lmarmiesse / FlexFlux

FlexFlux is a tool for metabolic fluxes analysis. It is a java application usable on Linux and Windows. Check out our website :
http://lipm-bioinfo.toulouse.inra.fr/flexflux/index.html
Other
4 stars 3 forks source link

get entities in InteractionNetwork #17

Open lcottret opened 9 years ago

lcottret commented 9 years ago

Pourquoi ? Je charge mes réseaux.

Quand je fais : System.err.println(b.getInteractionNetwork().getInteractionNetworkEntities().keySet()); J'obtiens : [G3, G2, G1, T1, T2]. Très bien, c'est ce que j'ai dans le SBMLQual.

Ensuite, une ligne plus loin, quand je fais : for(BioEntity e : b.getInteractionNetwork().getEntities()) { System.err.println(e.getId()); }

J'obtiens tous les ids de mon réseau d'interactions + tous les ids de mon réseau métabolique !

Je ne comprends pas bien mais en tout cas, comme les noms de fonction ont à peu près le même nom, ca ne peut qu'amener des confusions !