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liwenran / DeepTACT

DeepTACT: predicting three-dimensional chromatin contacts via bootstrapping deep learning
19 stars 6 forks source link

About DNA acessibility score data #5

Open Licko0909 opened 4 years ago

Licko0909 commented 4 years ago

您好！

最近想尝试验证加入DNA其他信息能否有利于更多下游任务，所以非常希望能够复现DeepTATC去做探索！

我想请教下，DeepTATC中的DNA可及性得分数据，使用的是以下哪一种呢？论文中没有提及这部分

foreground read count,  raw read openness,  narrow peak openness,  and broad peak openness.

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立超