GT51(50-213) - GT51 N 2 NC_000913.3_2525 4.2.2.N1 GH23(299-448) 4.2.2.- GH23 N 3 NC_000913.3_2613 - GH13_27(22-238) - GH0 N 2 NC_000913.3_2652 - GH103(98-390) - GH103 N 2 NC_000913.3_2667 3.2.1.86 GH1(3-470) 3.2.1.- GH1 N 3 NC_000913.3_267 3.2.1.37|3.2.1.55|3.2.1.72 GH43_11(3-303) 3.2.1.- GH43_11 N 3 NC_000913.3_2765 4.2.2.N1 GH102(150-257) 4.2.2.- GH102 N 3 NC_000913.3_2850 3.2.1.86 GH1(5-474) 3.2.1.- GH1 N 3 NC_000913.3_2908 4.2.2.N1 GH23(207-353) 4.2.2.- GH23 N 3 NC_000913.3_2923 - AA7(53-241) - - N 1 NC_000913.3_2959 - AA1(65-285) - - N 1 NC_000913.3_3016 3.2.1.23 GH2(26-886) 3.2.1.- GH2 N 3 NC_000913.3_3020 - GH63(1-780) - GH63+3.2.1.20+3.2.1.84 N 2 NC_000913.3_305 1.1.99.1|1.2.1.8|1.1.99.18|1.1.99.32 AA3_2(2-532) 1.2.1.-+1.1.99.- AA3_2 N 3 NC_000913.3_3070 - CE9(1-146) - - N 1 NC_000913.3_3141 2.4.1.129 GT51(60-228) 2.4.1.- GT51 N 3 NC_000913.3_3325 2.4.1.129|3.4.16.4 GT51(54-229) 2.4.1.-+3.4.16.- GT51 N 3 NC_000913.3_3345 - GH77(148-685) - GH77 N 2 NC_000913.3_3346 2.4.1.1 GT35(92-795) 2.4.1.- GT35 N 3 NC_000913.3_3356 2.4.1.1 GT35(101-810) 2.4.1.- GT35 N 3 NC_000913.3_3357 2.4.1.21|2.4.1.11 GT5(2-474) 2.4.1.- GT5 N 3 NC_000913.3_3359 3.2.1.196|3.2.1.68|3.2.1.41 CBM48(10-100)+GH13_11(173-521) 3.2.1.- CBM48+GH13_11 N 3 NC_000913.3_3360 2.4.1.18 CBM48(124-211)+GH13_9(274-574) 2.4.1.- CBM48+GH13_9 N 3 NC_000913.3_337 3.2.1.23 GH2(40-916) 3.2.1.- GH2 N 3 NC_000913.3_3450 3.2.1.28 GH37(71-545) 3.2.1.- GH37 N 3 NC_000913.3_3462 3.2.1.4 GH8(25-343) 3.2.1.- GH8 N 3 NC_000913.3_3464 2.4.1.12 GT2(276-446) 2.4.1.- GT2 N 3 NC_000913.3_348 3.1.2.12|3.1.1.56 CE1(21-271) 3.1.2.- - N 2 NC_000913.3_3503 - GH73(144-267) - GH73 N 2 NC_000913.3_3504 - GH13_19(226-595) - GH13_19 N 2 NC_000913.3_355 - GT2(34-198) - GT2 N 2 NC_000913.3_3550 - GT2(9-137) - GT2 N 2 NC_000913.3_3555 - GT9(69-306) - GT9 N 2 NC_000913.3_3556 - GT9(76-300) - GT9 N 2 NC_000913.3_3558 - GT9(106-328) - GT9 N 2 NC_000913.3_3559 - GT73(18-257) - GT73+2.4.99.- N 2 NC_000913.3_3561 2.4.1.58 GT8(24-275) 2.4.1.- GT8 N 3 NC_000913.3_3562 - GT8(30-276) - GT8 N 2 NC_000913.3_3563 - GT4(176-321) - GT4 N 2 NC_000913.3_3566 - GT4(189-344) - GT4 N 2 NC_000913.3_3567 - GT9(78-304) - GT9 N 2 NC_000913.3_3568 2.4.99.12|2.4.99.13 GT30(33-211) 2.4.99.- GT30 N 3 NC_000913.3_357 - CE14(20-130) - - N 1 NC_000913.3_3591 3.2.1.177 GH31(239-668) 3.2.1.- GH31 N 3 NC_000913.3_3617 3.2.1.122 GH4(6-182) 3.2.1.- GH4 N 3 NC_000913.3_3654 - CE1(150-384) - - N 1 NC_000913.3_3656 3.2.1.86 GH1(2-459) 3.2.1.- GH1 N 3 NC_000913.3_3720 2.4.1.325 GT56(1-352) 2.4.1.- GT56 N 3 NC_000913.3_3722 2.4.1.180 GT26(62-231) 2.4.1.- GT26 N 3 NC_000913.3_3796 - GH31(229-666) - GH31 N 2 NC_000913.3_395 - CBM34(6-112)+GH13_21(178-492) - CBM34+GH13_21 N 2 NC_000913.3_4037 3.2.1.22 GH4(6-186) 3.2.1.- GH4 N 3 NC_000913.3_4154 3.2.1.10|3.2.1.70|3.2.1.1|3.2.1.93|3.2.1.20 GH13_29(29-371) 3.2.1.- GH13_29 N 3 NC_000913.3_4191 - GH109(2-172) - - N 1 NC_000913.3_4309 4.2.2.N1 GH23(497-622) 4.2.2.- GH23 N 3 NC_000913.3_544 3.2.1.17 GH24(34-156) 3.2.1.- - N 2 NC_000913.3_558 - GT2(165-382) - GT0 N 2 NC_000913.3_576 - CE1(172-386) - - N 1 NC_000913.3_659 3.5.1.25 CE9(5-376) 3.5.1.- CE9 N 3 NC_000913.3_715 - GH38(7-265) - GH38 N 2 NC_000913.3_749 - CE8(90-420) - CE8 N 2 NC_000913.3_87 2.4.1.227 GT28(185-341) 2.4.1.- GT28 N 3 NC_000913.3_93 3.5.1.108 CE11(4-276) 3.5.1.- CE11 N 3 NC_000913.3_980 1.6.5.2|1.6.5.6 AA6(3-194) 1.6.5.- - N 2 NC_000913.3_999 - GT2(78-245) - GT2 N 2 NC_000913.3_2 1.1.1.3|2.7.2.4 - 1.1.1.-+2.7.2.- - N 1 NC_000913.3_3 2.7.1.39 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_4 4.2.3.1 - 4.2.3.- - N 1 NC_000913.3_8 2.2.1.2 - 2.2.1.- - N 1 NC_000913.3_9 2.7.7.75 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_13 3.6.4.10 - 3.6.4.- - N 1 NC_000913.3_23 2.7.1.26|2.7.7.2 - 2.7.1.-+2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_24 6.1.1.5 - 6.1.1.- - N 1 NC_000913.3_25 3.4.23.36 - 3.4.23.- - N 1 NC_000913.3_27 1.17.7.4 - 1.17.7.- - N 1 NC_000913.3_29 1.17.1.8 - 1.17.1.- - N 1 NC_000913.3_30 6.3.5.5 - 6.3.5.- - N 1 NC_000913.3_31 3.5.2.3|2.1.3.2|6.3.5.5 - 6.3.5.-+3.5.2.- - N 1 NC_000913.3_34 4.2.1.149 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_35 6.2.1.48 - 6.2.1.- - N 1 NC_000913.3_36 2.8.3.21 - 2.8.3.- - N 1 NC_000913.3_37 1.3.8.13 - 1.3.8.- - N 1 NC_000913.3_44 1.6.5.2 - 1.6.5.- - N 1 NC_000913.3_46 1.5.1.3 - 1.5.1.- - N 1 NC_000913.3_47 3.6.1.41 - 3.6.1.- - N 1 NC_000913.3_49 2.1.1.182 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_50 1.1.1.262 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_51 5.2.1.8 - 5.2.1.- - N 1 NC_000913.3_56 5.4.99.28|5.4.99.29 - 5.4.99.- - N 1 NC_000913.3_59 5.1.3.4 - 5.1.3.- - N 1 NC_000913.3_60 5.3.1.4 - 5.3.1.- - N 1 NC_000913.3_61 2.7.1.16|2.7.1.33 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_64 7.3.2.3|7.3.2.6|7.3.2.5|7.3.2.2 - 7.3.2.- - N 1 NC_000913.3_70 4.2.1.33 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_71 4.2.1.33 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_72 1.1.1.85|1.1.1.42|1.1.1.87|1.1.1.83|1.1.1.N5|1.1.1.286 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_73 2.3.3.13|2.3.3.14|2.3.3.17|2.3.3.3|2.3.3.19 - 2.3.3.- - N 1 NC_000913.3_75 2.2.1.6 - 2.2.1.- - N 1 NC_000913.3_76 2.2.1.6 - 2.2.1.- - N 1 NC_000913.3_79 2.1.1.199|2.1.1.197 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_81 3.4.16.4 - 3.4.16.- - N 1 NC_000913.3_82 6.3.2.13|6.3.2.7|6.3.2.37|6.3.2.12|6.3.2.17 - 6.3.2.- - N 1 NC_000913.3_84 2.7.8.13|2.7.8.33|2.7.7.74|2.7.8.34 - 2.7.8.- - N 1 NC_000913.3_85 6.3.2.9 - 6.3.2.- - N 1 NC_000913.3_86 2.4.1.129 - 2.4.1.- GT28 N 2 NC_000913.3_88 6.3.2.8 - 6.3.2.- - N 1 NC_000913.3_89 6.3.2.4 - 6.3.2.- - N 1 NC_000913.3_95 7.4.2.4 - 7.4.2.- - N 1 NC_000913.3_99 2.7.1.24 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_100 1.7.1.7 - 1.7.1.- - N 1 NC_000913.3_104 2.4.2.19 - 2.4.2.- - N 1 NC_000913.3_105 3.5.1.28 - 3.5.1.- - N 1 NC_000913.3_109 1.2.4.1 - 1.2.4.- - N 1 NC_000913.3_110 2.3.1.12 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_111 1.8.1.4 - 1.8.1.- - N 1 NC_000913.3_113 4.2.1.3|4.2.1.99 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_115 4.1.1.50 - 4.1.1.- - N 1 NC_000913.3_116 2.5.1.16|2.5.1.22|2.5.1.79 - 2.5.1.- - N 1 NC_000913.3_119 1.1.5.2 - 1.1.5.- - N 1 NC_000913.3_120 2.4.2.8 - 2.4.2.- - N 1 NC_000913.3_121 4.2.1.1 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_126 4.1.1.11 - 4.1.1.- - N 1 NC_000913.3_128 6.3.2.1 - 6.3.2.- - N 1 NC_000913.3_129 2.1.2.11 - 2.1.2.- - N 1 NC_000913.3_138 2.7.7.19 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_143 3.6.4.13 - 3.6.4.- - N 1 NC_000913.3_146 7.2.2.7|7.2.2.16 - 7.2.2.- - N 1 NC_000913.3_149 5.4.3.8 - 5.4.3.- - N 1 NC_000913.3_154 3.2.2.9 - 3.2.2.- - N 1 NC_000913.3_155 3.1.5.1 - 3.1.5.- - N 1 NC_000913.3_156 3.4.21.107 - 3.4.21.- - N 1 NC_000913.3_160 2.3.1.117 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_161 2.7.7.59 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_162 3.4.11.18 - 3.4.11.- - N 1 NC_000913.3_165 2.7.4.22 - 2.7.4.- - N 1 NC_000913.3_167 1.1.1.267 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_168 2.5.1.31|2.5.1.32 - 2.5.1.- - N 1 NC_000913.3_170 2.7.7.41 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_174 2.3.1.191 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_175 4.2.1.59 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_176 2.3.1.129 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_178 3.1.26.4 - 3.1.26.- - N 1 NC_000913.3_179 2.7.7.7 - 2.7.7.- GH13_30 N 2 NC_000913.3_180 2.1.3.15 - 2.1.3.- - N 1 NC_000913.3_181 4.1.1.18 - 4.1.1.- - N 1 NC_000913.3_183 6.3.4.19 - 6.3.4.- - N 1 NC_000913.3_190 6.1.1.15 - 6.1.1.- CBM50+GH25 N 2 NC_000913.3_195 7.3.2.2|7.3.2.1 - 7.3.2.- - N 1 NC_000913.3_196 3.1.3.82|3.1.3.83 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_198 1.1.1.346 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_203 3.1.2.6 - 3.1.2.- - N 1 NC_000913.3_205 3.1.26.4 - 3.1.26.- - N 1 NC_000913.3_206 2.7.7.7 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_210 3.5.1.3 - 3.5.1.- - N 1 NC_000913.3_212 1.3.8.7|1.3.8.8 - 1.3.8.- - N 1 NC_000913.3_213 5.3.1.28 - 5.3.1.- - N 1 NC_000913.3_222 2.7.7.7 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_228 3.4.13.18 - 3.4.13.- - N 1 NC_000913.3_229 2.4.2.22 - 2.4.2.- - N 1 NC_000913.3_235 2.7.2.11 - 2.7.2.- - N 1 NC_000913.3_236 1.2.1.41 - 1.2.1.- - N 1 NC_000913.3_256 2.1.1.10 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_257 7.2.2.7 - 7.2.2.- - N 1 NC_000913.3_265 4.2.1.82 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_269 2.1.3.3 - 2.1.3.- - N 1 NC_000913.3_281 1.2.99.6 - 1.2.99.- - N 1 NC_000913.3_282 1.2.99.6 - 1.2.99.- - N 1 NC_000913.3_283 1.2.99.6|1.2.99.8 - 1.2.99.- - N 1 NC_000913.3_306 1.2.1.8|1.2.1.3|1.2.1.47|1.2.1.5|1.2.1.19|1.2.1.78 - 1.2.1.- - N 1 NC_000913.3_317 2.7.2.2 - 2.7.2.- - N 1 NC_000913.3_319 1.1.1.195|1.1.1.255|1.1.1.2|1.1.1.324|1.1.1.183|1.1.1.1 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_324 4.1.3.30 - 4.1.3.- - N 1 NC_000913.3_326 2.3.3.5|2.3.3.16 - 2.3.3.- - N 1 NC_000913.3_327 4.2.1.79|4.2.1.3 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_328 6.2.1.1|6.2.1.17|6.2.1.33|6.2.1.2|6.2.1.40|6.2.1.36|6.2.1.27|6.2.1.37|6.2.1.3|6.2.1.32 - 6.2.1.- GH1 N 2 NC_000913.3_332 4.2.1.1 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_333 4.2.1.104 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_335 2.3.1.79|2.3.1.18 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_340 1.14.13.127|1.14.13.232|1.14.13.233|1.14.13.220|1.14.13.168 - 1.14.13.- - N 1 NC_000913.3_341 1.13.11.16 - 1.13.11.- - N 1 NC_000913.3_342 3.7.1.14 - 3.7.1.- - N 1 NC_000913.3_343 4.2.1.80|4.2.1.132 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_344 1.2.1.10|1.2.1.87 - 1.2.1.- - N 1 NC_000913.3_345 4.1.3.39|4.1.3.43 - 4.1.3.- - N 1 NC_000913.3_349 1.1.1.1|1.1.1.284|1.1.1.347|1.1.1.354|1.1.1.2|1.1.1.73|1.1.1.306|1.1.1.327 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_359 7.6.2.7 - 7.6.2.- - N 1 NC_000913.3_362 4.2.1.24 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_374 6.3.2.4 - 6.3.2.- - N 1 NC_000913.3_376 3.1.3.1|3.1.3.39 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_378 2.7.7.65 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_379 1.5.1.2 - 1.5.1.- - N 1 NC_000913.3_381 2.7.1.71 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_384 2.4.2.15|2.4.2.3|2.4.2.4|2.4.2.2|2.4.2.1 - 2.4.2.- - N 1 NC_000913.3_392 2.7.13.3 - 2.7.13.- - N 1 NC_000913.3_396 3.1.4.14 - 3.1.4.- - N 1 NC_000913.3_397 2.4.99.17 - 2.4.99.- - N 1 NC_000913.3_398 2.4.2.29 - 2.4.2.- - N 1 NC_000913.3_406 1.1.1.193|3.5.4.26 - 3.5.4.-+1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_407 2.5.1.78 - 2.5.1.- - N 1 NC_000913.3_409 2.7.4.16 - 2.7.4.- - N 1 NC_000913.3_410 3.1.3.27 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_412 2.2.1.7|2.2.1.1 - 2.2.1.- - N 1 NC_000913.3_413 2.5.1.10 - 2.5.1.- - N 1 NC_000913.3_414 3.1.11.6 - 3.1.11.- - N 1 NC_000913.3_415 2.8.1.4 - 2.8.1.- - N 1 NC_000913.3_416 3.5.1.124 - 3.5.1.- - N 1 NC_000913.3_417 1.1.1.169 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_420 2.5.1.141 - 2.5.1.- - N 1 NC_000913.3_423 7.1.1.3 - 7.1.1.- - N 1 NC_000913.3_428 5.2.1.8 - 5.2.1.- - N 1 NC_000913.3_429 3.4.21.92 - 3.4.21.- - N 1 NC_000913.3_431 3.4.21.53 - 3.4.21.- - N 1 NC_000913.3_436 6.3.4.20|6.3.4.19 - 6.3.4.- - N 1 NC_000913.3_441 7.6.2.2 - 7.6.2.- - N 1 NC_000913.3_450 2.3.1.79|2.3.1.18 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_460 2.4.2.7 - 2.4.2.- - N 1 NC_000913.3_461 2.7.7.7 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_465 2.7.4.3 - 2.7.4.- - N 1 NC_000913.3_466 4.99.1.1 - 4.99.1.- - N 1 NC_000913.3_471 3.1.3.5|3.6.1.45 - 3.6.1.-+3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_475 7.2.2.8|7.2.2.9|7.2.2.12|3.6.3.3|7.2.2.15 - 7.2.2.- - N 1 NC_000913.3_476 3.5.1.2 - 3.5.1.- - N 1 NC_000913.3_484 1.1.1.62|1.1.1.119 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_486 7.2.2.7|7.2.2.16 - 7.2.2.- - N 1 NC_000913.3_495 4.3.2.3 - 4.3.2.- - N 1 NC_000913.3_501 3.5.2.5 - 3.5.2.- - N 1 NC_000913.3_503 2.7.1.31|2.7.1.165 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_506 1.1.1.350 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_510 2.7.2.2 - 2.7.2.- - N 1 NC_000913.3_511 6.3.4.18 - 6.3.4.- - N 1 NC_000913.3_512 5.4.99.18 - 5.4.99.- - N 1 NC_000913.3_513 3.6.1.54 - 3.6.1.- - N 1 NC_000913.3_514 5.2.1.8 - 5.2.1.- - N 1 NC_000913.3_515 6.1.1.16 - 6.1.1.- - N 1 NC_000913.3_518 3.5.4.9|1.5.1.5|6.3.4.3|1.5.1.15 - 3.5.4.-+1.5.1.-+1.5.1.- - N 1 NC_000913.3_537 3.1.22.4 - 3.1.22.- - N 1 NC_000913.3_550 3.1.21.4 - 3.1.21.- - N 1 NC_000913.3_554 3.4.23.49|3.4.23.48 - 3.4.23.- - N 1 NC_000913.3_559 2.7.13.3 - 2.7.13.- - N 1 NC_000913.3_570 6.3.2.2 - 6.3.2.- - N 1 NC_000913.3_586 2.7.7.58|6.3.2.14 - 2.7.7.-+6.3.2.- - N 1 NC_000913.3_598 1.11.1.15 - 1.11.1.- - N 1 NC_000913.3_599 1.6.99.3 - 1.6.99.- - N 1 NC_000913.3_606 2.4.2.52 - 2.4.2.- - N 1 NC_000913.3_607 2.7.7.61 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_608 2.8.3.10|4.1.3.6 - 2.8.3.-+4.1.3.- - N 1 NC_000913.3_609 4.1.3.6|4.1.3.34 - 4.1.3.- - N 1 NC_000913.3_615 2.3.1.251 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_618 3.5.1.4|3.5.1.128 - 3.5.1.- - N 1 NC_000913.3_619 3.5.1.4|3.5.1.128 - 3.5.1.- - N 1 NC_000913.3_621 2.8.1.8 - 2.8.1.- - N 1 NC_000913.3_623 2.3.1.181 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_625 3.4.16.4|3.5.2.6 - 3.4.16.- - N 1 NC_000913.3_627 2.4.1.129 - 2.4.1.- - N 1 NC_000913.3_628 3.4.16.4 - 3.4.16.- GH103 N 2 NC_000913.3_629 2.1.1.177 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_631 3.1.3.73 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_632 2.7.7.18 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_635 6.1.1.4 - 6.1.1.- GH13_26 N 2 NC_000913.3_643 3.6.4.10 - 3.6.4.- - N 1 NC_000913.3_644 3.2.2.8|3.2.2.3 - 3.2.2.- - N 1 NC_000913.3_645 7.3.2.2|7.3.2.5|7.3.2.1 - 7.3.2.- - N 1 NC_000913.3_650 2.3.1.269 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_654 2.8.4.3|2.8.4.5 - 2.8.4.- - N 1 NC_000913.3_655 1.3.1.83 - 1.3.1.- - N 1 NC_000913.3_656 6.3.5.4 - 6.3.5.- - N 1 NC_000913.3_660 3.5.99.6 - 3.5.99.- - N 1 NC_000913.3_661 2.7.1.193|2.7.1.208|2.7.1.199 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_663 6.1.1.18 - 6.1.1.- CE8 N 2 NC_000913.3_671 5.4.2.2 - 5.4.2.- CBM48+GH13_9 N 2 NC_000913.3_675 4.1.1.17 - 4.1.1.- - N 1 NC_000913.3_680 7.2.2.6 - 7.2.2.- - N 1 NC_000913.3_691 4.1.99.3 - 4.1.99.- - N 1 NC_000913.3_696 3.5.2.9 - 3.5.2.- - N 1 NC_000913.3_697 4.2.99.18 - 4.2.99.- - N 1 NC_000913.3_703 2.3.3.16 - 2.3.3.- - N 1 NC_000913.3_707 1.3.5.1 - 1.3.5.- - N 1 NC_000913.3_708 1.3.5.1 - 1.3.5.- GT51 N 2 NC_000913.3_709 1.2.4.2|2.3.1.61|4.1.1.71|2.2.1.5 - 1.2.4.-+2.3.1.-+4.1.1.-+2.2.1.- GT2 N 2 NC_000913.3_710 2.3.1.61 - 2.3.1.- GT2 N 2 NC_000913.3_711 6.2.1.5|6.2.1.4|6.2.1.9 - 6.2.1.- GT2 N 2 NC_000913.3_712 6.2.1.5|6.2.1.4|6.2.1.9 - 6.2.1.- - N 1 NC_000913.3_714 2.7.1.202|2.7.1.195 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_716 7.1.1.3|7.1.1.7 - 7.1.1.- - N 1 NC_000913.3_717 7.1.1.3|7.1.1.7 - 7.1.1.- - N 1 NC_000913.3_727 2.5.1.72 - 2.5.1.- - N 1 NC_000913.3_731 2.5.1.54 - 2.5.1.- - N 1 NC_000913.3_732 5.4.2.11|5.4.2.4 - 5.4.2.- - N 1 NC_000913.3_734 2.7.1.6|2.7.1.44 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_735 2.7.7.12 - 2.7.7.- GH3 N 2 NC_000913.3_736 5.1.3.2|5.1.3.7|5.1.3.3|5.1.3.5|5.1.3.25 - 5.1.3.- - N 1 NC_000913.3_737 7.6.2.8 - 7.6.2.- - N 1 NC_000913.3_742 7.3.2.5|7.3.2.2 - 7.3.2.- - N 1 NC_000913.3_744 3.1.1.31 - 3.1.1.- - N 1 NC_000913.3_751 2.8.1.6|2.6.1.62 - 2.6.1.-+2.8.1.- GT2 N 2 NC_000913.3_752 2.8.1.6 - 2.8.1.- - N 1 NC_000913.3_753 2.3.1.47 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_754 2.1.1.197 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_755 6.3.3.3 - 6.3.3.- - N 1 NC_000913.3_758 4.1.99.22 - 4.1.99.- - N 1 NC_000913.3_760 4.6.1.17|2.7.7.77 - 4.6.1.- - N 1 NC_000913.3_762 2.8.1.12 - 2.8.1.- - N 1 NC_000913.3_774 3.6.4.13 - 3.6.4.- - N 1 NC_000913.3_776 3.6.4.12 - 3.6.4.- - N 1 NC_000913.3_778 1.1.1.237 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_784 2.1.1.181 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_786 7.3.2.2|7.3.2.5|7.3.2.1 - 7.3.2.- - N 1 NC_000913.3_799 3.1.3.23|3.1.3.104 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_801 1.97.1.4 - 1.97.1.- - N 1 NC_000913.3_803 2.7.7.80 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_804 2.10.1.1 - 2.10.1.- - N 1 NC_000913.3_805 3.4.19.5|3.5.1.1 - 3.4.19.- - N 1 NC_000913.3_811 2.7.7.65 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_812 2.8.4.4 - 2.8.4.- - N 1 NC_000913.3_816 3.4.16.4|3.5.2.6 - 3.4.16.- - N 1 NC_000913.3_821 3.1.3.23|3.1.3.104 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_832 7.6.2.10 - 7.6.2.- - N 1 NC_000913.3_836 2.1.1.189|2.1.1.37 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_841 7.3.2.2|7.3.2.5|7.3.2.1 - 7.3.2.- - N 1 NC_000913.3_847 4.1.2.48 - 4.1.2.- - N 1 NC_000913.3_850 1.7.99.1 - 1.7.99.- - N 1 NC_000913.3_856 7.3.2.2 - 7.3.2.- - N 1 NC_000913.3_859 3.6.1.3 - 3.6.1.- GT4 N 2 NC_000913.3_861 2.3.2.6 - 2.3.2.- - N 1 NC_000913.3_864 1.8.1.9|1.8.1.19|1.18.1.2 - 1.8.1.- - N 1 NC_000913.3_868 3.6.1.3 - 3.6.1.- - N 1 NC_000913.3_869 6.1.1.11 - 6.1.1.- - N 1 NC_000913.3_870 1.8.5.3 - 1.8.5.- - N 1 NC_000913.3_878 1.97.1.4 - 1.97.1.- - N 1 NC_000913.3_879 2.3.1.54 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_883 2.6.1.52 - 2.6.1.- - N 1 NC_000913.3_884 2.5.1.19 - 2.5.1.- - N 1 NC_000913.3_886 2.7.4.25 - 2.7.4.- - N 1 NC_000913.3_890 7.5.2.6|7.5.2.3|7.5.2.5 - 7.5.2.- - N 1 NC_000913.3_891 2.7.1.130 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_894 2.7.7.38|2.7.7.77 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_904 2.6.1.1|2.6.1.57 - 2.6.1.- - N 1 NC_000913.3_906 6.1.1.22 - 6.1.1.- - N 1 NC_000913.3_907 6.3.4.21 - 6.3.4.- - N 1 NC_000913.3_908 3.4.11.2|3.4.11.14 - 3.4.11.- - N 1 NC_000913.3_909 7.6.2.7 - 7.6.2.- - N 1 NC_000913.3_911 1.14.14.5 - 1.14.14.- - N 1 NC_000913.3_913 1.5.1.38 - 1.5.1.- - N 1 NC_000913.3_921 1.3.5.2 - 1.3.5.- - N 1 NC_000913.3_924 2.1.1.173|2.1.1.264|2.1.1.256 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_925 3.6.3.17 - 3.6.3.- - N 1 NC_000913.3_930 4.2.1.59|5.3.3.14 - 4.2.1.-+5.3.3.- - N 1 NC_000913.3_939 4.2.3.3 - 4.2.3.- - N 1 NC_000913.3_943 2.1.1.191|2.1.1.33 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_944 3.6.1.7 - 3.6.1.- - N 1 NC_000913.3_947 1.12.99.6 - 1.12.99.- - N 1 NC_000913.3_948 1.12.99.6 - 1.12.99.- - N 1 NC_000913.3_953 7.1.1.3|7.1.1.7 - 7.1.1.- - N 1 NC_000913.3_954 7.1.1.3|7.1.1.7 - 7.1.1.- - N 1 NC_000913.3_958 3.1.3.48 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_969 2.7.13.3 - 2.7.13.- - N 1 NC_000913.3_973 1.7.2.3|1.8.5.3 - 1.7.2.-+1.8.5.- - N 1 NC_000913.3_978 3.1.3.10 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_983 1.5.1.42|1.5.1.30 - 1.5.1.- - N 1 NC_000913.3_984 1.1.1.298 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_987 3.5.1.110 - 3.5.1.- - N 1 NC_000913.3_988 1.14.99.46 - 1.14.99.- - N 1 NC_000913.3_990 1.2.1.88|1.5.5.2 - 1.2.1.-+1.5.5.- - N 1 NC_000913.3_1007 1.1.1.79|1.1.1.81 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_1027 2.3.1.241|2.3.1.242 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_1035 3.5.2.3 - 3.5.2.- - N 1 NC_000913.3_1057 3.1.26.12 - 3.1.26.- - N 1 NC_000913.3_1058 5.4.99.24|5.4.99.43 - 5.4.99.- - N 1 NC_000913.3_1062 2.3.1.274 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_1063 2.3.1.180|2.3.1.194 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_1064 2.3.1.39 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_1065 1.1.1.100|1.1.1.252|1.1.1.377|1.1.1.311|1.1.1.223|1.1.1.243|1.1.1.401 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_1067 2.3.1.179|2.3.1.41 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_1070 2.7.4.9 - 2.7.4.- - N 1 NC_000913.3_1071 2.7.7.7 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_1073 2.7.1.199|2.7.1.193 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_1078 2.7.1.89 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_1081 1.6.99.3 - 1.6.99.- - N 1 NC_000913.3_1086 3.6.4.12 - 3.6.4.- - N 1 NC_000913.3_1091 2.7.1.59 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_1098 7.6.2.11|7.6.2.9 - 7.6.2.- - N 1 NC_000913.3_1099 3.4.11.4 - 3.4.11.- - N 1 NC_000913.3_1101 2.7.13.3 - 2.7.13.- - N 1 NC_000913.3_1103 4.3.2.2 - 4.3.2.- - N 1 NC_000913.3_1105 2.8.1.13|2.8.1.14|2.7.1.26|2.7.7.2 - 2.8.1.- - N 1 NC_000913.3_1107 5.4.99.20|5.4.99.22 - 5.4.99.- - N 1 NC_000913.3_1108 1.1.1.42 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_1160 5.1.1.1 - 5.1.1.- - N 1 NC_000913.3_1162 3.4.17.13 - 3.4.17.- GH23 N 2 NC_000913.3_1168 2.7.1.121 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_1170 2.7.1.29|2.7.1.28|4.6.1.15|2.7.1.121 - 4.6.1.-+2.7.1.-+2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_1175 3.1.1.29 - 3.1.1.- - N 1 NC_000913.3_1178 2.7.6.1 - 2.7.6.- - N 1 NC_000913.3_1179 2.7.1.148 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_1181 1.2.1.70 - 1.2.1.- - N 1 NC_000913.3_1183 2.1.1.297 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_1186 2.5.1.55 - 2.5.1.- - N 1 NC_000913.3_1192 4.3.2.7 - 4.3.2.- - N 1 NC_000913.3_1196 2.7.13.3 - 2.7.13.- - N 1 NC_000913.3_1199 1.7.5.1 - 1.7.5.- - N 1 NC_000913.3_1200 1.7.5.1 - 1.7.5.- - N 1 NC_000913.3_1202 1.7.5.1 - 1.7.5.- - N 1 NC_000913.3_1204 3.5.1.10 - 3.5.1.- - N 1 NC_000913.3_1208 2.7.7.9 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_1210 2.7.1.21 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_1213 1.1.1.1|1.2.1.10|1.2.1.3|1.2.1.76 - 1.1.1.-+1.2.1.- - N 1 NC_000913.3_1234 4.2.1.20 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_1235 4.2.1.20 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_1236 5.3.1.24|4.1.1.48 - 4.1.1.-+5.3.1.- - N 1 NC_000913.3_1237 2.4.2.18|4.1.3.27 - 4.1.3.-+2.4.2.- - N 1 NC_000913.3_1238 4.1.3.27 - 4.1.3.- - N 1 NC_000913.3_1239 3.1.3.97 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_1242 5.4.99.22 - 5.4.99.- - N 1 NC_000913.3_1243 2.5.1.17 - 2.5.1.- - N 1 NC_000913.3_1247 5.99.1.2 - 5.99.1.- - N 1 NC_000913.3_1252 4.2.1.3|4.2.1.99|4.2.1.117 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_1253 3.5.4.25|4.1.99.12 - 3.5.4.- - N 1 NC_000913.3_1257 4.1.1.23 - 4.1.1.- - N 1 NC_000913.3_1263 3.1.13.1 - 3.1.13.- - N 1 NC_000913.3_1265 1.3.1.9 - 1.3.1.- - N 1 NC_000913.3_1274 3.5.1.94 - 3.5.1.- - N 1 NC_000913.3_1278 2.6.1.19|2.6.1.22|2.6.1.48 - 2.6.1.- - N 1 NC_000913.3_1294 7.6.2.10 - 7.6.2.- - N 1 NC_000913.3_1300 1.11.1.15 - 1.11.1.- - N 1 NC_000913.3_1312 2.1.1.63 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_1318 2.7.7.65 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_1321 3.6.4.13 - 3.6.4.- - N 1 NC_000913.3_1353 1.2.7.1 - 1.2.7.- GT2 N 2 NC_000913.3_1361 1.2.1.32|1.2.1.39|1.2.1.3 - 1.2.1.- - N 1 NC_000913.3_1362 1.4.3.21 - 1.4.3.- - N 1 NC_000913.3_1369 4.2.1.17 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_1373 2.3.1.174|2.3.1.16|2.3.1.223 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_1374 6.2.1.30 - 6.2.1.- - N 1 NC_000913.3_1389 3.6.4.13 - 3.6.4.- GH5_12 N 2 NC_000913.3_1391 1.2.1.89|1.2.1.21|1.2.1.22 - 1.2.1.- - N 1 NC_000913.3_1394 1.2.1.12|1.2.1.13|1.2.1.59 - 1.2.1.- - N 1 NC_000913.3_1418 7.3.2.3|7.3.2.6|7.3.2.5|7.3.2.2 - 7.3.2.- - N 1 NC_000913.3_1421 1.2.1.19 - 1.2.1.- - N 1 NC_000913.3_1439 2.3.1.5|2.3.1.118 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_1441 1.7.5.1 - 1.7.5.- - N 1 NC_000913.3_1443 1.7.5.1 - 1.7.5.- - N 1 NC_000913.3_1444 1.7.5.1 - 1.7.5.- - N 1 NC_000913.3_1450 1.17.1.9 - 1.17.1.- - N 1 NC_000913.3_1451 1.17.1.9 - 1.17.1.- - N 1 NC_000913.3_1455 1.1.1.1 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_1456 1.1.1.38|1.1.1.40 - 1.1.1.- GT4 N 2 NC_000913.3_1460 7.4.2.5|7.4.2.1|7.4.2.7 - 7.4.2.- - N 1 NC_000913.3_1467 2.7.7.65 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_1470 4.1.1.15 - 4.1.1.- - N 1 NC_000913.3_1483 2.7.11.1 - 2.7.11.- - N 1 NC_000913.3_1487 2.7.1.189 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_1489 3.6.3.17 - 3.6.3.- - N 1 NC_000913.3_1493 2.3.1.245 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_1494 5.3.1.32 - 5.3.1.- - N 1 NC_000913.3_1495 2.1.1.144 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_1497 1.1.1.58 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_1498 2.7.7.65 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_1500 3.5.1.2 - 3.5.1.- - N 1 NC_000913.3_1501 1.2.1.79|1.2.1.16|1.2.1.3|1.2.1.4 - 1.2.1.- - N 1 NC_000913.3_1515 3.4.15.5 - 3.4.15.- - N 1 NC_000913.3_1516 1.1.1.298|1.1.1.381|1.1.1.1 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_1557 4.2.1.8|4.2.1.39 - 4.2.1.- GH43_12 N 2 NC_000913.3_1560 2.3.1.57 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_1563 1.8.5.3 - 1.8.5.- - N 1 NC_000913.3_1564 1.8.5.3 - 1.8.5.- - N 1 NC_000913.3_1569 6.3.3.3 - 6.3.3.- - N 1 NC_000913.3_1578 7.1.1.1 - 7.1.1.- - N 1 NC_000913.3_1579 7.1.1.1 - 7.1.1.- - N 1 NC_000913.3_1582 1.5.1.3 - 1.5.1.- - N 1 NC_000913.3_1587 4.2.1.2 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_1588 4.2.1.2|5.3.2.2|4.2.1.81 - 5.3.2.-+4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_1589 5.3.1.8 - 5.3.1.- - N 1 NC_000913.3_1598 2.7.1.193|2.7.1.208|2.7.1.199 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_1599 4.4.1.13 - 4.4.1.- - N 1 NC_000913.3_1600 3.5.4.4 - 3.5.4.- - N 1 NC_000913.3_1610 4.2.99.18 - 4.2.99.- - N 1 NC_000913.3_1614 2.7.1.35 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_1615 6.1.1.1 - 6.1.1.- - N 1 NC_000913.3_1616 1.4.3.5 - 1.4.3.- - N 1 NC_000913.3_1618 2.7.1.170 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_1624 1.15.1.1 - 1.15.1.- - N 1 NC_000913.3_1629 4.4.1.5 - 4.4.1.- - N 1 NC_000913.3_1634 1.15.1.1 - 1.15.1.- - N 1 NC_000913.3_1640 2.1.1.317|2.1.1.79 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_1641 2.5.1.9 - 2.5.1.- - N 1 NC_000913.3_1650 1.2.7.5 - 1.2.7.- - N 1 NC_000913.3_1652 4.2.1.2 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_1653 2.7.1.40 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_1657 2.8.1.7|4.4.1.16 - 4.4.1.-+2.8.1.- - N 1 NC_000913.3_1669 1.1.1.282|1.1.1.25 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_1670 4.2.1.10 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_1671 2.8.3.8|2.8.3.23 - 2.8.3.- - N 1 NC_000913.3_1672 1.3.8.13 - 1.3.8.- - N 1 NC_000913.3_1680 2.7.9.2 - 2.7.9.- - N 1 NC_000913.3_1681 2.7.4.28|2.7.11.33 - 2.7.11.-+2.7.4.- - N 1 NC_000913.3_1682 2.5.1.54 - 2.5.1.- - N 1 NC_000913.3_1684 2.7.7.N1 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_1687 7.6.2.8 - 7.6.2.- - N 1 NC_000913.3_1688 1.11.1.15|1.11.1.9 - 1.11.1.- - N 1 NC_000913.3_1691 6.1.1.20 - 6.1.1.- - N 1 NC_000913.3_1692 6.1.1.20 - 6.1.1.- - N 1 NC_000913.3_1696 6.1.1.3 - 6.1.1.- GH28 N 2 NC_000913.3_1701 2.7.1.56|2.7.1.11 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_1705 3.1.3.22|3.1.3.23|3.1.3.50|3.1.3.68 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_1710 1.11.1.6 - 1.11.1.- - N 1 NC_000913.3_1711 3.5.1.105 - 3.5.1.- CE0 N 2 NC_000913.3_1716 2.7.1.205|2.7.1.196 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_1718 6.3.1.5 - 6.3.1.- - N 1 NC_000913.3_1722 3.5.1.96 - 3.5.1.- - N 1 NC_000913.3_1723 3.5.3.23 - 3.5.3.- - N 1 NC_000913.3_1724 1.2.1.71|1.2.1.3 - 1.2.1.- - N 1 NC_000913.3_1725 2.3.1.109 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_1726 2.6.1.11|2.6.1.81|2.6.1.17 - 2.6.1.- - N 1 NC_000913.3_1727 3.1.11.2 - 3.1.11.- - N 1 NC_000913.3_1739 1.4.1.4|1.4.1.2|1.4.1.3 - 1.4.1.- - N 1 NC_000913.3_1741 5.99.1.2 - 5.99.1.- GH23 N 2 NC_000913.3_1742 2.7.9.3 - 2.7.9.- - N 1 NC_000913.3_1745 3.5.1.1|3.1.1.5|3.1.1.47 - 3.5.1.- - N 1 NC_000913.3_1756 1.8.4.12 - 1.8.4.- - N 1 NC_000913.3_1757 1.2.1.12|1.2.1.13|1.2.1.59 - 1.2.1.- - N 1 NC_000913.3_1758 5.1.3.15 - 5.1.3.- - N 1 NC_000913.3_1777 1.1.1.83|1.1.1.93|4.1.1.73 - 4.1.1.- - N 1 NC_000913.3_1779 1.14.13.239 - 1.14.13.- - N 1 NC_000913.3_1780 1.14.13.239 - 1.14.13.- - N 1 NC_000913.3_1781 3.1.13.5 - 3.1.13.- - N 1 NC_000913.3_1782 6.2.1.3 - 6.2.1.- - N 1 NC_000913.3_1785 3.6.4.12 - 3.6.4.- - N 1 NC_000913.3_1789 2.6.1.85 - 2.6.1.- - N 1 NC_000913.3_1791 4.3.1.17 - 4.3.1.- - N 1 NC_000913.3_1794 2.7.1.206|2.7.1.191 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_1806 3.4.21.102 - 3.4.21.- - N 1 NC_000913.3_1811 2.1.1.178 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_1814 3.1.3.16 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_1827 4.1.2.14|4.1.3.16 - 4.1.2.-+4.1.3.- - N 1 NC_000913.3_1828 4.2.1.12 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_1829 1.1.1.49|1.1.1.363 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_1832 2.7.1.40 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_1833 2.3.1.243 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_1838 3.6.4.12 - 3.6.4.- - N 1 NC_000913.3_1839 3.6.4.12 - 3.6.4.- - N 1 NC_000913.3_1841 3.1.22.4 - 3.1.22.- - N 1 NC_000913.3_1844 6.1.1.23|6.1.1.12 - 6.1.1.- GT83 N 2 NC_000913.3_1850 1.7.2.3|1.8.5.3 - 1.7.2.-+1.8.5.- - N 1 NC_000913.3_1854 6.1.1.19 - 6.1.1.- - N 1 NC_000913.3_1861 3.1.1.61|3.5.1.44 - 3.5.1.-+3.1.1.- - N 1 NC_000913.3_1862 2.1.1.80 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_1866 2.7.13.3 - 2.7.13.- - N 1 NC_000913.3_1875 3.1.3.12|3.1.3.27 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_1877 3.6.3.17 - 3.6.3.- - N 1 NC_000913.3_1882 1.16.3.2 - 1.16.3.- - N 1 NC_000913.3_1886 2.7.8.5 - 2.7.8.- - N 1 NC_000913.3_1891 7.3.2.2|7.3.2.5|7.3.2.1 - 7.3.2.- - N 1 NC_000913.3_1893 4.4.1.15 - 4.4.1.- - N 1 NC_000913.3_1913 7.1.2.2 - 7.1.2.- - N 1 NC_000913.3_1926 3.1.3.70|3.1.3.85|3.1.3.18|3.1.3.104 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_1927 2.7.7.65 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_1932 2.1.1.37 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_1938 3.5.1.124|4.2.1.130 - 3.5.1.- - N 1 NC_000913.3_1941 3.5.2.17 - 3.5.2.- - N 1 NC_000913.3_1957 2.4.2.21 - 2.4.2.- - N 1 NC_000913.3_1958 2.7.8.26 - 2.7.8.- - N 1 NC_000913.3_1959 2.7.1.156|2.7.7.62 - 2.7.1.-+2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_1975 3.4.16.4 - 3.4.16.- - N 1 NC_000913.3_1976 3.1.11.1 - 3.1.11.- - N 1 NC_000913.3_1984 2.4.2.17 - 2.4.2.- - N 1 NC_000913.3_1985 3.5.4.19|3.6.1.31|1.1.1.23 - 1.1.1.-+3.5.4.-+3.6.1.- - N 1 NC_000913.3_1986 2.6.1.9|1.1.1.23 - 2.6.1.- - N 1 NC_000913.3_1987 3.1.3.15|4.2.1.19 - 3.1.3.-+4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_1988 3.5.1.2|4.3.2.10 - 3.5.1.-+4.3.2.- - N 1 NC_000913.3_1989 5.3.1.16 - 5.3.1.- - N 1 NC_000913.3_1990 4.3.2.10 - 4.3.2.- - N 1 NC_000913.3_1991 3.5.4.19|3.6.1.31 - 3.6.1.-+3.5.4.- - N 1 NC_000913.3_1993 1.1.1.22 - 1.1.1.- GT4 N 2 NC_000913.3_1994 1.1.1.44|1.1.1.343 - 1.1.1.- GT30 N 2 NC_000913.3_2004 5.1.3.13 - 5.1.3.- - N 1 NC_000913.3_2005 2.7.7.24 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_2006 1.1.1.133 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2007 4.2.1.46 - 4.2.1.- GT2 N 2 NC_000913.3_2008 2.7.7.9 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_2013 2.7.8.31|2.7.8.40|2.7.8.6|2.7.8.36 - 2.7.8.- - N 1 NC_000913.3_2014 5.4.2.8|5.4.2.2 - 5.4.2.- - N 1 NC_000913.3_2015 2.7.7.13|5.3.1.8 - 2.7.7.-+5.3.1.- GT4 N 2 NC_000913.3_2018 1.1.1.271 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2019 4.2.1.47 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_2027 3.1.3.48 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_2031 3.5.4.13 - 3.5.4.- - N 1 NC_000913.3_2032 2.7.1.48 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_2056 1.1.1.103|1.1.1.251|1.1.1.401 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2059 2.7.1.200 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_2062 4.1.2.40 - 4.1.2.- - N 1 NC_000913.3_2063 4.1.2.13 - 4.1.2.- - N 1 NC_000913.3_2069 2.7.1.49|2.7.4.7|2.5.1.3 - 2.7.4.-+2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_2070 2.7.1.50 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_2080 6.1.1.10 - 6.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2093 2.7.13.3 - 2.7.13.- - N 1 NC_000913.3_2097 7.6.2.7 - 7.6.2.- - N 1 NC_000913.3_2101 1.1.5.12 - 1.1.5.- - N 1 NC_000913.3_2110 3.5.4.5 - 3.5.4.- - N 1 NC_000913.3_2113 1.3.1.1 - 1.3.1.- - N 1 NC_000913.3_2114 1.3.1.1 - 1.3.1.- - N 1 NC_000913.3_2116 3.6.3.17 - 3.6.3.- - N 1 NC_000913.3_2120 3.5.4.16 - 3.5.4.- - N 1 NC_000913.3_2126 3.1.21.2 - 3.1.21.- - N 1 NC_000913.3_2129 3.2.2.8|3.2.2.3 - 3.2.2.- - N 1 NC_000913.3_2132 4.2.1.70|2.7.1.83 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_2134 2.7.1.202 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_2135 2.7.1.56|2.7.1.11 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_2148 7.4.2.5|7.4.2.1|7.4.2.7 - 7.4.2.- - N 1 NC_000913.3_2151 5.4.99.19 - 5.4.99.- - N 1 NC_000913.3_2167 7.6.2.5 - 7.6.2.- - N 1 NC_000913.3_2172 1.9.6.1 - 1.9.6.- - N 1 NC_000913.3_2177 1.1.5.4 - 1.1.5.- - N 1 NC_000913.3_2179 1.14.11.33 - 1.14.11.- - N 1 NC_000913.3_2180 2.1.1.63|2.1.1.N11 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2181 2.7.1.180 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_2185 2.7.13.3 - 2.7.13.- - N 1 NC_000913.3_2186 2.7.13.3 - 2.7.13.- - N 1 NC_000913.3_2188 2.8.3.8 - 2.8.3.- - N 1 NC_000913.3_2189 2.8.3.8|2.8.3.9 - 2.8.3.- - N 1 NC_000913.3_2191 2.3.1.9|2.3.1.16 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_2198 5.99.1.3 - 5.99.1.- - N 1 NC_000913.3_2199 2.1.1.64|2.1.1.222|2.1.1.114 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2201 1.17.4.1 - 1.17.4.- - N 1 NC_000913.3_2202 1.17.4.1 - 1.17.4.- - N 1 NC_000913.3_2206 3.1.4.46 - 3.1.4.- - N 1 NC_000913.3_2208 1.1.5.3 - 1.1.5.- - N 1 NC_000913.3_2209 1.1.5.3 - 1.1.5.- - N 1 NC_000913.3_2213 4.1.2.52|4.1.2.53 - 4.1.2.- - N 1 NC_000913.3_2215 4.2.1.90 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_2219 3.6.1.23|3.6.1.12|3.6.1.9 - 3.6.1.- - N 1 NC_000913.3_2221 2.6.1.87|2.6.1.102|2.6.1.100|2.6.1.101|2.6.1.98|2.6.1.106 - 2.6.1.- - N 1 NC_000913.3_2223 1.1.1.305|2.1.2.13|1.1.1.338 - 2.1.2.-+1.1.1.- GT83 N 2 NC_000913.3_2224 3.5.1.N3 - 3.5.1.- - N 1 NC_000913.3_2229 6.2.1.26 - 6.2.1.- - N 1 NC_000913.3_2230 4.2.1.113 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_2231 4.1.3.36 - 4.1.3.- - N 1 NC_000913.3_2232 4.2.99.20 - 4.2.99.- - N 1 NC_000913.3_2233 2.2.1.9 - 2.2.1.- - N 1 NC_000913.3_2237 3.1.26.11 - 3.1.26.- - N 1 NC_000913.3_2247 7.1.1.2 - 7.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2253 1.12.1.2|1.12.1.3 - 1.12.1.- - N 1 NC_000913.3_2260 2.6.1.2|2.6.1.1 - 2.6.1.- - N 1 NC_000913.3_2261 3.1.3.89 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_2266 2.7.2.1|2.7.2.15 - 2.7.2.- - N 1 NC_000913.3_2267 2.3.1.8|2.3.1.184 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_2276 7.3.2.2 - 7.3.2.- - N 1 NC_000913.3_2281 2.5.1.129 - 2.5.1.- - N 1 NC_000913.3_2282 2.4.2.14 - 2.4.2.- GH103 N 2 NC_000913.3_2285 6.3.2.12|6.3.2.17 - 6.3.2.- - N 1 NC_000913.3_2286 2.1.3.15 - 2.1.3.- - N 1 NC_000913.3_2288 5.4.99.12 - 5.4.99.- - N 1 NC_000913.3_2290 1.1.1.290 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2293 2.3.1.41 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_2294 2.1.1.61 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2299 4.2.3.5 - 4.2.3.- - N 1 NC_000913.3_2300 2.1.1.298|2.1.1.297 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2311 4.2.1.17|1.1.1.35|5.1.2.3|4.2.1.18|1.1.1.211|4.2.1.56|4.2.1.116 - 5.1.2.-+1.1.1.-+4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_2312 2.3.1.16 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_2335 4.3.1.18 - 4.3.1.- - N 1 NC_000913.3_2339 2.7.13.3 - 2.7.13.- - N 1 NC_000913.3_2340 2.8.3.19|2.8.3.20 - 2.8.3.- - N 1 NC_000913.3_2342 4.1.1.8 - 4.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2343 2.8.3.16 - 2.8.3.- - N 1 NC_000913.3_2347 2.3.1.241|2.3.1.242 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_2352 2.7.3.9|2.7.1.202 - 2.7.1.-+2.7.3.- - N 1 NC_000913.3_2356 2.7.1.202 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_2357 2.7.1.2 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_2367 6.1.1.17 - 6.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2375 6.5.1.2 - 6.5.1.- - N 1 NC_000913.3_2378 4.4.1.9|2.5.1.47 - 2.5.1.-+4.4.1.- - N 1 NC_000913.3_2380 2.7.3.9 - 2.7.3.- - N 1 NC_000913.3_2382 2.7.1.35 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_2386 7.3.2.3|7.3.2.6|7.3.2.5|7.3.2.2 - 7.3.2.- - N 1 NC_000913.3_2392 4.2.1.126 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_2393 2.7.1.192 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_2399 3.5.1.28 - 3.5.1.- - N 1 NC_000913.3_2400 1.3.3.3 - 1.3.3.- - N 1 NC_000913.3_2404 4.3.1.7 - 4.3.1.- - N 1 NC_000913.3_2405 4.3.1.7 - 4.3.1.- - N 1 NC_000913.3_2422 2.3.1.8 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_2423 2.5.1.17 - 2.5.1.- - N 1 NC_000913.3_2427 1.1.1.40|1.1.1.38|1.1.1.169|1.1.1.39 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2428 2.2.1.2 - 2.2.1.- - N 1 NC_000913.3_2429 2.2.1.1|2.2.1.3 - 2.2.1.- - N 1 NC_000913.3_2432 1.4.1.13 - 1.4.1.- - N 1 NC_000913.3_2433 2.7.13.3 - 2.7.13.- - N 1 NC_000913.3_2436 3.5.1.18 - 3.5.1.- - N 1 NC_000913.3_2439 2.3.1.193 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_2441 6.3.2.6 - 6.3.2.- - N 1 NC_000913.3_2444 4.3.3.7 - 4.3.3.- - N 1 NC_000913.3_2446 1.11.1.15 - 1.11.1.- - N 1 NC_000913.3_2464 2.4.2.9 - 2.4.2.- - N 1 NC_000913.3_2465 2.1.2.2|6.3.3.1|6.3.4.13 - 6.3.3.-+2.1.2.- - N 1 NC_000913.3_2466 2.1.2.2|6.3.3.1|6.3.4.13 - 2.1.2.- - N 1 NC_000913.3_2467 2.7.4.1 - 2.7.4.- - N 1 NC_000913.3_2474 6.3.5.2 - 6.3.5.- - N 1 NC_000913.3_2475 1.1.1.205 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2476 3.1.11.6 - 3.1.11.- - N 1 NC_000913.3_2481 6.1.1.21 - 6.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2482 1.17.7.3 - 1.17.7.- - N 1 NC_000913.3_2484 2.1.1.192|2.1.1.184 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2485 2.7.4.6 - 2.7.4.- - N 1 NC_000913.3_2488 2.8.1.2 - 2.8.1.- - N 1 NC_000913.3_2490 3.4.11.23|3.4.11.1|3.4.11.10 - 3.4.11.- - N 1 NC_000913.3_2493 3.6.4.10 - 3.6.4.- - N 1 NC_000913.3_2497 2.8.1.7 - 2.8.1.- - N 1 NC_000913.3_2499 2.1.1.200 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2500 3.1.3.25|3.1.3.11 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_2505 1.14.12.19 - 1.14.12.- - N 1 NC_000913.3_2506 1.14.12.19 - 1.14.12.- - N 1 NC_000913.3_2508 1.3.1.87 - 1.3.1.- - N 1 NC_000913.3_2509 1.18.1.3 - 1.18.1.- - N 1 NC_000913.3_2514 3.6.3.17 - 3.6.3.- - N 1 NC_000913.3_2518 2.1.2.1|4.1.2.48 - 2.1.2.- GH13_11 N 2 NC_000913.3_2519 1.14.12.17 - 1.14.12.- - N 1 NC_000913.3_2523 2.7.13.3 - 2.7.13.- - N 1 NC_000913.3_2524 6.3.5.3 - 6.3.5.- - N 1 NC_000913.3_2526 3.5.4.33|1.1.1.193|3.5.4.26 - 3.5.4.- - N 1 NC_000913.3_2527 3.1.3.12|3.1.3.27 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_2530 2.7.8.7 - 2.7.8.- - N 1 NC_000913.3_2531 2.6.99.2 - 2.6.99.- - N 1 NC_000913.3_2534 3.1.26.3 - 3.1.26.- - N 1 NC_000913.3_2535 3.4.21.89 - 3.4.21.- - N 1 NC_000913.3_2536 3.6.5.N1 - 3.6.5.- GH28 N 2 NC_000913.3_2541 1.4.3.16 - 1.4.3.- - N 1 NC_000913.3_2542 2.1.1.223|2.1.1.309|2.1.1.172 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2543 3.6.4.13 - 3.6.4.- - N 1 NC_000913.3_2546 2.3.1.54 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_2547 3.2.2.27 - 3.2.2.- - N 1 NC_000913.3_2552 2.7.8.8 - 2.7.8.- - N 1 NC_000913.3_2557 3.6.1.3 - 3.6.1.- GT4 N 2 NC_000913.3_2559 5.4.99.23 - 5.4.99.- - N 1 NC_000913.3_2562 4.2.1.51|5.4.99.5 - 5.4.99.-+4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_2563 1.3.1.12|5.4.99.5 - 1.3.1.-+5.4.99.- - N 1 NC_000913.3_2564 2.5.1.54 - 2.5.1.- - N 1 NC_000913.3_2570 2.1.1.228 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2577 2.7.1.23|2.7.1.86 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_2599 1.20.4.1 - 1.20.4.- - N 1 NC_000913.3_2615 1.1.99.2 - 1.1.99.- - N 1 NC_000913.3_2616 1.2.1.24|1.2.1.16|1.2.1.79|1.2.1.26|1.2.1.97 - 1.2.1.- - N 1 NC_000913.3_2617 2.6.1.19|2.6.1.22|2.6.1.48 - 2.6.1.- - N 1 NC_000913.3_2630 1.17.4.1 - 1.17.4.- - N 1 NC_000913.3_2631 1.17.4.1 - 1.17.4.- - N 1 NC_000913.3_2632 7.6.2.9 - 7.6.2.- - N 1 NC_000913.3_2642 4.4.1.21 - 4.4.1.- - N 1 NC_000913.3_2643 6.3.2.2 - 6.3.2.- - N 1 NC_000913.3_2648 6.1.1.7 - 6.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2651 3.5.1.42 - 3.5.1.- - N 1 NC_000913.3_2654 2.7.1.198 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_2659 5.3.1.13 - 5.3.1.- - N 1 NC_000913.3_2686 3.1.3.16 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_2688 1.1.1.411|1.1.1.60 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2689 2.7.1.217|2.7.1.219 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_2690 4.1.1.104 - 4.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2695 2.1.1.77 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2696 3.1.3.5|3.1.3.6|3.6.1.11 - 3.6.1.-+3.1.3.-+3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_2697 5.4.99.27 - 5.4.99.- - N 1 NC_000913.3_2698 2.7.7.60|4.6.1.12 - 4.6.1.-+2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_2699 2.7.7.60 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_2702 2.7.7.4|2.7.1.25 - 2.7.1.-+2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_2703 2.7.7.4|2.7.1.25 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_2704 2.7.7.4 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_2714 1.8.4.8 - 1.8.4.- - N 1 NC_000913.3_2715 1.8.1.2 - 1.8.1.- - N 1 NC_000913.3_2716 1.8.1.2 - 1.8.1.- - N 1 NC_000913.3_2731 4.2.1.11 - 4.2.1.- GH13_31 N 2 NC_000913.3_2732 6.3.4.2 - 6.3.4.- - N 1 NC_000913.3_2733 3.6.1.8|3.6.1.1|3.6.1.9 - 3.6.1.- - N 1 NC_000913.3_2736 2.7.6.5 - 2.7.6.- - N 1 NC_000913.3_2737 2.1.1.190|2.1.1.228 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2738 2.7.13.3 - 2.7.13.- - N 1 NC_000913.3_2739 4.2.1.40 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_2740 4.2.1.40 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_2743 5.4.99.26 - 5.4.99.- - N 1 NC_000913.3_2746 1.7.1.13 - 1.7.1.- - N 1 NC_000913.3_2749 4.3.1.17 - 4.3.1.- - N 1 NC_000913.3_2752 4.1.2.17 - 4.1.2.- - N 1 NC_000913.3_2754 5.3.1.25|5.3.1.3 - 5.3.1.- - N 1 NC_000913.3_2755 2.7.1.51 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_2756 5.1.3.29 - 5.1.3.- - N 1 NC_000913.3_2758 2.1.1.186 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2762 2.8.1.7 - 2.8.1.- - N 1 NC_000913.3_2766 3.5.1.28 - 3.5.1.- - N 1 NC_000913.3_2767 2.3.1.1 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_2768 3.1.11.5 - 3.1.11.- - N 1 NC_000913.3_2769 3.1.11.5 - 3.1.11.- - N 1 NC_000913.3_2770 3.4.24.55 - 3.4.24.- - N 1 NC_000913.3_2771 3.1.11.5 - 3.1.11.- - N 1 NC_000913.3_2776 2.1.1.45|1.5.1.3 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2777 2.5.1.145 - 2.5.1.- - N 1 NC_000913.3_2778 2.7.3.9 - 2.7.3.- - N 1 NC_000913.3_2786 2.3.1.40|6.2.1.20 - 2.3.1.-+6.2.1.- - N 1 NC_000913.3_2788 4.1.1.20 - 4.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2792 1.1.1.127|1.1.1.1|1.1.1.14|1.1.1.159 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2793 5.3.1.17 - 5.3.1.- - N 1 NC_000913.3_2794 2.3.1.9|2.3.1.16 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_2815 1.17.1.4 - 1.17.1.- - N 1 NC_000913.3_2816 1.17.1.4 - 1.17.1.- - N 1 NC_000913.3_2817 1.17.1.4|1.17.3.2|1.17.1.5 - 1.17.1.- - N 1 NC_000913.3_2819 2.1.3.2 - 2.1.3.- - N 1 NC_000913.3_2820 4.3.1.15 - 4.3.1.- - N 1 NC_000913.3_2823 2.7.2.2 - 2.7.2.- - N 1 NC_000913.3_2835 1.4.1.13 - 1.4.1.- - N 1 NC_000913.3_2838 5.3.3.2 - 5.3.3.- - N 1 NC_000913.3_2839 2.3.2.3|6.1.1.6 - 6.1.1.-+2.3.2.- - N 1 NC_000913.3_2852 1.4.4.2 - 1.4.4.- - N 1 NC_000913.3_2854 2.1.2.10 - 2.1.2.- - N 1 NC_000913.3_2857 3.4.11.9|3.4.11.26 - 3.4.11.- - N 1 NC_000913.3_2860 6.3.3.2 - 6.3.3.- - N 1 NC_000913.3_2861 1.1.1.95|1.1.1.399 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2862 5.3.1.6 - 5.3.1.- - N 1 NC_000913.3_2865 5.4.99.2 - 5.4.99.- - N 1 NC_000913.3_2868 3.1.2.1 - 3.1.2.- - N 1 NC_000913.3_2873 4.1.2.13 - 4.1.2.- - N 1 NC_000913.3_2874 2.7.2.3 - 2.7.2.- - N 1 NC_000913.3_2875 1.2.1.72 - 1.2.1.- - N 1 NC_000913.3_2877 4.2.1.2 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_2878 3.1.3.11 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_2880 2.7.1.197 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_2882 2.2.1.1|2.2.1.3 - 2.2.1.- - N 1 NC_000913.3_2884 3.5.3.11 - 3.5.3.- - N 1 NC_000913.3_2885 4.1.1.19 - 4.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2887 2.5.1.6 - 2.5.1.- - N 1 NC_000913.3_2890 3.1.21.1 - 3.1.21.- - N 1 NC_000913.3_2891 2.1.1.193 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2892 6.3.2.3 - 6.3.2.- - N 1 NC_000913.3_2899 3.6.1.66 - 3.6.1.- - N 1 NC_000913.3_2902 3.5.1.1 - 3.5.1.- - N 1 NC_000913.3_2905 2.1.1.33 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2906 3.2.2.31 - 3.2.2.- - N 1 NC_000913.3_2910 4.1.1.17 - 4.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2919 2.3.3.9 - 2.3.3.- - N 1 NC_000913.3_2932 6.3.1.9|3.5.1.78|6.3.1.8 - 6.3.1.- - N 1 NC_000913.3_2938 1.12.2.1 - 1.12.2.- - N 1 NC_000913.3_2951 4.4.1.13|4.4.1.28 - 4.4.1.- - N 1 NC_000913.3_2955 1.1.1.346|1.1.1.274|1.1.1.283 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_2960 2.3.1.51|2.3.1.N4 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_2961 5.99.1.3 - 5.99.1.- - N 1 NC_000913.3_2968 2.7.13.3 - 2.7.13.- - N 1 NC_000913.3_2971 5.99.1.3 - 5.99.1.- - N 1 NC_000913.3_2982 4.1.99.12 - 4.1.99.- - N 1 NC_000913.3_2993 2.7.7.70|2.7.1.167 - 2.7.1.-+2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_2994 2.7.7.42|2.7.7.89 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_2997 2.7.7.72 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_2998 3.6.1.27 - 3.6.1.- - N 1 NC_000913.3_3000 2.3.1.275|2.3.1.15|2.3.1.N5 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_3002 4.2.1.32 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_3003 4.2.1.32 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_3005 2.3.1.234 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_3009 3.2.2.28 - 3.2.2.- - N 1 NC_000913.3_3013 2.6.1.82 - 2.6.1.- - N 1 NC_000913.3_3024 2.1.1.174 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3031 4.2.1.7 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_3032 5.3.1.12 - 5.3.1.- - N 1 NC_000913.3_3042 2.5.1.18|1.8.5.1 - 1.8.5.-+2.5.1.- - N 1 NC_000913.3_3050 4.3.1.17 - 4.3.1.- - N 1 NC_000913.3_3051 3.5.99.10 - 3.5.99.- - N 1 NC_000913.3_3052 2.3.1.54 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_3053 2.7.2.1|2.7.2.15 - 2.7.2.- - N 1 NC_000913.3_3055 4.3.1.19|4.3.1.17 - 4.3.1.- - N 1 NC_000913.3_3059 2.7.1.31|2.7.1.165 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_3060 1.1.1.411|1.1.1.60 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3061 4.1.2.20 - 4.1.2.- - N 1 NC_000913.3_3063 4.2.1.42 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_3072 4.1.2.40 - 4.1.2.- - N 1 NC_000913.3_3081 2.1.1.198 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3097 3.6.4.13 - 3.6.4.- - N 1 NC_000913.3_3099 2.7.7.8|2.7.7.24|2.7.7.3|2.7.7.6 - 2.7.7.- GH13 N 2 NC_000913.3_3101 5.4.99.25 - 5.4.99.- - N 1 NC_000913.3_3106 6.3.4.5 - 6.3.4.- - N 1 NC_000913.3_3109 5.4.2.10 - 5.4.2.- - N 1 NC_000913.3_3110 2.5.1.15|6.3.2.17 - 2.5.1.-+6.3.2.- - N 1 NC_000913.3_3111 5.6.1.1 - 5.6.1.- - N 1 NC_000913.3_3112 2.1.1.166|2.1.1.168 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3120 2.5.1.90|2.5.1.84 - 2.5.1.- - N 1 NC_000913.3_3122 2.5.1.7 - 2.5.1.- - N 1 NC_000913.3_3130 5.3.1.13 - 5.3.1.- - N 1 NC_000913.3_3131 3.1.3.45 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_3143 2.7.13.3 - 2.7.13.- - N 1 NC_000913.3_3145 1.4.7.1 - 1.4.7.- - N 1 NC_000913.3_3146 1.4.1.13 - 1.4.1.- - N 1 NC_000913.3_3156 2.7.1.60|2.7.1.2 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_3157 5.1.3.9|2.7.1.60 - 5.1.3.- - N 1 NC_000913.3_3159 4.1.3.3 - 4.1.3.- - N 1 NC_000913.3_3168 3.4.21.107 - 3.4.21.- - N 1 NC_000913.3_3169 3.4.21.107 - 3.4.21.- - N 1 NC_000913.3_3170 1.1.1.37 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3181 3.6.1.9 - 3.6.1.- - N 1 NC_000913.3_3186 1.3.1.84 - 1.3.1.- - N 1 NC_000913.3_3188 6.3.4.14|6.4.1.2|6.4.1.1|6.4.1.4|6.4.1.3|6.4.1.7 - 6.3.4.-+6.4.1.- - N 1 NC_000913.3_3194 2.1.1.72 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3205 7.3.2.2|7.3.2.5|7.3.2.1 - 7.3.2.- - N 1 NC_000913.3_3210 1.1.1.25 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3211 2.7.7.87 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_3215 3.5.1.88 - 3.5.1.- - N 1 NC_000913.3_3216 2.1.2.9 - 2.1.2.- - N 1 NC_000913.3_3217 2.1.1.176|2.1.1.310 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3224 2.7.7.6 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_3264 3.4.23.43 - 3.4.23.- - N 1 NC_000913.3_3265 1.16.3.1 - 1.16.3.- - N 1 NC_000913.3_3267 3.2.1.14|3.2.1.17 - 3.2.1.- CBM5+GH18 N 2 NC_000913.3_3276 5.2.1.8 - 5.2.1.- - N 1 NC_000913.3_3278 5.2.1.8 - 5.2.1.- - N 1 NC_000913.3_3281 1.6.5.2 - 1.6.5.- - N 1 NC_000913.3_3282 3.6.3.38 - 3.6.3.- - N 1 NC_000913.3_3285 2.7.1.19 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_3289 2.6.1.11|2.6.1.81|2.6.1.17 - 2.6.1.- - N 1 NC_000913.3_3290 2.6.1.85|4.1.3.27 - 2.6.1.- - N 1 NC_000913.3_3291 2.7.7.N1 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_3293 5.2.1.8 - 5.2.1.- - N 1 NC_000913.3_3295 1.7.1.4|1.7.1.15 - 1.7.1.- - N 1 NC_000913.3_3296 1.7.1.15 - 1.7.1.- - N 1 NC_000913.3_3298 2.1.1.107|1.3.1.76|4.99.1.4|2.1.1.271|4.2.1.75|2.1.1.130 - 4.99.1.-+1.3.1.-+2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3302 5.1.3.41 - 5.1.3.- - N 1 NC_000913.3_3303 2.7.1.218 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_3313 6.1.1.2 - 6.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3314 3.1.3.18|3.1.3.22|3.1.3.23|3.1.3.50 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_3315 5.1.3.1 - 5.1.3.- - N 1 NC_000913.3_3316 2.1.1.72 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3318 4.2.3.4|4.2.3.155 - 4.2.3.- - N 1 NC_000913.3_3319 2.7.1.71 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_3328 3.1.3.105|3.1.3.18|3.1.3.5 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_3332 4.1.1.49 - 4.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3333 2.7.13.3 - 2.7.13.- - N 1 NC_000913.3_3341 3.1.1.85|2.1.1.197|3.1.1.1 - 3.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3348 6.5.1.4 - 6.5.1.- - N 1 NC_000913.3_3352 3.4.21.105 - 3.4.21.- - N 1 NC_000913.3_3353 2.8.1.1 - 2.8.1.- - N 1 NC_000913.3_3354 1.1.5.3 - 1.1.5.- GH36 N 2 NC_000913.3_3358 2.7.7.27 - 2.7.7.- GH13_11 N 2 NC_000913.3_3361 1.2.1.11 - 1.2.1.- - N 1 NC_000913.3_3364 2.7.1.12 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_3366 1.13.11.24 - 1.13.11.- - N 1 NC_000913.3_3375 2.3.2.2|3.4.19.13 - 2.3.2.-+3.4.19.- - N 1 NC_000913.3_3378 7.6.2.10 - 7.6.2.- - N 1 NC_000913.3_3397 3.6.3.3|7.2.2.12 - 3.6.3.-+7.2.2.- - N 1 NC_000913.3_3403 2.7.8.7 - 2.7.8.- - N 1 NC_000913.3_3407 7.2.2.11 - 7.2.2.- - N 1 NC_000913.3_3408 7.2.2.11 - 7.2.2.- - N 1 NC_000913.3_3426 2.1.1.242|2.1.1.324 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3427 3.4.24.70 - 3.4.24.- - N 1 NC_000913.3_3428 2.1.1.266 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3429 1.8.1.7|1.8.1.12|1.8.1.16 - 1.8.1.- - N 1 NC_000913.3_3433 1.20.4.1 - 1.20.4.- - N 1 NC_000913.3_3448 4.1.1.15 - 4.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3457 2.7.1.45|2.7.1.15|5.3.1.6 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_3472 7.4.2.5|7.4.2.1|7.4.2.7 - 7.4.2.- - N 1 NC_000913.3_3477 2.7.8.42 - 2.7.8.- - N 1 NC_000913.3_3480 3.2.2.20 - 3.2.2.- - N 1 NC_000913.3_3482 1.7.2.3|1.8.5.3 - 1.7.2.-+1.8.5.- - N 1 NC_000913.3_3484 1.1.1.79|1.1.1.81|1.1.1.215 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3491 6.1.1.14 - 6.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3492 6.1.1.14 - 6.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3497 2.7.1.17 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_3498 5.3.1.5 - 5.3.1.- - N 1 NC_000913.3_3500 3.6.3.17 - 3.6.3.- - N 1 NC_000913.3_3508 1.1.1.130 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3513 2.7.1.53 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_3515 5.1.3.22 - 5.1.3.- - N 1 NC_000913.3_3516 5.1.3.4 - 5.1.3.- - N 1 NC_000913.3_3522 1.2.1.3|1.2.1.36|1.2.1.5|1.2.1.48|1.2.1.28|1.2.1.67|1.2.1.4|1.2.1.39|1.2.1.92|1.2.1.86|1.2.1.26|1.2.1.69 - 1.2.1.- - N 1 NC_000913.3_3523 1.1.1.1|1.1.1.202|1.1.1.244 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3525 2.9.1.1 - 2.9.1.- - N 1 NC_000913.3_3533 2.7.1.197 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_3534 1.1.1.17 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3540 1.1.3.15|1.1.3.46 - 1.1.3.- - N 1 NC_000913.3_3541 2.1.1.207 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3542 2.3.1.30 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_3543 1.1.1.94 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3547 5.4.2.12 - 5.4.2.- - N 1 NC_000913.3_3551 1.1.1.103|1.1.1.303 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3552 2.3.1.29|2.3.1.47 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_3554 5.1.3.20|5.1.3.2|5.1.3.7 - 5.1.3.- - N 1 NC_000913.3_3569 2.7.7.3 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_3570 4.2.99.18|3.2.2.23 - 3.2.2.-+4.2.99.- - N 1 NC_000913.3_3574 4.1.1.36|6.3.2.5 - 4.1.1.-+6.3.2.- - N 1 NC_000913.3_3575 3.6.1.23 - 3.6.1.- - N 1 NC_000913.3_3577 2.4.2.10 - 2.4.2.- - N 1 NC_000913.3_3578 2.7.7.56|2.7.7.48 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_3582 6.5.1.2 - 6.5.1.- - N 1 NC_000913.3_3583 2.7.4.8 - 2.7.4.- - N 1 NC_000913.3_3584 2.7.7.6 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_3585 2.7.6.5|3.1.7.2 - 3.1.7.-+2.7.6.- - N 1 NC_000913.3_3587 3.6.4.12 - 3.6.4.- - N 1 NC_000913.3_3600 3.5.4.2 - 3.5.4.- - N 1 NC_000913.3_3603 2.7.13.3 - 2.7.13.- - N 1 NC_000913.3_3606 2.2.1.6 - 2.2.1.- - N 1 NC_000913.3_3628 4.2.1.6 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_3635 5.99.1.3 - 5.99.1.- - N 1 NC_000913.3_3640 3.1.26.5 - 3.1.26.- - N 1 NC_000913.3_3643 4.1.99.1|4.1.99.2 - 4.1.99.- - N 1 NC_000913.3_3660 7.3.2.1|7.3.2.6 - 7.3.2.- - N 1 NC_000913.3_3664 2.6.1.16 - 2.6.1.- - N 1 NC_000913.3_3665 2.3.1.157|2.7.7.23 - 2.7.7.-+2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_3667 7.1.2.2 - 7.1.2.- GT58 N 2 NC_000913.3_3669 7.1.2.2 - 7.1.2.- - N 1 NC_000913.3_3675 2.1.1.170 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3679 6.3.1.1 - 6.3.1.- - N 1 NC_000913.3_3683 5.4.99.62 - 5.4.99.- - N 1 NC_000913.3_3684 3.6.3.17 - 3.6.3.- - N 1 NC_000913.3_3687 2.7.1.15 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_3695 2.2.1.6 - 2.2.1.- - N 1 NC_000913.3_3696 2.2.1.6 - 2.2.1.- - N 1 NC_000913.3_3698 2.6.1.42 - 2.6.1.- - N 1 NC_000913.3_3699 4.2.1.9|4.2.1.25|4.2.1.162 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_3700 4.3.1.19|4.3.1.17 - 4.3.1.- - N 1 NC_000913.3_3702 1.1.1.86 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3703 5.2.1.8 - 5.2.1.- - N 1 NC_000913.3_3705 3.6.4.12 - 3.6.4.- - N 1 NC_000913.3_3706 3.6.1.40|3.6.1.11 - 3.6.1.- - N 1 NC_000913.3_3707 3.6.4.13 - 3.6.4.- GH18 N 2 NC_000913.3_3711 2.7.8.33 - 2.7.8.- - N 1 NC_000913.3_3713 5.1.3.14 - 5.1.3.- GT0 N 2 NC_000913.3_3714 1.1.1.336 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3715 4.2.1.46 - 4.2.1.- GT2 N 2 NC_000913.3_3716 2.7.7.24 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_3717 2.3.1.210 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_3728 4.2.1.75 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_3729 2.5.1.61 - 2.5.1.- - N 1 NC_000913.3_3730 4.6.1.1 - 4.6.1.- - N 1 NC_000913.3_3733 5.1.1.7|5.1.1.19 - 5.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3737 3.6.4.12 - 3.6.4.- - N 1 NC_000913.3_3744 3.1.1.32|3.1.1.4 - 3.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3745 3.6.4.12|3.6.4.13 - 3.6.4.- - N 1 NC_000913.3_3749 3.1.3.23|3.1.3.74 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_3752 2.1.1.14 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3753 3.1.1.45 - 3.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3754 2.4.2.3 - 2.4.2.- - N 1 NC_000913.3_3756 2.1.1.163|2.1.1.201|2.1.1.199 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3764 4.1.1.98|4.1.1.61 - 4.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3765 1.5.1.41|1.16.1.3 - 1.16.1.-+1.5.1.- - N 1 NC_000913.3_3766 2.3.1.16 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_3767 1.1.1.35|4.2.1.17|5.1.2.3|5.3.3.8 - 1.1.1.-+4.2.1.-+5.1.2.-+5.3.3.- - N 1 NC_000913.3_3768 3.4.13.9 - 3.4.13.- - N 1 NC_000913.3_3771 1.3.5.3 - 1.3.5.- - N 1 NC_000913.3_3774 2.7.7.77 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_3776 2.7.11.1 - 2.7.11.- - N 1 NC_000913.3_3781 2.7.7.7 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_3784 1.3.98.3 - 1.3.98.- - N 1 NC_000913.3_3787 2.7.13.3 - 2.7.13.- - N 1 NC_000913.3_3788 6.3.1.2 - 6.3.1.- - N 1 NC_000913.3_3798 5.3.1.31 - 5.3.1.- - N 1 NC_000913.3_3799 4.1.2.57 - 4.1.2.- - N 1 NC_000913.3_3800 1.1.1.373 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3805 3.1.1.96 - 3.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3814 1.17.1.9 - 1.17.1.- - N 1 NC_000913.3_3815 1.17.1.9 - 1.17.1.- - N 1 NC_000913.3_3822 5.1.3.32 - 5.1.3.- - N 1 NC_000913.3_3823 4.1.2.19 - 4.1.2.- - N 1 NC_000913.3_3824 5.3.1.14|2.7.1.5 - 5.3.1.- - N 1 NC_000913.3_3825 2.7.1.5|5.3.1.14 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_3829 1.15.1.1 - 1.15.1.- - N 1 NC_000913.3_3830 3.1.1.53 - 3.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3832 2.7.13.3 - 2.7.13.- - N 1 NC_000913.3_3837 2.7.1.11 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_3839 3.6.1.26 - 3.6.1.- - N 1 NC_000913.3_3840 5.3.1.1|2.7.2.3 - 5.3.1.- - N 1 NC_000913.3_3845 1.18.1.2|1.19.1.1 - 1.18.1.-+1.19.1.- - N 1 NC_000913.3_3846 3.1.3.11 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_3847 2.7.1.30 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_3851 2.5.1.74 - 2.5.1.- - N 1 NC_000913.3_3853 3.4.25.2 - 3.4.25.- - N 1 NC_000913.3_3860 2.5.1.48 - 2.5.1.- - N 1 NC_000913.3_3861 1.1.1.3|2.7.2.4 - 1.1.1.-+2.7.2.- - N 1 NC_000913.3_3862 1.5.1.20 - 1.5.1.- - N 1 NC_000913.3_3863 1.11.1.21 - 1.11.1.- AA0 N 2 NC_000913.3_3866 1.1.1.6 - 1.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3868 2.7.3.9|2.7.1.202 - 2.7.1.-+2.7.3.- - N 1 NC_000913.3_3870 2.7.1.130|2.7.1.202 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_3873 2.7.1.130|2.7.1.202 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_3876 4.1.1.31 - 4.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3877 3.5.1.16 - 3.5.1.- - N 1 NC_000913.3_3878 1.2.1.38 - 1.2.1.- - N 1 NC_000913.3_3879 2.7.2.8 - 2.7.2.- - N 1 NC_000913.3_3880 4.3.2.1|2.3.1.1 - 2.3.1.-+4.3.2.- - N 1 NC_000913.3_3882 1.6.1.1 - 1.6.1.- - N 1 NC_000913.3_3885 2.1.1.35 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3887 5.1.1.3 - 5.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3890 1.3.1.98 - 1.3.1.- - N 1 NC_000913.3_3891 6.3.4.15 - 6.3.4.- - N 1 NC_000913.3_3892 2.7.1.33|2.7.1.24 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_3900 2.7.7.6|2.7.7.49|2.7.7.7 - 2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_3901 2.7.7.6 - 2.7.7.- GH1 N 2 NC_000913.3_3903 4.1.99.19 - 4.1.99.- - N 1 NC_000913.3_3904 2.8.1.10 - 2.8.1.- - N 1 NC_000913.3_3906 2.7.7.80|2.8.1.11|2.7.7.73 - 2.8.1.-+2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_3907 2.5.1.3 - 2.5.1.- - N 1 NC_000913.3_3908 4.1.99.17|4.1.99.23|2.5.1.3 - 4.1.99.- - N 1 NC_000913.3_3910 3.6.1.22 - 3.6.1.- - N 1 NC_000913.3_3911 4.1.1.37|4.1.1.112|4.1.3.17 - 4.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3912 3.1.21.7 - 3.1.21.- - N 1 NC_000913.3_3917 2.7.13.3 - 2.7.13.- - N 1 NC_000913.3_3919 2.1.2.2|6.3.3.1|6.3.4.13 - 6.3.4.-+2.1.2.- - N 1 NC_000913.3_3920 2.1.2.3|3.5.4.10 - 2.1.2.-+3.5.4.- GH13_23 N 2 NC_000913.3_3925 2.3.1.46|2.3.1.31 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_3926 2.3.3.9|4.1.3.1 - 2.3.3.- - N 1 NC_000913.3_3927 4.1.3.1|4.1.3.30|2.3.3.9 - 4.1.3.- - N 1 NC_000913.3_3928 2.7.11.5 - 2.7.11.- - N 1 NC_000913.3_3931 2.1.1.13|1.5.1.20|2.1.1.10 - 2.1.1.- GH39 N 2 NC_000913.3_3933 3.4.13.21 - 3.4.13.- - N 1 NC_000913.3_3934 5.4.99.21 - 5.4.99.- - N 1 NC_000913.3_3937 5.3.1.9 - 5.3.1.- - N 1 NC_000913.3_3948 7.5.2.1 - 7.5.2.- - N 1 NC_000913.3_3954 4.1.3.40 - 4.1.3.- - N 1 NC_000913.3_3956 2.3.1.15 - 2.3.1.- - N 1 NC_000913.3_3958 3.4.21.88 - 3.4.21.- - N 1 NC_000913.3_3964 1.3.1.91 - 1.3.1.- - N 1 NC_000913.3_3966 1.6.5.5 - 1.6.5.- - N 1 NC_000913.3_3967 3.6.4.12 - 3.6.4.- - N 1 NC_000913.3_3968 5.1.1.1 - 5.1.1.- - N 1 NC_000913.3_3969 2.6.1.57|2.6.1.1|2.6.1.107|2.6.1.5 - 2.6.1.- - N 1 NC_000913.3_3971 3.1.3.2 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_3985 6.2.1.1|6.2.1.17|6.2.1.33|6.2.1.2|6.2.1.40|6.2.1.36|6.2.1.27|6.2.1.37|6.2.1.3|6.2.1.32 - 6.2.1.- GH1 N 2 NC_000913.3_3986 1.7.2.2 - 1.7.2.- - N 1 NC_000913.3_3995 1.17.1.9|1.17.99.7 - 1.17.1.- - N 1 NC_000913.3_3996 1.17.1.9|1.17.99.7 - 1.17.1.- - N 1 NC_000913.3_4003 5.1.3.1 - 5.1.3.- - N 1 NC_000913.3_4005 3.6.3.17 - 3.6.3.- - N 1 NC_000913.3_4008 5.3.1.6 - 5.3.1.- - N 1 NC_000913.3_4012 2.7.4.23 - 2.7.4.- - N 1 NC_000913.3_4016 4.7.1.1 - 4.7.1.- - N 1 NC_000913.3_4017 2.7.8.37 - 2.7.8.- - N 1 NC_000913.3_4023 7.3.2.2|7.3.2.5|7.3.2.1 - 7.3.2.- - N 1 NC_000913.3_4030 2.7.13.3 - 2.7.13.- - N 1 NC_000913.3_4040 4.2.1.2|5.3.2.2 - 4.2.1.-+5.3.2.- - N 1 NC_000913.3_4043 2.7.13.3 - 2.7.13.- - N 1 NC_000913.3_4048 2.3.2.3|6.1.1.6 - 6.1.1.-+2.3.2.- - N 1 NC_000913.3_4050 4.1.1.18 - 4.1.1.- - N 1 NC_000913.3_4054 1.8.1.8 - 1.8.1.- - N 1 NC_000913.3_4057 4.3.1.1 - 4.3.1.- - N 1 NC_000913.3_4061 3.6.4.9 - 3.6.4.- GH13 N 2 NC_000913.3_4070 3.5.2.6 - 3.5.2.- - N 1 NC_000913.3_4073 1.3.5.1 - 1.3.5.- - N 1 NC_000913.3_4074 1.3.5.4 - 1.3.5.- - N 1 NC_000913.3_4080 4.1.1.65 - 4.1.1.- - N 1 NC_000913.3_4083 1.17.99.6 - 1.17.99.- - N 1 NC_000913.3_4084 5.1.99.6|4.2.1.136 - 4.2.1.-+5.1.99.- - N 1 NC_000913.3_4086 3.5.1.28 - 3.5.1.- CBM50 N 2 NC_000913.3_4088 2.5.1.75|2.5.1.122 - 2.5.1.- - N 1 NC_000913.3_4094 6.3.4.4 - 6.3.4.- - N 1 NC_000913.3_4096 3.1.13.1 - 3.1.13.- - N 1 NC_000913.3_4097 2.1.1.185|2.1.1.34 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_4111 2.7.1.194 - 2.7.1.- - N 1 NC_000913.3_4113 4.1.1.85 - 4.1.1.- - N 1 NC_000913.3_4114 5.1.3.22 - 5.1.3.- - N 1 NC_000913.3_4115 5.1.3.4 - 5.1.3.- - N 1 NC_000913.3_4130 3.1.3.6|3.1.4.16|3.1.3.5 - 3.1.3.-+3.1.4.- CBM50 N 2 NC_000913.3_4131 3.1.3.7 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_4136 1.8.4.11 - 1.8.4.- - N 1 NC_000913.3_4142 3.6.1.1 - 3.6.1.- - N 1 NC_000913.3_4144 3.6.3.17 - 3.6.3.- - N 1 NC_000913.3_4147 3.1.3.11 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_4148 6.3.2.45 - 6.3.2.- - N 1 NC_000913.3_4153 1.1.98.6 - 1.1.98.- - N 1 NC_000913.3_4157 7.2.2.14 - 7.2.2.- - N 1 NC_000913.3_4158 3.5.99.10 - 3.5.99.- - N 1 NC_000913.3_4160 2.1.3.2|6.3.5.5|3.5.2.3 - 2.1.3.- - N 1 NC_000913.3_4166 2.1.3.3 - 2.1.3.- - N 1 NC_000913.3_4170 6.1.1.9|6.1.1.16 - 6.1.1.- GH5_11 N 2 NC_000913.3_4172 3.4.11.1|3.4.11.10|3.4.11.5 - 3.4.11.- - N 1 NC_000913.3_4210 4.2.1.82 - 4.2.1.- - N 1 NC_000913.3_4225 5.1.3.24 - 5.1.3.- - N 1 NC_000913.3_4237 4.2.1.8 - 4.2.1.- GH35 N 2 NC_000913.3_4266 2.1.1.72 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_4267 3.1.21.3 - 3.1.21.- - N 1 NC_000913.3_4276 2.7.8.20 - 2.7.8.- - N 1 NC_000913.3_4286 2.1.1.172 - 2.1.1.- - N 1 NC_000913.3_4297 4.1.2.4 - 4.1.2.- - N 1 NC_000913.3_4298 2.4.2.4|2.4.2.2 - 2.4.2.- - N 1 NC_000913.3_4299 5.4.2.7 - 5.4.2.- - N 1 NC_000913.3_4300 2.4.2.1 - 2.4.2.- - N 1 NC_000913.3_4302 6.3.1.20 - 6.3.1.- - N 1 NC_000913.3_4304 3.1.3.3 - 3.1.3.- - N 1 NC_000913.3_4306 2.7.1.22|2.7.7.1 - 2.7.1.-+2.7.7.- - N 1 NC_000913.3_4308 7.6.2.8 - 7.6.2.- - N 1 NC_000913.3_336 - - - GH36 N 1 NC_000913.3_338 - - - GH2 N 1 NC_000913.3_464 - - - GH152 N 1 NC_000913.3_578 - - - GT1 N 1 NC_000913.3_648 - - - GT4 N 1 NC_000913.3_866 - - - GT2 N 1 NC_000913.3_1001 - - - CE4+GH153 N 1 NC_000913.3_1593 - - - GH2 N 1 NC_000913.3_1707 - - - GH1 N 1 NC_000913.3_1821 - - - GH65 N 1 NC_000913.3_1834 - - - CBM50 N 1 NC_000913.3_1949 - - - GT0 N 1 NC_000913.3_1955 - - - GT0 N 1 NC_000913.3_1978 - - - GT4 N 1 NC_000913.3_2016 - - - GT4 N 1 NC_000913.3_2021 - - - GT2 N 1 NC_000913.3_2023 - - - GT4 N 1 NC_000913.3_2106 - - - GH3 N 1 NC_000913.3_2145 - - - GH23 N 1 NC_000913.3_2146 - - - GH23 N 1 NC_000913.3_2336 - - - GT1 N 1 NC_000913.3_2612 - - - GH13 N 1 NC_000913.3_2641 - - - GT1 N 1 NC_000913.3_2666 - - - GH1 N 1 NC_000913.3_2694 - - - CBM50 N 1 NC_000913.3_2814 - - - CBM50 N 1 NC_000913.3_2946 - - - CE12 N 1 NC_000913.3_3103 - - - GT2 N 1 NC_000913.3_3116 - - - GT4 N 1 NC_000913.3_3269 - - - GH38 N 1 NC_000913.3_3463 - - - GT2+2.4.1.12 N 1 NC_000913.3_3619 - - - GH4 N 1 NC_000913.3_3655 - - - GH1 N 1 NC_000913.3_3680 - - - GH85 N 1 NC_000913.3_3681 - - - GH5_18 N 1 NC_000913.3_3721 - - - GT56+2.4.1.-+2.4.1.- N 1 NC_000913.3_3856 - - - GH92 N 1 NC_000913.3_4125 - - - GH13_3 N 1 NC_000913.3_4155 - - - GH13_29 N 1 NC_000913.3_4224 - - - CE0 N 1 NC_000913.3_4290 - - - GH1 N 1
linnabrown
commented
2 years ago Great, thanks for letting me konw. I will respond to you asap.
linnabrown
commented
2 years ago I just install the signalp and it can works well with dbcan. There are do have those lines still in the signal file (top20 lines).
(base) lehuang@lehuang-gpu:~/Downloads/signalp-4.1$ head -20 signalp
#!/usr/bin/perl
# SignalP 4.1 main script
#
# 2012, May 11
###############################################################################
# GENERAL SETTINGS: CUSTOMIZE TO YOUR SITE
###############################################################################
# full path to the signalp-4.1 directory on your system (mandatory)
BEGIN {
$ENV{SIGNALP} = '/home/lehuang/Downloads/signalp-4.1';
}
# determine where to store temporary files (must be writable to all users)
my $outputDir = "/home/lehuang/Downloads/signalp-4.1/output";
# max number of sequences per run (any number can be handled)
my $MAX_ALLOWED_ENTRIES=100000;
And it does have the result with signalP
Gene ID EC# HMMER eCAMI DIAMOND Signalp #ofTools
NC_000913.3_1000 - CE4(103-271)+GH153(313-664) CE4+GH153 CE4+GH153 Y(1-26) 3
NC_000913.3_1023 - GT2(236-418) GT2 GT2 N 3
NC_000913.3_1054 - GH73(160-295) GH73 GH73 N 3
NC_000913.3_1079 3.2.1.52 GH3(56-278) GH3 GH3 N 3
NC_000913.3_1163 - GH23(52-197) GH23 GH23 Y(1-22) 3
NC_000913.3_1167 3.2.1.28 GH37(56-531) GH37 GH37 Y(1-31) 3
NC_000913.3_118 - AA1(66-510) - - Y(1-29) 1
NC_000913.3_125 - CE4(227-371) - - Y(1-20) 1
NC_000913.3_1285 - GH13_18(81-423) GH13 GH13_18 N 3
NC_000913.3_1291 - GH109(9-157) - - N 1For the example data, you need to use the prok instead of meta
I also find the old package does not exist and I updated the readme for more user friendly installation. I will also let user to provide the the path of the signalp path in case the user does not the sudo permission in /usr/bin
julipeale2001
commented
2 years ago Thanks for your reply. I will try it again.
From: Le Huang @.> Sent: 14 June 2022 18:05 To: linnabrown/run_dbcan @.> Cc: Nweze Julius @.>; Author @.> Subject: Re: [linnabrown/run_dbcan] Signal peptide predictions in run_dbcan3 (Issue #97)
I just install the signalp and it can works well with dbcan. There are do have those lines still in the signal file (top20 lines).
(base) @.***:~/Downloads/signalp-4.1$ head -20 signalp
#
###############################################################################
###############################################################################
BEGIN { $ENV{SIGNALP} = '/home/lehuang/Downloads/signalp-4.1'; }
my $outputDir = "/home/lehuang/Downloads/signalp-4.1/output";
my $MAX_ALLOWED_ENTRIES=100000;
And it does have the result with signalP
Gene ID EC# HMMER eCAMI DIAMOND Signalp #ofTools NC_000913.3_1000 - CE4(103-271)+GH153(313-664) CE4+GH153 CE4+GH153 Y(1-26) 3 NC_000913.3_1023 - GT2(236-418) GT2 GT2 N 3 NC_000913.3_1054 - GH73(160-295) GH73 GH73 N 3 NC_000913.3_1079 3.2.1.52 GH3(56-278) GH3 GH3 N 3 NC_000913.3_1163 - GH23(52-197) GH23 GH23 Y(1-22) 3 NC_000913.3_1167 3.2.1.28 GH37(56-531) GH37 GH37 Y(1-31) 3 NC_000913.3_118 - AA1(66-510) - - Y(1-29) 1 NC_000913.3_125 - CE4(227-371) - - Y(1-20) 1 NC_000913.3_1285 - GH13_18(81-423) GH13 GH13_18 N 3 NC_000913.3_1291 - GH109(9-157) - - N 1
— Reply to this email directly, view it on GitHubhttps://github.com/linnabrown/run_dbcan/issues/97#issuecomment-1155402086, or unsubscribehttps://github.com/notifications/unsubscribe-auth/ANVRS3DAZTYYI57X3SBOLO3VPCUVXANCNFSM5YGNDP7Q. You are receiving this because you authored the thread.Message ID: @.***>
Hi everyone, I ran dbcan3 on my genomes, but the overview.txt output does not include signal peptide predictions (showed "N" for all CAZymes). I would be glad if anyone of you could help me to solve the problem.
run_dbcan selected.fasta meta --out_dir output_selected --db_dir db --use_signalP=TRUE