Open masayoshi-ogura opened 6 years ago
For parsing Born effective charges and dielectric constants, if you import phonopy, you may be able to use this method. For many features on parsing VASP, using pymatgen is a good idea.
thank you a lot for the information.
can I use pymatgen as an alternative to phonopy for parsing vasprun.xml? I'm searching for an alternative to quippy for parsing atomic structure from VASP output and computing neighbor information.
Possible. Pymatgen is strong in VASP I/O. http://pymatgen.org/pymatgen.io.vasp.html
I've checked pymatgen.io.vasp package, but I can't find how to get interatomic forces necessary for this HDNNP program... next I will check ASE package for another alternative to quippy.
全エネルギー・原子間力は、VASPのOUTCARをquippyでパースしてxyzファイルに出力、 それを読み込む形でHDNNPトレーニングにインプットしている
ボルン有効電荷も(ひとまずLEPSILONタグで計算するとして)OUTCARから何らかの方法でパースし、 トレーニングできるようにする
また、予測したボルン有効電荷を使ってフォノン計算時にnon-analytical term correctionを加えられるようにもする