materialsproject / pymatgen

Python Materials Genomics (pymatgen) is a robust materials analysis code that defines classes for structures and molecules with support for many electronic structure codes. It powers the Materials Project.
https://pymatgen.org
Other
1.47k stars 847 forks source link

Build is failing #1907

Closed ramav87 closed 4 years ago

ramav87 commented 4 years ago

Doing a pip install fails during wheel building, and TravisCI also shows the build failing.


Building wheels for collected packages: pymatgen, retrying
  Building wheel for pymatgen (setup.py) ... error
  ERROR: Complete output from command //anaconda3/bin/python -u -c 'import setuptools, tokenize;__file__='"'"'/private/var/folders/r8/pgjpxss144164gvc52xvk_cj12sy6v/T/pip-install-h86cvy80/pymatgen/setup.py'"'"';f=getattr(tokenize, '"'"'open'"'"', open)(__file__);code=f.read().replace('"'"'\r\n'"'"', '"'"'\n'"'"');f.close();exec(compile(code, __file__, '"'"'exec'"'"'))' bdist_wheel -d /private/var/folders/r8/pgjpxss144164gvc52xvk_cj12sy6v/T/pip-wheel-6s_vb55t --python-tag cp37:
  ERROR: running bdist_wheel
  running build
  running build_py
  creating build
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen
  copying pymatgen/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen
  copying pymatgen/dao.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/entries
  copying pymatgen/entries/compatibility.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/entries
  copying pymatgen/entries/computed_entries.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/entries
  copying pymatgen/entries/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/entries
  copying pymatgen/entries/entry_tools.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/entries
  copying pymatgen/entries/exp_entries.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/entries
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/core
  copying pymatgen/core/xcfunc.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/core
  copying pymatgen/core/periodic_table.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/core
  copying pymatgen/core/units.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/core
  copying pymatgen/core/ion.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/core
  copying pymatgen/core/libxcfunc.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/core
  copying pymatgen/core/tensors.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/core
  copying pymatgen/core/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/core
  copying pymatgen/core/trajectory.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/core
  copying pymatgen/core/operations.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/core
  copying pymatgen/core/molecular_orbitals.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/core
  copying pymatgen/core/spectrum.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/core
  copying pymatgen/core/bonds.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/core
  copying pymatgen/core/sites.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/core
  copying pymatgen/core/lattice.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/core
  copying pymatgen/core/structure.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/core
  copying pymatgen/core/composition.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/core
  copying pymatgen/core/surface.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/core
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/transformations
  copying pymatgen/transformations/defect_transformations.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/transformations
  copying pymatgen/transformations/standard_transformations.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/transformations
  copying pymatgen/transformations/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/transformations
  copying pymatgen/transformations/transformation_abc.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/transformations
  copying pymatgen/transformations/advanced_transformations.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/transformations
  copying pymatgen/transformations/site_transformations.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/transformations
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/fragmenter.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/eos.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/energy_models.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/path_finder.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/reaction_calculator.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/find_dimension.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/diffusion_analyzer.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/surface_analysis.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/structure_matcher.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/pourbaix_diagram.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/wulff.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/local_env.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/phase_diagram.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/molecule_matcher.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/structure_analyzer.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/bond_dissociation.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/prototypes.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/piezo.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/ewald.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/nmr.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/interface.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/molecule_structure_comparator.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/thermochemistry.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/bond_valence.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/excitation.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/cost.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/dimensionality.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/adsorption.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/graphs.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/hhi.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/transition_state.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/piezo_sensitivity.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/quasiharmonic.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/substrate_analyzer.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/functional_groups.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/interface_reactions.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util
  copying pymatgen/util/convergence.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util
  copying pymatgen/util/num.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util
  copying pymatgen/util/sequence.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util
  copying pymatgen/util/plotting.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util
  copying pymatgen/util/coord.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util
  copying pymatgen/util/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util
  copying pymatgen/util/io_utils.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util
  copying pymatgen/util/string.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util
  copying pymatgen/util/provenance.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util
  copying pymatgen/util/typing.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util
  copying pymatgen/util/testing.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util
  copying pymatgen/util/serialization.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/plugins
  copying pymatgen/plugins/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/plugins
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/optimization
  copying pymatgen/optimization/linear_assignment_numpy.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/optimization
  copying pymatgen/optimization/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/optimization
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/ext
  copying pymatgen/ext/jhu.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/ext
  copying pymatgen/ext/crystalsai.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/ext
  copying pymatgen/ext/cod.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/ext
  copying pymatgen/ext/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/ext
  copying pymatgen/ext/matproj.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/ext
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io
  copying pymatgen/io/fiesta.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io
  copying pymatgen/io/ase.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io
  copying pymatgen/io/xyz.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io
  copying pymatgen/io/atat.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io
  copying pymatgen/io/aiida.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io
  copying pymatgen/io/nwchem.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io
  copying pymatgen/io/xr.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io
  copying pymatgen/io/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io
  copying pymatgen/io/lmto.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io
  copying pymatgen/io/zeopp.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io
  copying pymatgen/io/pwscf.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io
  copying pymatgen/io/babel.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io
  copying pymatgen/io/shengbte.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io
  copying pymatgen/io/cssr.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io
  copying pymatgen/io/phonopy.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io
  copying pymatgen/io/wannier90.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io
  copying pymatgen/io/cif.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io
  copying pymatgen/io/prismatic.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io
  copying pymatgen/io/gaussian.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io
  copying pymatgen/io/xcrysden.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io
  copying pymatgen/io/adf.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/phonon
  copying pymatgen/phonon/dos.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/phonon
  copying pymatgen/phonon/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/phonon
  copying pymatgen/phonon/ir_spectra.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/phonon
  copying pymatgen/phonon/plotter.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/phonon
  copying pymatgen/phonon/bandstructure.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/phonon
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/cli
  copying pymatgen/cli/feff_plot_dos.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/cli
  copying pymatgen/cli/pmg_structure.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/cli
  copying pymatgen/cli/pmg_query.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/cli
  copying pymatgen/cli/pmg_plot.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/cli
  copying pymatgen/cli/feff_plot_cross_section.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/cli
  copying pymatgen/cli/pmg_potcar.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/cli
  copying pymatgen/cli/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/cli
  copying pymatgen/cli/pmg_analyze.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/cli
  copying pymatgen/cli/pmg_config.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/cli
  copying pymatgen/cli/gaussian_analyzer.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/cli
  copying pymatgen/cli/get_environment.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/cli
  copying pymatgen/cli/pmg.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/cli
  copying pymatgen/cli/feff_input_generation.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/cli
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/symmetry
  copying pymatgen/symmetry/analyzer.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/symmetry
  copying pymatgen/symmetry/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/symmetry
  copying pymatgen/symmetry/kpath.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/symmetry
  copying pymatgen/symmetry/site_symmetries.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/symmetry
  copying pymatgen/symmetry/groups.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/symmetry
  copying pymatgen/symmetry/structure.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/symmetry
  copying pymatgen/symmetry/settings.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/symmetry
  copying pymatgen/symmetry/maggroups.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/symmetry
  copying pymatgen/symmetry/bandstructure.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/symmetry
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/vis
  copying pymatgen/vis/structure_vtk.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/vis
  copying pymatgen/vis/plotters.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/vis
  copying pymatgen/vis/structure_chemview.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/vis
  copying pymatgen/vis/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/vis
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/electronic_structure
  copying pymatgen/electronic_structure/cohp.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/electronic_structure
  copying pymatgen/electronic_structure/dos.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/electronic_structure
  copying pymatgen/electronic_structure/boltztrap.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/electronic_structure
  copying pymatgen/electronic_structure/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/electronic_structure
  copying pymatgen/electronic_structure/core.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/electronic_structure
  copying pymatgen/electronic_structure/plotter.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/electronic_structure
  copying pymatgen/electronic_structure/boltztrap2.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/electronic_structure
  copying pymatgen/electronic_structure/bandstructure.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/electronic_structure
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/command_line
  copying pymatgen/command_line/vampire_caller.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/command_line
  copying pymatgen/command_line/bader_caller.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/command_line
  copying pymatgen/command_line/critic2_caller.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/command_line
  copying pymatgen/command_line/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/command_line
  copying pymatgen/command_line/enumlib_caller.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/command_line
  copying pymatgen/command_line/aconvasp_caller.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/command_line
  copying pymatgen/command_line/gulp_caller.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/command_line
  copying pymatgen/command_line/mcsqs_caller.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/command_line
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/apps
  copying pymatgen/apps/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/apps
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/alchemy
  copying pymatgen/alchemy/materials.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/alchemy
  copying pymatgen/alchemy/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/alchemy
  copying pymatgen/alchemy/transmuters.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/alchemy
  copying pymatgen/alchemy/filters.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/alchemy
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/elasticity
  copying pymatgen/analysis/elasticity/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/elasticity
  copying pymatgen/analysis/elasticity/stress.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/elasticity
  copying pymatgen/analysis/elasticity/elastic.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/elasticity
  copying pymatgen/analysis/elasticity/strain.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/elasticity
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/structure_prediction
  copying pymatgen/analysis/structure_prediction/volume_predictor.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/structure_prediction
  copying pymatgen/analysis/structure_prediction/substitution_probability.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/structure_prediction
  copying pymatgen/analysis/structure_prediction/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/structure_prediction
  copying pymatgen/analysis/structure_prediction/substitutor.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/structure_prediction
  copying pymatgen/analysis/structure_prediction/dopant_predictor.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/structure_prediction
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/xas
  copying pymatgen/analysis/xas/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/xas
  copying pymatgen/analysis/xas/spectrum.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/xas
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/defects
  copying pymatgen/analysis/defects/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/defects
  copying pymatgen/analysis/defects/core.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/defects
  copying pymatgen/analysis/defects/dilute_solution_model.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/defects
  copying pymatgen/analysis/defects/generators.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/defects
  copying pymatgen/analysis/defects/thermodynamics.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/defects
  copying pymatgen/analysis/defects/utils.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/defects
  copying pymatgen/analysis/defects/corrections.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/defects
  copying pymatgen/analysis/defects/defect_compatibility.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/defects
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv
  copying pymatgen/analysis/chemenv/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/gb
  copying pymatgen/analysis/gb/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/gb
  copying pymatgen/analysis/gb/grain.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/gb
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/diffraction
  copying pymatgen/analysis/diffraction/neutron.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/diffraction
  copying pymatgen/analysis/diffraction/xrd.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/diffraction
  copying pymatgen/analysis/diffraction/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/diffraction
  copying pymatgen/analysis/diffraction/core.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/diffraction
  copying pymatgen/analysis/diffraction/tem.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/diffraction
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/ferroelectricity
  copying pymatgen/analysis/ferroelectricity/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/ferroelectricity
  copying pymatgen/analysis/ferroelectricity/polarization.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/ferroelectricity
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/topological
  copying pymatgen/analysis/topological/spillage.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/topological
  copying pymatgen/analysis/topological/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/topological
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/magnetism
  copying pymatgen/analysis/magnetism/analyzer.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/magnetism
  copying pymatgen/analysis/magnetism/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/magnetism
  copying pymatgen/analysis/magnetism/heisenberg.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/magnetism
  copying pymatgen/analysis/magnetism/jahnteller.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/magnetism
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/connectivity
  copying pymatgen/analysis/chemenv/connectivity/connected_components.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/connectivity
  copying pymatgen/analysis/chemenv/connectivity/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/connectivity
  copying pymatgen/analysis/chemenv/connectivity/structure_connectivity.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/connectivity
  copying pymatgen/analysis/chemenv/connectivity/connectivity_finder.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/connectivity
  copying pymatgen/analysis/chemenv/connectivity/environment_nodes.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/connectivity
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometry_finder.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/structure_environments.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/voronoi.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/chemenv_strategies.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/utils
  copying pymatgen/analysis/chemenv/utils/chemenv_config.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/utils
  copying pymatgen/analysis/chemenv/utils/coordination_geometry_utils.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/utils
  copying pymatgen/analysis/chemenv/utils/func_utils.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/utils
  copying pymatgen/analysis/chemenv/utils/math_utils.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/utils
  copying pymatgen/analysis/chemenv/utils/defs_utils.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/utils
  copying pymatgen/analysis/chemenv/utils/graph_utils.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/utils
  copying pymatgen/analysis/chemenv/utils/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/utils
  copying pymatgen/analysis/chemenv/utils/scripts_utils.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/utils
  copying pymatgen/analysis/chemenv/utils/chemenv_errors.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/utils
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/strategy_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/strategy_files/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/strategy_files
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/feff
  copying pymatgen/io/feff/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/feff
  copying pymatgen/io/feff/inputs.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/feff
  copying pymatgen/io/feff/sets.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/feff
  copying pymatgen/io/feff/outputs.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/feff
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/lobster
  copying pymatgen/io/lobster/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/lobster
  copying pymatgen/io/lobster/inputs.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/lobster
  copying pymatgen/io/lobster/outputs.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/lobster
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/abinit
  copying pymatgen/io/abinit/abiobjects.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/abinit
  copying pymatgen/io/abinit/abiinspect.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/abinit
  copying pymatgen/io/abinit/abitimer.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/abinit
  copying pymatgen/io/abinit/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/abinit
  copying pymatgen/io/abinit/variable.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/abinit
  copying pymatgen/io/abinit/netcdf.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/abinit
  copying pymatgen/io/abinit/inputs.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/abinit
  copying pymatgen/io/abinit/pseudos.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/abinit
  copying pymatgen/io/abinit/helpers.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/abinit
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/vasp
  copying pymatgen/io/vasp/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/vasp
  copying pymatgen/io/vasp/inputs.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/vasp
  copying pymatgen/io/vasp/sets.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/vasp
  copying pymatgen/io/vasp/help.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/vasp
  copying pymatgen/io/vasp/outputs.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/vasp
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/qchem
  copying pymatgen/io/qchem/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/qchem
  copying pymatgen/io/qchem/inputs.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/qchem
  copying pymatgen/io/qchem/utils.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/qchem
  copying pymatgen/io/qchem/sets.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/qchem
  copying pymatgen/io/qchem/outputs.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/qchem
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/exciting
  copying pymatgen/io/exciting/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/exciting
  copying pymatgen/io/exciting/inputs.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/exciting
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/lammps
  copying pymatgen/io/lammps/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/lammps
  copying pymatgen/io/lammps/inputs.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/lammps
  copying pymatgen/io/lammps/utils.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/lammps
  copying pymatgen/io/lammps/data.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/lammps
  copying pymatgen/io/lammps/outputs.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/lammps
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/apps/borg
  copying pymatgen/apps/borg/queen.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/apps/borg
  copying pymatgen/apps/borg/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/apps/borg
  copying pymatgen/apps/borg/hive.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/apps/borg
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/apps/battery
  copying pymatgen/apps/battery/conversion_battery.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/apps/battery
  copying pymatgen/apps/battery/analyzer.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/apps/battery
  copying pymatgen/apps/battery/__init__.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/apps/battery
  copying pymatgen/apps/battery/insertion_battery.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/apps/battery
  copying pymatgen/apps/battery/plotter.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/apps/battery
  copying pymatgen/apps/battery/battery_abc.py -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/apps/battery
  copying pymatgen/entries/MPCompatibility.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/entries
  copying pymatgen/entries/MITCompatibility.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/entries
  copying pymatgen/core/reconstructions_archive.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/core
  copying pymatgen/core/bond_lengths.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/core
  copying pymatgen/core/func_groups.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/core
  copying pymatgen/core/periodic_table.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/core
  copying pymatgen/core/libxc_docs.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/core
  copying pymatgen/core/quad_data.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/core
  copying pymatgen/core/py.typed -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/core
  copying pymatgen/analysis/icsd_bv.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/bonds_jmol_ob.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/vesta_cutoffs.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/bvparam_1991.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/op_params.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/cn_opt_params.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/ionic_radii.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/aflow_prototypes.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/costdb_elements.csv -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  copying pymatgen/analysis/hhi_data.csv -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util/structures
  copying pymatgen/util/structures/SiO2.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util/structures
  copying pymatgen/util/structures/Li2O.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util/structures
  copying pymatgen/util/structures/LiFePO4.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util/structures
  copying pymatgen/util/structures/Li10GeP2S12.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util/structures
  copying pymatgen/util/structures/TlBiSe2.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util/structures
  copying pymatgen/util/structures/K2O2.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util/structures
  copying pymatgen/util/structures/Li3V2(PO4)3.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util/structures
  copying pymatgen/util/structures/Graphite.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util/structures
  copying pymatgen/util/structures/He_BCC.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util/structures
  copying pymatgen/util/structures/TiO2.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util/structures
  copying pymatgen/util/structures/CsCl.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util/structures
  copying pymatgen/util/structures/BaNiO3.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util/structures
  copying pymatgen/util/structures/Li2O2.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util/structures
  copying pymatgen/util/structures/Si.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util/structures
  copying pymatgen/util/structures/NaFePO4.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util/structures
  copying pymatgen/util/structures/VO2.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util/structures
  copying pymatgen/util/structures/Sn.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util/structures
  copying pymatgen/util/structures/Pb2TiZrO6.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util/structures
  copying pymatgen/util/structures/SrTiO3.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util/structures
  copying pymatgen/symmetry/symm_data.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/symmetry
  copying pymatgen/symmetry/symm_ops.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/symmetry
  copying pymatgen/symmetry/symm_data.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/symmetry
  copying pymatgen/symmetry/symm_ops.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/symmetry
  copying pymatgen/symmetry/symm_data_magnetic.sqlite -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/symmetry
  copying pymatgen/vis/ElementColorSchemes.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/vis
  copying pymatgen/command_line/OxideTersoffPotentials -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/command_line
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/structure_prediction/data
  copying pymatgen/analysis/structure_prediction/data/pair_correlation.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/structure_prediction/data
  copying pymatgen/analysis/structure_prediction/data/lambda.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/structure_prediction/data
  copying pymatgen/analysis/structure_prediction/DLS_bond_params.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/structure_prediction
  copying pymatgen/analysis/diffraction/neutron_scattering_length.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/diffraction
  copying pymatgen/analysis/diffraction/atomic_scattering_params.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/diffraction
  copying pymatgen/analysis/magnetism/default_magmoms.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/magnetism
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/strategy_files/ImprovedConfidenceCutoffDefaultParameters.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/strategy_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/allcg.txt -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/BO_2#8.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/H#10.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TY#3.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PCPA#11.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/T#4.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TT_2#9.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TBT#8.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TI#9.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/T#5.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/AC#12.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SBSA#10.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SH#13.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/HP#12.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/FO#7.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/H#11.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/S#12.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TBSA#10.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/L#2.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/DI#11.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TO_1#9.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/DDPN#8.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TS#3.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SMA#9.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PA#10.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TO_3#9.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PP#5.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/S#1.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SBT#8.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SC#12.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TC#9.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/DD#8.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TT#12.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PBP#12.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/O#6.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SS#9.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TT_3#9.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/S#10.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TL#3.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PP#6.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/CO#11.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/BO_3#8.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/ST#7.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/C#8.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/HD#9.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/BS_2#10.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PP#10.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SS#4.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/BO_1#8.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/C#12.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TT_1#9.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/MI#10.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/HB#8.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/ET#7.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/A#2.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/S#4.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/O#6_explicit.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/T#6.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SA#8.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/S#5.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SY#4.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/HA#12.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PB#7.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SH#11.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TO_2#9.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/BS_1#10.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/I#12.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/DD#20.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files
  copying pymatgen/io/feff/MPEXAFSSet.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/feff
  copying pymatgen/io/feff/MPELNESSet.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/feff
  copying pymatgen/io/feff/MPXANESSet.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/feff
  copying pymatgen/io/feff/MPEXELFSSet.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/feff
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/lobster/lobster_basis
  copying pymatgen/io/lobster/lobster_basis/BASIS_PBE_54_min.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/lobster/lobster_basis
  copying pymatgen/io/lobster/lobster_basis/BASIS_PBE_54_max.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/lobster/lobster_basis
  copying pymatgen/io/lobster/lobster_basis/BASIS_PBE_54_standard.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/lobster/lobster_basis
  copying pymatgen/io/vasp/MVLGWSet.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/vasp
  copying pymatgen/io/vasp/MVLRelax52Set.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/vasp
  copying pymatgen/io/vasp/MPHSERelaxSet.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/vasp
  copying pymatgen/io/vasp/VASPIncarBase.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/vasp
  copying pymatgen/io/vasp/MPSCANRelaxSet.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/vasp
  copying pymatgen/io/vasp/MPRelaxSet.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/vasp
  copying pymatgen/io/vasp/MITRelaxSet.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/vasp
  copying pymatgen/io/vasp/vdW_parameters.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/vasp
  copying pymatgen/io/vasp/vasp_potcar_pymatgen_hashes.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/vasp
  copying pymatgen/io/vasp/incar_parameters.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/vasp
  copying pymatgen/io/vasp/vasp_potcar_file_hashes.json -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/vasp
  creating build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/lammps/templates
  copying pymatgen/io/lammps/templates/md.txt -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/lammps/templates
  copying pymatgen/io/lammps/CoeffsDataType.yaml -> build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/io/lammps
  running build_ext
  building 'pymatgen.optimization.linear_assignment' extension
  creating build/temp.macosx-10.7-x86_64-3.7
  creating build/temp.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen
  creating build/temp.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/optimization
  gcc -Wno-unused-result -Wsign-compare -Wunreachable-code -DNDEBUG -g -fwrapv -O3 -Wall -Wstrict-prototypes -I//anaconda3/include -arch x86_64 -I//anaconda3/include -arch x86_64 -I//anaconda3/include/python3.7m -I//anaconda3/lib/python3.7/site-packages/numpy/core/include -c pymatgen/optimization/linear_assignment.c -o build/temp.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/optimization/linear_assignment.o
  In file included from //anaconda3/lib/python3.7/site-packages/numpy/core/include/numpy/ndarraytypes.h:1832:0,
                   from //anaconda3/lib/python3.7/site-packages/numpy/core/include/numpy/ndarrayobject.h:12,
                   from //anaconda3/lib/python3.7/site-packages/numpy/core/include/numpy/arrayobject.h:4,
                   from pymatgen/optimization/linear_assignment.c:569:
  //anaconda3/lib/python3.7/site-packages/numpy/core/include/numpy/npy_1_7_deprecated_api.h:17:2: warning: #warning "Using deprecated NumPy API, disable it with " "#define NPY_NO_DEPRECATED_API NPY_1_7_API_VERSION" [-Wcpp]
   #warning "Using deprecated NumPy API, disable it with " \
    ^
  pymatgen/optimization/linear_assignment.c: In function '__pyx_pf_8pymatgen_12optimization_17linear_assignment_16LinearAssignment___init__.isra.45':
  pymatgen/optimization/linear_assignment.c:4673:42: warning: '__pyx_v_last' may be used uninitialized in this function [-Wmaybe-uninitialized]
                 __pyx_t_45 = (__pyx_v_last + 1);
                                            ^
  pymatgen/optimization/linear_assignment.c:3115:7: note: '__pyx_v_last' was declared here
     int __pyx_v_last;
         ^
  pymatgen/optimization/linear_assignment.c:3959:20: warning: '__pyx_v_j2' may be used uninitialized in this function [-Wmaybe-uninitialized]
           __pyx_t_37 = __pyx_v_j1;
                      ^
  pymatgen/optimization/linear_assignment.c:3129:7: note: '__pyx_v_j2' was declared here
     int __pyx_v_j2;
         ^
  pymatgen/optimization/linear_assignment.c:4652:41: warning: '__pyx_v_m' may be used uninitialized in this function [-Wmaybe-uninitialized]
             __pyx_t_9 = ((fabs((__pyx_v_h - __pyx_v_m)) < __pyx_v_eps) != 0);
                                           ^
  pymatgen/optimization/linear_assignment.c:3125:26: note: '__pyx_v_m' was declared here
     __pyx_t_5numpy_float_t __pyx_v_m;
                            ^
  gcc -bundle -undefined dynamic_lookup -L//anaconda3/lib -arch x86_64 -L//anaconda3/lib -arch x86_64 -arch x86_64 build/temp.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/optimization/linear_assignment.o -o build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/optimization/linear_assignment.cpython-37m-darwin.so
  building 'pymatgen.util.coord_cython' extension
  creating build/temp.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util
  gcc -Wno-unused-result -Wsign-compare -Wunreachable-code -DNDEBUG -g -fwrapv -O3 -Wall -Wstrict-prototypes -I//anaconda3/include -arch x86_64 -I//anaconda3/include -arch x86_64 -I//anaconda3/include/python3.7m -I//anaconda3/lib/python3.7/site-packages/numpy/core/include -c pymatgen/util/coord_cython.c -o build/temp.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util/coord_cython.o
  In file included from //anaconda3/lib/python3.7/site-packages/numpy/core/include/numpy/ndarraytypes.h:1832:0,
                   from //anaconda3/lib/python3.7/site-packages/numpy/core/include/numpy/ndarrayobject.h:12,
                   from //anaconda3/lib/python3.7/site-packages/numpy/core/include/numpy/arrayobject.h:4,
                   from pymatgen/util/coord_cython.c:569:
  //anaconda3/lib/python3.7/site-packages/numpy/core/include/numpy/npy_1_7_deprecated_api.h:17:2: warning: #warning "Using deprecated NumPy API, disable it with " "#define NPY_NO_DEPRECATED_API NPY_1_7_API_VERSION" [-Wcpp]
   #warning "Using deprecated NumPy API, disable it with " \
    ^
  pymatgen/util/coord_cython.c: In function '__pyx_pf_8pymatgen_4util_12coord_cython_2is_coord_subset_pbc.isra.36':
  pymatgen/util/coord_cython.c:28271:36: warning: '__pyx_v_ok' may be used uninitialized in this function [-Wmaybe-uninitialized]
     return b ? __Pyx_NewRef(Py_True) : __Pyx_NewRef(Py_False);
                                      ^
  pymatgen/util/coord_cython.c:4566:7: note: '__pyx_v_ok' was declared here
     int __pyx_v_ok;
         ^
  pymatgen/util/coord_cython.c: In function '__pyx_pf_8pymatgen_4util_12coord_cython_4coord_list_mapping_pbc.isra.35':
  pymatgen/util/coord_cython.c:5494:6: warning: '__pyx_v_ok_outer' may be used uninitialized in this function [-Wmaybe-uninitialized]
     if (unlikely(__pyx_t_21)) {
        ^
  pymatgen/util/coord_cython.c: In function '__pyx_pf_8pymatgen_4util_12coord_cython_pbc_shortest_vectors.isra.37':
  pymatgen/util/coord_cython.c:3102:7: warning: '__pyx_v_bestk' may be used uninitialized in this function [-Wmaybe-uninitialized]
     int __pyx_v_bestk;
         ^
  gcc -bundle -undefined dynamic_lookup -L//anaconda3/lib -arch x86_64 -L//anaconda3/lib -arch x86_64 -arch x86_64 build/temp.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util/coord_cython.o -o build/lib.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/util/coord_cython.cpython-37m-darwin.so
  building 'pymatgen.optimization.neighbors' extension
  gcc -Wno-unused-result -Wsign-compare -Wunreachable-code -DNDEBUG -g -fwrapv -O3 -Wall -Wstrict-prototypes -I//anaconda3/include -arch x86_64 -I//anaconda3/include -arch x86_64 -I//anaconda3/include/python3.7m -I//anaconda3/lib/python3.7/site-packages/numpy/core/include -c pymatgen/optimization/neighbors.cpp -o build/temp.macosx-10.7-x86_64-3.7/pymatgen/optimization/neighbors.o -Wno-cpp -Wno-unused-function -O2 -march=native -std=c++0x -stdlib=libc++
  gcc: error: unrecognized command line option '-stdlib=libc++'
  error: command 'gcc' failed with exit status 1
  ----------------------------------------
  ERROR: Failed building wheel for pymatgen
  Running setup.py clean for pymatgen
shyuep commented 4 years ago

Please use conda install. The instructions are on pymatgen.org.