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lixw777 / Syn_SegNet

Joint ultra-high-field 7T MRI synthesis for hippocampal subfields segmentation in routine 3T MRI
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请问导入数据集的文件夹层级是如何划分的呀 #1

Open Lareina2441 opened 6 months ago

Lareina2441 commented 6 months ago

李教授您好，我们是一群大二的学生，想要复现您的项目来学习医学图像的算法，我们下载了您的代码和相关数据集，您的代码很厉害，非常有学习价值，但是我们发现您代码中的文件路径所指向的文件夹的各层级，和原数据集的文件夹层级有些区别，这让我们不知道如何导入数据。您能否慷慨的给予我们帮助，告诉我们原数据集解压后，文件是如何重新划分的呢？

lixw777 commented 6 months ago

每个人一个文件夹，用的数字表示 01-20 下载的数据需要自己做预处理

Lareina2441 commented 6 months ago

非常感谢您，请问预处理是指您论文中提到的“We applied denoising and bias field correction techniques to the MRI data of the four modalities. Following the approach described in [11], we performed registration to align the images for segmentation.”的预处理方法吗，预处理的相关代码是否包含在您的代码里呀（好像没有找到www）？作为初学者我们经验不足，但我们会仔细研读您的论文和提到的参考文献的，感谢您的指导！

lixw777 commented 6 months ago

Image Preprocessing 段落都是预处理，可以用fsl、c3d等神经影像常用工具实现。 给出的代码没有包含预处理部分。

Lareina2441 commented 6 months ago

好的，谢谢您，我们前两天已经完成对原数据的重新组织了。因为预处理实在是非常复杂，我们打算先跑跑模型看看结果。感觉这个项目真的好难啊。（˃̣̣̥᷄⌓˂̣̣̥᷅）

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发件人: Xinwei Li @.> 发送时间: Monday, May 6, 2024 8:01:33 PM 收件人: lixw777/Syn_SegNet @.> 抄送: 张蕾 @.>; Author @.> 主题: Re: [lixw777/Syn_SegNet] 请问导入数据集的文件夹层级是如何划分的呀 (Issue #1)

Image Preprocessing 段落都是预处理，可以用fsl、c3d等神经影像常用工具实现。 给出的代码没有包含预处理部分。

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