massonix / code_snippets

A collection of code snippets for different tasks
9 stars 1 forks source link

dubte codi plot_scatterplot_with_boxplots #1

Open guillemsanchezsanchez1996 opened 1 year ago

guillemsanchezsanchez1996 commented 1 year ago

Hola Ramon, Vaig topar-me (per sort) amb el teu tweet on mostraves com fer uns plots molt macos combinant l'expressió de dos gens amb un objecte de single-cell rna seq.

Inspeccionant el teu code no entenc molt bé quina es la natura dels objectes següents:

faithful <- mutate(faithful, group = ifelse(eruptions > 3, "A", "B"))

A, B: son els gens? Faithful es el sc object?

Gràcies per la teva ajut.

Guillem Sanchez Sanchez

PS: Si utilitzo el teu codi, com hauria de citar-te?

massonix commented 1 year ago

Hola Guillem!

El dataset faithful ve per defecte amb la sessió de R. És un dels toy datasets que proporciona R per poder exemplificar qualsevol script, com per exemple iris, mtcars, diamonds etc. Si vols més informació sobre aquest dataset la pots trobar aquí. Estaria bé posar el codi en una funció que fos reutilitzable, si tens ganes de fer-ho comenta-ho aquí mateix i actualitzo el codi!

No fa falta que em citis, faltaria més. La idea original ve d'una figura d'aquest article, si vols el pots mencionar als agraïments :)

Qualsevol cosa em dius!

Ramon