Outputs - cases vides et "inf"

llegregam / MSReader

Package for parsing a Tracefinder or Skyline file containing processed Mass Spectrometry data

GNU General Public License v3.0

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Outputs - cases vides et "inf" #43

Open amrocher opened 7 months ago

amrocher commented 7 months ago

Actuellement lorsque l'on exporte la Table ou les outputs pour GraphStatsR, MSReader laisse des cases vides ou des "inf" dans les variables normalisées lorsque l'on a "0" en données de normalisation. Ce serait bien que MSReader remplace ces cases vides et ces "inf par des NA afin que l'interprétation des données soit plus aisée pour tous (demandeur, analyste).

amrocher commented 2 months ago

Globalement, MSReader laisse des cases vides dans le fichier "Tables.xlsx" il faudrait que tout soit rempli par :

Valeur chiffrée
ND pour les aires C12 et C13 non détectées
NA pour les valeurs de ratios, d'aires normalisées, de ratios normalisées et de quantités normalisées non calculables
ULOQ pour les valeurs de quantités normalisées dont la concentration initiale était ULOQ

Merci :)